Mrps18a-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Mrps18a-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-12759

品系全称

C57BL/6JCya-Mrps18aem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-68565-Mrps18a-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Mrps18a-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-12759) were purchased from Cyagen.
交付类型
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性别
基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
mitochondrial ribosomal protein S18A
基因别称
1110004O20Rik
染色体号
Chr 17 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_026768.3 | Ensembl: ENSMUST00000024763
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~5
敲除长度
~7773 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Mrps18a,即线粒体核糖体蛋白S18a,是哺乳动物线粒体核糖体蛋白基因家族中的一员。线粒体核糖体蛋白(MRPs)是维持线粒体核糖体结构完整性和功能的关键组成部分。哺乳动物的线粒体核糖体在进化过程中获得了新的Mrp基因,以弥补核糖体RNA的缺失。到目前为止,已经在哺乳动物中发现了80多个MRPs。研究显示,Mrp基因在整个早期胚胎发生过程中持续表达,且在组织中的表达具有低特异性。这些蛋白质的氨基酸序列分析表明,这一组蛋白质之间几乎没有或没有蛋白质相似性。最近的研究表明,大多数Mrp基因是必需的,其缺失会导致早期胚胎死亡,这表明该组基因之间没有功能冗余。这些结果表明,Mrp基因不是一个从单一祖先基因衍生而来的基因家族,而且每个MRP都在线粒体核糖体复合体中发挥着独特且必需的作用。由于线粒体核糖体对于细胞和生物体的生存至关重要,因此这种缺乏功能冗余的现象令人惊讶。此外,这些数据表明,Mrp基因的基因组变异可能是早期妊娠丢失的原因,应作为临床评估[1]。

在子宫肉瘤的基因组特征方面,通过RNA测序进行的综合基因组分析表明,子宫肉瘤(USs)具有独特的基因融合特征。例如,在子宫内膜间质肉瘤(ESS)和子宫平滑肌肉瘤(uLMS)中,MRPS18A-PDC-AS1基因融合位点可能是一种潜在的病理学鉴别诊断标记。此外,在ESS和uLMS组中,分别发现了797个和477个子宫肉瘤差异表达基因(uDEGs),这些基因富集在多个通路中。研究表明,15个基因,包括LAMB4,在USs中具有预后价值;免疫浸润分析揭示了骨髓树突状细胞、浆细胞样树突状细胞、自然杀伤细胞、巨噬细胞M1、单核细胞和造血干细胞的预后价值;名为Max-Mean Non-Local multi-instance learning(MMN-MIL)的深度学习模型在预测US患者的生存方面表现出良好的性能,其曲线下面积达到0.909,准确率达到0.804。USs在HGESS、LGESS和uLMS之间具有独特的基因融合特征和基因表达特征。MMN-MIL模型可以有效地预测US患者的生存[2]。

在胆管癌(CCA)的分子标志物方面,加权基因共表达网络分析(WGCNA)揭示了与临床特征相关的模块和基因。研究发现,基因MRPS18A、CST1和SCP2是候选基因,这些基因与CCA患者的临床特征(包括病理阶段、组织学等级和肝功能)相关,并影响CCA患者的总生存率。此外,19个中心基因与CCA的进展和预后相关。生存分析发现,多个基因可以作为一种生物标志物,将CCA患者分为低风险和高风险组。这些候选基因可能参与CCA的进展,可以作为新的预后标志物和治疗靶点。此外,其中大多数基因在CCA中首次报道,值得进一步研究[3]。

在结直肠癌的生物标志物方面,一项I/Ib期研究发现,在维持错配修复(pMMR)的难治性结直肠癌患者中,regorafenib/nivolumab显示出适度的但持久的抗肿瘤活性。研究发现,基线临床和病理特征、血液和肿瘤样本与临床结果相关。在持续疾病控制组中,观察到23个基因的上调,包括CAPN9、NAPSA和ROS1;而MRPS18A、MAIP1和CMTR2等10个基因的上调与PFS的统计学显著改善相关。这项研究表明,预处理白蛋白、MIP-1β、非肝转移性疾病和调节性T细胞(Treg)浸润可能是regorafenib/nivolumab在pMMR结直肠癌中的潜在预测生物标志物。需要进一步的研究来证实这些发现[4]。

在神经元分化方面,一项研究发现,来自小鼠胚胎干细胞(ES细胞)的神经元分化过程中,在晚期分化阶段,Mrps18a的表达受到hChr21基因剂量效应的影响。这表明,Mrps18a在神经元发育和分化过程中发挥重要作用,并且与神经病理学异常和神经退行性疾病的发生有关[5]。

综上所述,Mrps18a作为一种线粒体核糖体蛋白,在线粒体核糖体复合体中发挥着独特且必需的作用。此外,Mrps18a在多种疾病中发挥重要作用,包括子宫肉瘤、胆管癌和结直肠癌。研究还发现,Mrps18a在神经元分化过程中发挥重要作用。这些研究有助于深入理解Mrps18a在生物学功能和疾病发生机制中的作用,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Cheong, Agnes, Lingutla, Ranjana, Mager, Jesse. 2020. Expression analysis of mammalian mitochondrial ribosomal protein genes. In Gene expression patterns : GEP, 38, 119147. doi:10.1016/j.gep.2020.119147. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32987154/
2. Song, Yaolin, Li, Guangqi, Zhang, Zhenqi, Tai, Zaixian, Xing, Xiaoming. 2024. Integrated Transcriptomic Landscape and Deep Learning Based Survival Prediction in Uterine Sarcomas. In Cancer research and treatment, 57, 250-266. doi:10.4143/crt.2024.343. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38993092/
3. Tian, Aiping, Pu, Ke, Li, Boxuan, Gao, Liping, Mao, Xiaorong. 2019. Weighted gene coexpression network analysis reveals hub genes involved in cholangiocarcinoma progression and prognosis. In Hepatology research : the official journal of the Japan Society of Hepatology, 49, 1195-1206. doi:10.1111/hepr.13386. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31177590/
4. Kim, Dae Won, Kim, Young-Chul, Kovari, Bence P, Imanirad, Iman, Kim, Richard D. 2024. Biomarker Analysis from a Phase I/Ib Study of Regorafenib and Nivolumab in Mismatch Repair-Proficient Advanced Refractory Colorectal Cancer. In Cancers, 16, . doi:10.3390/cancers16030556. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38339307/
5. Wang, Chi Chiu, Kadota, Mitsutaka, Nishigaki, Ryuichi, Ikeo, Kazuho, Oshimura, Mitsuo. . Molecular hierarchy in neurons differentiated from mouse ES cells containing a single human chromosome 21. In Biochemical and biophysical research communications, 314, 335-50. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14733910/