Lzic-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Lzic-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-12967

品系全称

C57BL/6JCya-Lzicem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-69151-Lzic-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Lzic-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-12967) were purchased from Cyagen.
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性别
基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
leucine zipper and CTNNBIP1 domain containing
基因别称
1810030J04Rik
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_026963.6 | Ensembl: ENSMUST00000030842
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~7
敲除长度
~8080 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Lzic,全称为Leucine zipper and ICAT domain containing,是一个编码包含亮氨酸拉链结构域和ICAT同源结构域的190个氨基酸多肽的新基因。Lzic基因位于人类染色体1p36.32-pter区域,由至少8个外显子组成。该基因在正常人类组织中几乎普遍表达,包括主要的5.2-kb LZIC mRNA和次要的2.1-kb、1.6-kb和1.0-kb LZIC mRNA。Lzic在所有检查的癌细胞系中都有表达,在胃癌细胞系MKN74和5例原发性胃癌病例中显著上调[1]。

Lzic基因与ICAT基因有38%的氨基酸同源性,ICAT是β-catenin和TCF转录因子相互作用的一个抑制因子。由于ICAT可能是一个肿瘤抑制基因,具有潜在地负调节WNT-β-catenin-TCF信号通路的特性,Lzic基因可能也具有相似的功能。在胃癌中Lzic的过表达可能是因为一个负反馈机制,以抑制WNT-β-catenin-TCF信号通路[1]。

在斑马鱼中,Lzic基因在早期发育过程中普遍表达,后来在发育中的大脑中富集。使用反义morpholino寡核苷酸,研究显示斑马鱼Lzic对特定神经元群体的存活至关重要。尽管Lzic与ICAT密切相关,并且与ICAT的β-catenin结合残基高度保守,但Lzic在体外或体内并不与β-catenin相互作用。这些结果表明,Lzic是一个在脊椎动物中保守的蛋白质,对斑马鱼神经元存活至关重要[2]。

Lzic的敲除细胞系在离子辐射(IR)处理后显示出G2/M细胞周期检查点的失调。Lzic缺乏的细胞能够在IR处理后有效地激活G1和早期G2/M检查点,但在晚期G2/M检查点维持失败。这一缺陷发生在PIKK信号下游。Lzic KO细胞表现出严重的非整倍性,表明基因组不稳定性。此外,癌症患者数据库的分析发现,Lzic表达水平与多种癌症的不良预后有很强的相关性。这些发现表明,Lzic在细胞对IR的响应中起功能性作用,其表达水平可能作为临床癌症实践中患者分层的重要生物标志物[3]。

α-辐射诱导的大鼠骨肉瘤(OS)的全基因表达谱显示,与正常成骨细胞(OB)相比,肿瘤中有72个基因的表达显著差异。这些基因包括细胞粘附、分化、发育过程、肿瘤抑制功能、Src酪氨酸激酶信号通路和Wnt/β-catenin信号通路相关的基因。值得注意的是,所有在Wnt/β-catenin信号通路中确定的基因都是该通路的已知或推测的负调节因子,在肿瘤中下调,这表明辐射诱导的OS中β-catenin的激活。通过免疫组化和免疫印迹分析,肿瘤中Wnt/β-catenin信号通路的组成性激活得到证实,观察到β-catenin的核和/或细胞质定位及其非活性(磷酸化)形式的减少。此外,肿瘤中GSK-3β蛋白水平相对于OB显著降低。这些发现提供了关于辐射诱导OS分子基础的新见解[4]。

在有利生物学特征的神经母细胞瘤肿瘤中,RERE、PIK3CD、LZIC、PGD和PEX14的基因表达水平显著降低,而SLC2A5升高。在比较1p缺失的所有阶段的肿瘤与1p完整的肿瘤时,在基因水平上发现了显著的差异。在不利或1p缺失的肿瘤中,几个表达降低的基因可能有助于肿瘤的发展。也有可能1p上的低表达基因的组合,而不是单一的经典的肿瘤抑制基因,导致了与神经母细胞瘤中1p缺失相关的不良结果[5]。

