智鼠故事 
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Zmym4-KO 基因敲除小鼠
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基本信息
基因研究概述
质控标准
基因
基因全称
zinc finger, MYM-type 4
基因别称
6330503C17Rik，CDIR，D630001M21，MYM，Zfp262，Znf262，mKIAA0425
染色体号
Chr 4 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_001114399 | Ensembl: ENSMUST00000106108
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~5
敲除长度
~3.0 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1915035Mice homozygous for a knock-out allele exhibit complete preweaning lethality.
Zmym4，也称为锌指MYM结构域包含蛋白4，是一种锌指蛋白，参与调节多种生物学过程。Zmym4具有MYM结构域，这是一种在真核生物中高度保守的结构域，通常与蛋白质之间的相互作用有关。此外，Zmym4还包含锌指结构域，这是一种常见的DNA结合结构域，参与基因表达的调控。
在胚胎发育过程中，Zmym4对于早期颅面部基因表达和颅面部软骨形成起着重要作用。研究表明，Zmym4的敲低会导致早期颅面部基因表达的改变，包括在神经边缘、神经板、神经嵴和前原基外胚层表达的基因。Zmym4的过表达对神经边缘或神经板基因的表达影响较小，但会改变神经嵴和前原基基因的表达。在幼虫阶段，Zmym4的敲低会导致耳囊和鳃弓中基因的表达降低。尽管没有检测到神经嵴迁移到鳃弓的缺陷，但Zmym4的缺失会导致多个颅面部软骨的异常形态[1]。
Zmym4在癌症中也发挥着重要作用。研究发现，在胃癌和结肠癌中，Zmym4基因的表达和突变存在异常。在微卫星不稳定的胃癌和结肠癌中，Zmym4的移码突变和表达缺失较为常见。这些结果表明，Zmym4的异常可能与微卫星不稳定的胃癌和结肠癌的发生发展有关[2]。
此外，Zmym4的变异还与严重的儿童肥胖相关。研究表明，Zmym4基因中的非常罕见的预测有害变异在肥胖病例中过量积累。在细胞中，核PHIP（pleckstrin同源结构域相互作用蛋白）直接增强促阿片黑素皮质素原（POMC）的转录，POMC是一种抑制食欲的神经肽。肥胖相关的PHIP变异抑制了POMC的转录。这项研究揭示了PHIP在人类能量稳态中的重要作用，通过转录调节中枢黑素皮质素信号，对肥胖和发育迟缓的患者具有潜在的诊断和治疗效果[3]。
在肝细胞癌（HCC）中，基因拷贝数改变（CNAs）对疾病的发生发展具有重要意义。研究发现，chr1q和chr8p是基因组扩增和缺失的热点区域。在扩增基因中，YY1AP1（chr1q22）的拷贝数改变与基因表达的相关性最高。在缺失基因中，CHMP7（chr8p21.3）的拷贝数改变与基因表达的相关性最高。这些基因的蛋白产物与其他细胞蛋白相互作用，参与多种功能。其中包括ASH1L、ZNF496、YY1、ZMYM4、CHMP4A、CHMP5、CHMP2A和CHMP3，其中一些是已知的癌症相关基因。这些发现表明，拷贝数改变在HCC的病理学中具有重要意义[4]。
Zmym4与超氧化物歧化酶3（SOD3）相关，参与调节罕见人类疾病中的反应性氧种和氧化应激。研究发现，Zmym4是SOD3相关基因之一，与多种罕见疾病相关，包括常染色体显性遗传性松弛症、遗传性肾小管发育不良、致死性动脉病综合征、EMILIN-1相关结缔组织疾病、Holt-Oram综合征、多系统平滑肌功能障碍综合征、远端遗传性运动神经病2型、先天性青光眼、膀胱扩张-微结肠-肠蠕动不足综合征、经典型埃勒斯-当洛斯综合征1型和视网膜母细胞瘤。这些研究结果表明，Zmym4在罕见人类疾病中具有潜在的治疗价值[5]。
Zmym4还与人类进化标记GNA13相关，参与精神分裂症的发生发展。研究发现，GNA13基因在精神分裂症中具有重要作用。GNA13基因的表达与精神分裂症的风险增加相关，并且在人类进化过程中经历了正选择。Zmym4是GNA13基因中与精神分裂症风险增加相关的核心基因之一。这些研究结果表明，Zmym4在精神分裂症的发生发展中具有重要作用[6]。
Zmym4与转录因子Six1的相互作用对于颅面部发育至关重要。研究发现，Six1基因的突变会导致颅面部出生缺陷。Zmym4作为Six1的候选相互作用蛋白，在颅面部发育中发挥重要作用。此外，Zmym4还与其他基因相互作用，参与调节多种生物学过程[7]。
Zmym4在肝细胞癌的早期诊断和治疗中具有潜在的应用价值。研究发现，Zmym4基因的表达和突变与肝细胞癌的发生发展密切相关。此外，Zmym4基因的表达与肝细胞癌的治疗效果相关。这些研究结果表明，Zmym4基因可以作为肝细胞癌的潜在诊断和治疗靶点[8]。
Zmym4与多种基因融合相关，参与乳腺癌的发生发展。研究发现，在乳腺癌细胞系ZR-75-30中，Zmym4基因与OPRD1基因发生融合。这种基因融合可能对乳腺癌的发生发展具有重要意义[9]。
综上所述，Zmym4是一种重要的锌指蛋白，参与调节多种生物学过程，包括颅面部发育、癌症发生发展、罕见人类疾病和神经发育。Zmym4在多种疾病中发挥重要作用，包括胃癌、结肠癌、肝细胞癌和乳腺癌。此外，Zmym4还与超氧化物歧化酶3（SOD3）相关，参与调节罕见人类疾病中的反应性氧种和氧化应激。Zmym4的研究有助于深入理解其在疾病发生发展中的作用机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[10]。
参考文献：
1. Jourdeuil, Karyn, Neilson, Karen M, Cousin, Helene, Alfandari, Dominique, Moody, Sally A. 2023. Zmym4 is required for early cranial gene expression and craniofacial cartilage formation. In Frontiers in cell and developmental biology, 11, 1274788. doi:10.3389/fcell.2023.1274788. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37854072/
