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Dtwd1-KO 基因敲除小鼠

Dtwd1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Dtwd1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-12982

品系全称

C57BL/6JCya-Dtwd1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-69185-Dtwd1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Dtwd1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-12982) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
DTW domain containing 1
基因别称
1810033A06Rik
染色体号
Chr 2 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_026981.2 | Ensembl: ENSMUST00000170908
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~4
敲除长度
~5.4 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
DTWD1，也称为双特异性磷酸酶和tRNA修饰酶1，是一种在多种生物过程中发挥重要作用的基因。它编码的蛋白质具有双重功能：一方面，它是一种双特异性磷酸酶，能够去磷酸化蛋白质底物；另一方面，它参与了tRNA的修饰过程，影响tRNA的稳定性和功能。tRNA的修饰对于蛋白质合成和细胞功能至关重要，因此DTWD1在维持细胞代谢和生长方面发挥着关键作用。

在肿瘤发生发展过程中，DTWD1的表达和功能发生了显著变化。研究表明，在胃癌细胞系和胃癌组织中，DTWD1的表达水平显著下调。进一步研究发现，HDAC3通过破坏p53与DTWD1启动子的相互作用，下调了DTWD1的表达。由于p53是一种重要的肿瘤抑制因子，其靶基因DTWD1的下调可能导致肿瘤的发生发展[1]。

此外，DTWD1还在tRNA的修饰过程中发挥着重要作用。研究表明，DTWD1和其同源基因DTWD2参与了tRNA中3-(3-氨基-3-羧基丙基)尿苷(acp3U)的形成。acp3U是一种高度保守的修饰，存在于tRNA的变异环和D环中。acp3U的存在可以提高tRNA的热稳定性，并影响tRNA的功能。DTWD1和DTWD2的缺失会导致细胞生长迟缓，表明acp3U在哺乳动物中具有重要的生理功能[2]。

除了在肿瘤和tRNA修饰中的作用外，DTWD1还与中枢神经系统功能密切相关。研究发现，在慢性皮质酮暴露的大鼠中，miR-218-5p的表达水平升高，而miR-218-5p的靶基因之一就是DTWD1。miR-218-5p的过表达可能通过调节DTWD1的表达，影响中枢神经系统的基因表达和功能，从而参与慢性应激相关疾病的发生发展[3]。

此外，DTWD1的表达还与黑色素瘤的预后相关。研究发现，在黑色素细胞中，HIF1α能够调节DTWD1的表达。HIF1α是低氧条件下细胞适应的重要转录因子，其靶基因的表达水平与黑色素瘤患者的预后相关。DTWD1作为HIF1α的靶基因，其表达水平与黑色素瘤的预后密切相关[4]。

除了在肿瘤和神经系统疾病中的作用外，DTWD1还与膀胱癌的预后相关。研究发现，肿瘤间质比例(TSR)是膀胱癌的重要预后指标。机器学习方法可以准确量化TSR，并发现DTWD1的表达与TSR显著相关。这表明DTWD1可能参与了膀胱癌的发生发展和预后[5]。

此外，DTWD1还与双相情感障碍的预后相关。研究发现，COPS2基因的启动子区域与双相情感障碍的预后相关。COPS2基因的启动子区域包含一个CTCF结合位点，该位点与microRNA4716和EID1、SHC4、DTWD1等基因相邻。这些基因与神经元的分化和功能密切相关，因此DTWD1可能通过调节这些基因的表达，影响双相情感障碍的预后[6]。

除了在肿瘤和神经系统疾病中的作用外，DTWD1还与抑郁症的治疗相关。研究发现，DTWD1的表达与抗抑郁药的不良反应相关。这表明DTWD1可能参与了抗抑郁药的代谢过程，影响抗抑郁药的治疗效果和不良反应[7]。

此外，DTWD1还与慢性阻塞性肺病(COPD)的发生发展相关。研究发现，DTWD1的表达与COPD的易感性相关。这表明DTWD1可能参与了COPD的发生发展过程[8]。