为了确定Schnyder结晶性角膜营养不良(SCCD)的遗传基础,研究人员在受影响的个体中对15个基因进行了突变筛查。没有在受影响的个体中发现假定致病的突变。在8个候选基因中发现了17个已报道的单核苷酸多态性(SNPs)。在GPR157、MGC4399和H6PD中发现了新的SNPs。没有在15个候选基因中发现致病突变[6]。

在淋巴结转移的胰腺癌组织中,LZIC、FXR、SCAMP1和SULT1E1的表达显著高于无淋巴结转移的胰腺癌组织。SCAMP1过表达与胰腺癌患者的淋巴结转移相关。SCAMP1的siRNA介导的下调导致MIA-PaCa2、PANC-1、TGBC-1和TGBC-2细胞迁移和侵袭显著减少,但对增殖无影响。此外,SCAMP1下调抑制了SCAMP1 siRNA转染细胞的条件培养基中的VEGF水平。这些结果表明,SCAMP1的下调可能是胰腺和胆囊癌患者的潜在治疗靶点[7]。

在肝细胞癌(HCC)中,LINC00668及其共表达的蛋白质编码基因(PCGs)与肿瘤的启动、进展和预后相关。LINC00668和其前10个PCGs被选来评估其诊断和预后价值。分子机制被探索以确定LINC00668及其PCGs参与的代谢过程。预后相关的临床因素和PCGs被用于构建预测HCC预后的列线图。连接图被构建以确定HCC的候选靶向药物。前10个PCGs是:嘧啶受体P2Y4(P2RY4)、信号肽酶复合物亚基2(SPCS2)、家族与序列相似性86成员C1(FAM86C1)、tudor结构域包含5(TDRD5)、铁蛋白轻链(FTL)、层粘连蛋白(SFN)、核仁复合体相关2同源(NOC2L)、过氧化氢酶1(PRDX1)、癌症/睾丸抗原2 CTAG2和亮氨酸拉链和CTNNBIP1结构域包含(LZIC)。FAM86C1、CTAG2和SFN对HCC有显著的诊断价值(总曲线下面积≥0.7,P≤0.05);LINC00668、FAM86C1、TDRD5、FTL和SFN对HCC有显著的预后价值(所有P≤0.05)。分子机制调查表明,LINC00668影响细胞分裂、细胞周期、有丝分裂核分裂和药物代谢细胞色素P450(所有P≤0.05)。连接图确定了7种治疗HCC的候选靶向药物。这些发现表明,LINC00668可能是一种癌基因,其过表达表明HCC的预后不良。FAM86C1、CTAG2和SFN对HCC有诊断意义,而FAM86C1、TDRD5、FTL和SFN对HCC有预后意义[8]。

从海绵Suberites domuncula中分离并鉴定了几个与Wnt通路相关的基因,包括Sd-TCF/LEF、Sd-GSK3、一个新发现的具有Wnt调节因子作用的分子(Sd-LZIC)、小Rho GTPases Sd-RhoA、Sd-Cdc42及其效应物Sd-mrlc。还报道了从另一种海绵物种(Lubomirskia baicalensis)中分离的分泌Frizzled相关蛋白sFRP。这些结果表明,Lzic在Wnt信号通路中具有保守的作用[9]。

在Wilms瘤中,通过杂合性缺失(LOH)分析,确定了1号染色体短臂上的最小丢失区域。225个Wilms瘤和4个肾恶性横纹肌肉瘤以及90个肾透明细胞癌(CCSK)接受了LOH分析。225个Wilms瘤和4个CCSK在该区域表现出LOH。在15/16个肿瘤中发现了一个位于D1S2694和D1S244之间、跨度为3.23 Mb的最小丢失区域。该区域与神经母细胞瘤中的丢失区域重叠,并包含候选基因,这些基因在胎儿肾脏中高度表达,即LZIC、ICAT和DNB5。对这三个基因进行变性HPLC和定量RT-PCR分析,发现无论是保留杂合性的WT样品(8个病例)还是显示1p LOH的WT样品(8个病例),都没有发现异常。需要进一步的研究来确定该区域内假定的肿瘤抑制基因[10]。

