Atp1b4-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Atp1b4-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-12460

品系全称

C57BL/6JCya-Atp1b4em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-67821-Atp1b4-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Atp1b4-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-12460) were purchased from Cyagen.
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ATPase Na+/K+ transporting, beta 4 polypeptide
基因别称
1110020B02Rik
染色体号
Chr X (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_133690.3 | Ensembl: ENSMUST00000016471
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~4
敲除长度
~4605 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
ATP1B4,也称为BetaM,是一种在脊椎动物中广泛存在的基因。在低等脊椎动物中,BetaM蛋白是Na,K-ATPase的β亚基,参与细胞膜上的离子泵功能。然而,在胎盘哺乳动物中,BetaM蛋白的功能发生了显著变化。通过基因共选择,BetaM蛋白失去了其原始的离子泵功能,并获得了新的功能,成为骨骼和心肌细胞核内膜上的特异性蛋白,并在晚期胎儿和早期新生儿发育期间高度表达。BetaM蛋白通过与转录共调节因子SKI-interacting protein (SKIP)的直接相互作用,参与了基因表达的调控[1]。研究发现,BetaM蛋白可以独立于SKIP刺激肌肉调节因子MyoD的表达。BetaM蛋白结合到MyoD的远端调控区域(DRR),促进与转录激活相关的表观遗传变化,并招募SWI/SNF染色质重塑复合物的亚单位BRG1。这些结果表明,胎盘哺乳动物中的BetaM蛋白通过促进染色质结构的变化来调节肌肉基因的表达。BetaM蛋白在肌肉发育和功能中发挥着重要作用,其新的进化功能可能对胎盘哺乳动物具有非常重要的意义[1]。

除了在肌肉发育中的作用外,BetaM蛋白还与多种疾病相关。例如,在帕金森病(PD)的研究中发现,ATP1B4基因的突变与Kufor-Rakeb综合征相关,这是一种罕见的常染色体隐性遗传的青少年帕金森病。然而,在中国汉族帕金森病患者中的遗传分析表明,ATP1B4基因的突变与PD的发生没有显著关联[2]。

此外,BetaM蛋白的相互作用网络在胎盘哺乳动物中也发生了进化。研究发现,BetaM蛋白与多种蛋白质相互作用,包括核膜相关蛋白LAP-1和Syne1,转录因子LZIP/CREB3,以及血红素氧化酶HMOX1和HMOX2等。这些相互作用表明,BetaM蛋白在基因表达调控中发挥着重要的作用[3]。

BetaM蛋白的结构特征也发生了进化。研究发现,BetaM蛋白的N端结构域发生了结构改变,从而使其能够作为核膜蛋白存在。此外,BetaM蛋白的氨基酸序列也发生了变化,使其能够与转录因子SKIP相互作用,从而调节基因表达[4]。

在进化过程中,BetaM蛋白的功能发生了显著变化,从离子泵的β亚基转变为肌肉特异性蛋白,并在基因表达调控中发挥着重要作用。BetaM蛋白的这些新的进化功能可能对胎盘哺乳动物具有非常重要的意义,并为其提供了进化优势。

BetaM蛋白还与其他生物学过程相关。例如,研究发现,BetaM蛋白的表达在羊的毛囊发育中起着重要作用。BetaM蛋白与FGF12和TCONS_00279168等基因的表达相关,这些基因参与了PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路和Ras信号通路,这些信号通路与毛囊的生长和发育相关[5]。

此外,BetaM蛋白的表达还与心房颤动(AF)的发生相关。研究发现,BetaM蛋白的表达在AF患者中显著上调,并与AF的发生风险相关[6]。

综上所述,BetaM蛋白在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括肌肉发育、基因表达调控、毛囊发育和心房颤动等。BetaM蛋白的进化功能和生物学作用的研究有助于深入理解基因共选择和蛋白质功能变化的机制,并为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Ahmad, Nisar, de la Serna, Ivana L, Marathe, Himangi G, Pestov, Nikolay B, Modyanov, Nikolai N. 2023. Eutherian-Specific Functions of BetaM Acquired through Atp1b4 Gene Co-Option in the Regulation of MyoD Expression. In Life (Basel, Switzerland), 13, . doi:10.3390/life13020414. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36836771/
2. Gao, Kai, Song, Zhi, Liang, Hui, Zhao, Yongxiang, Deng, Hao. 2014. Genetic analysis of the ATP1B4 gene in Chinese Han patients with Parkinson's disease. In Molecular biology reports, 41, 2307-11. doi:10.1007/s11033-014-3084-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24420862/
3. Korneenko, Tatyana V, Pestov, Nikolay B, Ahmad, Nisar, Shakhparonov, Mikhail I, Modyanov, Nikolai N. 2016. Evolutionary diversification of the BetaM interactome acquired through co-option of the ATP1B4 gene in placental mammals. In Scientific reports, 6, 22395. doi:10.1038/srep22395. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26939788/
4. Pestov, Nikolay B, Zhao, Hao, Basrur, Venkatesha, Modyanov, Nikolai N. 2011. Isolation and characterization of BetaM protein encoded by ATP1B4--a unique member of the Na,K-ATPase β-subunit gene family. In Biochemical and biophysical research communications, 412, 543-8. doi:10.1016/j.bbrc.2011.07.112. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21855530/
5. Lv, Xiaoyang, Chen, Weihao, Sun, Wei, Wang, Shanhe, Wang, Jinyu. 2020. Analysis of lncRNAs Expression Profiles in Hair Follicle of Hu Sheep Lambskin. In Animals : an open access journal from MDPI, 10, . doi:10.3390/ani10061035. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32549352/
6. Zhang, Junguo, Huang, Xin, Wang, Xiaojie, Ye, Zebing, Li, Guowei. 2020. Identification of potential crucial genes in atrial fibrillation: a bioinformatic analysis. In BMC medical genomics, 13, 104. doi:10.1186/s12920-020-00754-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32682418/