除了在肿瘤和慢性疾病中的作用外，DTWD1还与肾细胞癌的转移相关。研究发现，肾细胞癌组织中存在一种促转移的B细胞亚群，该亚群可以根据其基因表达谱进一步分为MARCH3、B2M和DTWD1三个亚群。这些亚群的基因表达与肾细胞癌的转移和预后密切相关[9]。

综上所述，DTWD1是一种功能多样的基因，在多种生物学过程中发挥着重要作用。它参与了肿瘤的发生发展、tRNA的修饰、中枢神经系统功能、慢性疾病的发生发展、药物代谢等多个方面。深入研究DTWD1的功能和作用机制，有助于揭示多种疾病的发病机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Ma, Yanning, Yue, Yongfang, Pan, Min, Wang, Xian, Jin, Hongchuan. 2015. Histone deacetylase 3 inhibits new tumor suppressor gene DTWD1 in gastric cancer. In American journal of cancer research, 5, 663-73. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25973305/
2. Takakura, Mayuko, Ishiguro, Kensuke, Akichika, Shinichiro, Miyauchi, Kenjyo, Suzuki, Tsutomu. 2019. Biogenesis and functions of aminocarboxypropyluridine in tRNA. In Nature communications, 10, 5542. doi:10.1038/s41467-019-13525-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31804502/
3. Yoshino, Yuta, Roy, Bhaskar, Dwivedi, Yogesh. 2022. Corticosterone-mediated regulation and functions of miR-218-5p in rat brain. In Scientific reports, 12, 194. doi:10.1038/s41598-021-03863-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34996981/
4. Loftus, Stacie K, Baxter, Laura L, Cronin, Julia C, Fufa, Temesgen D, Pavan, William J. 2017. Hypoxia-induced HIF1α targets in melanocytes reveal a molecular profile associated with poor melanoma prognosis. In Pigment cell & melanoma research, 30, 339-352. doi:10.1111/pcmr.12579. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28168807/
5. Zheng, Qingyuan, Jiang, Zhengyu, Ni, Xinmiao, Chen, Zhiyuan, Liu, Xiuheng. 2023. Machine Learning Quantified Tumor-Stroma Ratio Is an Independent Prognosticator in Muscle-Invasive Bladder Cancer. In International journal of molecular sciences, 24, . doi:10.3390/ijms24032746. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36769068/
6. Budde, Monika, Friedrichs, Stefanie, Alliey-Rodriguez, Ney, Schulze, Thomas G, Malzahn, Dörthe. 2018. Efficient region-based test strategy uncovers genetic risk factors for functional outcome in bipolar disorder. In European neuropsychopharmacology : the journal of the European College of Neuropsychopharmacology, 29, 156-170. doi:10.1016/j.euroneuro.2018.10.005. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30503783/
7. Clark, S L, Adkins, D E, Aberg, K, Souza, R P, van den Oord, E J C G. 2011. Pharmacogenomic study of side-effects for antidepressant treatment options in STAR*D. In Psychological medicine, 42, 1151-62. doi:10.1017/S003329171100239X. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22041458/
8. Lin, Wei-De, Liao, Wen-Ling, Chen, Wei-Cheng, Chen, Yu-Chia, Tsai, Fuu-Jen. 2024. Genome-wide association study identifies novel susceptible loci and evaluation of polygenic risk score for chronic obstructive pulmonary disease in a Taiwanese population. In BMC genomics, 25, 607. doi:10.1186/s12864-024-10526-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38886662/
9. Yang, Fafen, Zhao, Jingjie, Luo, Xiuzhuang, Song, Jian, Meng, Lingzhang. 2021. Transcriptome Profiling Reveals B-Lineage Cells Contribute to the Poor Prognosis and Metastasis of Clear Cell Renal Cell Carcinoma. In Frontiers in oncology, 11, 731896. doi:10.3389/fonc.2021.731896. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34485161/

资料下载

S-KO-12982_6J_69185_Dtwd1_Exon 2~4_strategy.pdf
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