综上所述,Lzic基因是一个在多种生物学过程中发挥重要作用的基因,包括细胞周期调节、神经元存活、肿瘤抑制和发育过程。Lzic基因在多种癌症中的表达失调,表明其在肿瘤发生和发展中的潜在作用。进一步研究Lzic基因的功能和机制,有助于深入理解其生物学功能和在疾病发生中的作用,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Katoh, M. . Molecular cloning and characterization of LZIC, a novel gene encoding ICAT homologous protein with leucine zipper domain. In International journal of molecular medicine, 8, 611-5. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11712074/
2. Clements, Wilson K, Kimelman, David. . LZIC regulates neuronal survival during zebrafish development. In Developmental biology, 283, 322-34. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15932753/
3. Skalka, George, Hall, Holly, Somers, Joanna, Willis, Anne, Malewicz, Michal. 2019. Leucine zipper and ICAT domain containing (LZIC) protein regulates cell cycle transitions in response to ionizing radiation. In Cell cycle (Georgetown, Tex.), 18, 963-975. doi:10.1080/15384101.2019.1601476. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30973299/
4. Daino, Kazuhiro, Ugolin, Nicolas, Altmeyer-Morel, Sandrine, Guilly, Marie-Noëlle, Chevillard, Sylvie. . Gene expression profiling of alpha-radiation-induced rat osteosarcomas: identification of dysregulated genes involved in radiation-induced tumorigenesis of bone. In International journal of cancer, 125, 612-20. doi:10.1002/ijc.24392. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19444910/
5. Fransson, Susanne, Martinsson, Tommy, Ejeskär, Katarina. . Neuroblastoma tumors with favorable and unfavorable outcomes: Significant differences in mRNA expression of genes mapped at 1p36.2. In Genes, chromosomes & cancer, 46, 45-52. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17044048/
6. Aldave, Anthony J, Rayner, Sylvia A, Principe, Alexandre H, Katsev, Douglas, Yellore, Vivek S. 2005. Analysis of fifteen positional candidate genes for Schnyder crystalline corneal dystrophy. In Molecular vision, 11, 713-6. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16163269/
7. Yang, Sera, Lee, Kyu Taek, Lee, Jin Young, Lee, Kwang Hyuck, Rhee, Jong Chul. 2013. Inhibition of SCAMP1 suppresses cell migration and invasion in human pancreatic and gallbladder cancer cells. In Tumour biology : the journal of the International Society for Oncodevelopmental Biology and Medicine, 34, 2731-9. doi:10.1007/s13277-013-0825-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23653380/
8. Wang, Xiangkun, Zhou, Xin, Liu, Junqi, Ye, Xinping, Peng, Tao. 2019. Genome‑wide investigation of the clinical implications and molecular mechanism of long noncoding RNA LINC00668 and protein‑coding genes in hepatocellular carcinoma. In International journal of oncology, 55, 860-878. doi:10.3892/ijo.2019.4858. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31432149/
9. Adell, Teresa, Thakur, Archana N, Müller, Werner E G. 2007. Isolation and characterization of Wnt pathway-related genes from Porifera. In Cell biology international, 31, 939-49. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17470402/
10. Tamimi, Yahya, Ziebart, Kay, Desaulniers, Nancy, Dietrich, Kevin, Grundy, Paul. . Identification of a minimal region of loss on the short arm of chromosome 1 in Wilms tumor. In Genes, chromosomes & cancer, 46, 327-35. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17243164/