Mpnd-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Mpnd-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-12578

品系全称

C57BL/6JCya-Mpndem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-68047-Mpnd-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Mpnd-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-12578) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
MPN domain containing
基因别称
E130307M08Rik
染色体号
Chr 17 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_026530.5 | Ensembl: ENSMUST00000149441
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~4
敲除长度
~835 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MPND(Mpr1/Pad1 N-terminal domain-containing protein)是一种含有Mpr1/Pad1 N端(MPN)结构域的蛋白质,在真核生物中,MPND可能识别DNA的N6-甲基腺嘌呤(6mA)修饰。DNA的6mA修饰是一种在细菌、噬菌体和真核生物中普遍存在的表观遗传修饰。研究发现,MPND是一种传感器蛋白,它能够直接与组蛋白结合,并且其DNA和两个酸性区域协同增强与组蛋白的相互作用。这些发现揭示了MPND与核小体相互作用的分子机制,为基因控制和转录调控的研究奠定了基础[1]。

在深海细菌Marinactinospora thermotolerans中,MPND(MpnD)是一种prenyltransferase,它在甲基pendolmycin和pendolmycin的生物合成中起着关键作用。MpnD能够将一个C5prenyl单元以反式方式转移到Trp衍生的天然产物的C-7位置上,这是首次发现的酶[2]。

在胃癌的研究中,MPND基因被发现是一个新的融合基因,位于19q13.3-13.4区域。通过对一个晚期胃癌病例的全基因组测序和转录组测序分析,发现27个突变基因,其中19个基因在COSMIC数据库中有报道,8个基因在胃癌中尚未描述。此外,MPND基因在胃癌的发生和腹膜转移中发挥着重要作用[3]。

在DNA的N6-甲基腺嘌呤(6mA)传感网络中,MPND是一种6mA传感器,它能够去除组蛋白H2A(H2A-K119Ub)上的单泛素化,从而保持基因组范围内的H2A-K119Ub水平。Mettl4甲基转移酶和Alkbh4二氧合酶分别催化6mA的沉积和去除,而6mA在基因元件中的积累与转录沉默相对应。Mettl4的失活会导致6mA的减少,并引起子代的亚致死性和颅面畸形。这些发现揭示了一个本地的、对抗性的6mA网络结构,该结构能够保持Polycomb沉默[4]。

在胃癌的预后预测研究中,MPND基因被发现是七个基因签名模型的一部分,该模型可以有效地将胃癌样本分为高风险和低风险组。生存分析显示,高风险组和低风险组在训练集和验证集中表现出显著不同的预后结果。MPND基因的功能与PI3K-Akt信号通路和血小板衍生生长因子受体(PDGFR)的过度活跃有关[5]。

综上所述,MPND是一种重要的蛋白质,它参与DNA的6mA修饰识别、组蛋白结合、抗生素生物合成、胃癌的发生和腹膜转移以及预后预测。MPND的研究有助于深入理解DNA的6mA修饰的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[1-5]。

参考文献:
1. Yang, Meiting, Li, Xiaorong, Tian, Zizi, Wu, Wei, Chen, Zhongzhou. 2023. Structures of MPND Reveal the Molecular Recognition of Nucleosomes. In International journal of molecular sciences, 24, . doi:10.3390/ijms24043368. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36834777/
2. Ma, Junying, Zuo, Dianguang, Song, Yongxiang, Zhang, Changsheng, Ju, Jianhua. 2012. Characterization of a single gene cluster responsible for methylpendolmycin and pendolmycin biosynthesis in the deep sea bacterium Marinactinospora thermotolerans. In Chembiochem : a European journal of chemical biology, 13, 547-52. doi:10.1002/cbic.201100700. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22362652/
3. Zhang, J, Huang, J Y, Chen, Y N, Zhu, Z G, Yu, Y Y. 2015. Whole genome and transcriptome sequencing of matched primary and peritoneal metastatic gastric carcinoma. In Scientific reports, 5, 13750. doi:10.1038/srep13750. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26330360/
4. Kweon, Soo-Mi, Chen, Yibu, Moon, Eugene, Klimasauskas, Saulius, Feldman, Douglas E. 2019. An Adversarial DNA N6-Methyladenine-Sensor Network Preserves Polycomb Silencing. In Molecular cell, 74, 1138-1147.e6. doi:10.1016/j.molcel.2019.03.018. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30982744/
5. Meng, Changyuan, Xia, Shusen, He, Yi, Zhang, Guangjun, Zhou, Tong. 2020. Discovery of Prognostic Signature Genes for Overall Survival Prediction in Gastric Cancer. In Computational and mathematical methods in medicine, 2020, 5479279. doi:10.1155/2020/5479279. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32908579/