2. Moon, Seong Won, Son, Hyun Ji, Chae, Jeesoo, An, Chang Hyeok, Lee, Sug Hyung. . Expression and Mutation Alterations of ZMYM4 Gene in Gastric and Colonic Cancers. In Applied immunohistochemistry & molecular morphology : AIMM, 29, 570-575. doi:10.1097/PAI.0000000000000939. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33938481/
3. Marenne, Gaëlle, Hendricks, Audrey E, Perdikari, Aliki, Farooqi, I Sadaf, Barroso, Inês. . Exome Sequencing Identifies Genes and Gene Sets Contributing to Severe Childhood Obesity, Linking PHIP Variants to Repressed POMC Transcription. In Cell metabolism, 31, 1107-1119.e12. doi:10.1016/j.cmet.2020.05.007. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32492392/
4. Shahrisa, Arman, Tahmasebi-Birgani, Maryam, Ansari, Hossein, Carloni, Vinicio, Mohammadi Asl, Javad. 2021. The pattern of gene copy number alteration (CNAs) in hepatocellular carcinoma: an in silico analysis. In Molecular cytogenetics, 14, 33. doi:10.1186/s13039-021-00553-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34215297/
5. Stanworth, Mark, Zhang, Shu-Dong. 2024. Elucidating the roles of SOD3 correlated genes and reactive oxygen species in rare human diseases using a bioinformatic-ontology approach. In PloS one, 19, e0313139. doi:10.1371/journal.pone.0313139. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39480826/
6. Xiang, Bo, Yang, Juanjuan, Zhang, Jin, Chen, Jing, Liu, Kezhi. 2019. The role of genes affected by human evolution marker GNA13 in schizophrenia. In Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry, 98, 109764. doi:10.1016/j.pnpbp.2019.109764. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31676466/
7. Kojima, Kenji K, Jurka, Jerzy. 2011. Crypton transposons: identification of new diverse families and ancient domestication events. In Mobile DNA, 2, 12. doi:10.1186/1759-8753-2-12. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22011512/
8. Neal, Scott J, Rajasekaran, Anindita, Jusić, Nisveta, Pignoni, Francesca, Moody, Sally A. 2023. Using Xenopus to discover new candidate genes involved in BOR and other congenital hearing loss syndromes. In Journal of experimental zoology. Part B, Molecular and developmental evolution, 342, 212-240. doi:10.1002/jez.b.23222. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37830236/
9. Yu, Yan-Ping, Liu, Silvia, Geller, David, Luo, Jian-Hua. 2024. Serum Fusion Transcripts to Assess the Risk of Hepatocellular Carcinoma and the Impact of Cancer Treatment through Machine Learning. In The American journal of pathology, 194, 1262-1271. doi:10.1016/j.ajpath.2024.02.017. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38537933/
10. Schulte, Ina, Batty, Elizabeth M, Pole, Jessica C M, Howarth, Karen D, Edwards, Paul A W. 2012. Structural analysis of the genome of breast cancer cell line ZR-75-30 identifies twelve expressed fusion genes. In BMC genomics, 13, 719. doi:10.1186/1471-2164-13-719. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23260012/
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