Faap20-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Faap20-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-12319

品系全称

C57BL/6JCya-Faap20em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-67513-Faap20-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Faap20-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-12319) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
Fanconi anemia core complex associated protein 20
基因别称
2610002J02Rik
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001190445.1 | Ensembl: ENSMUST00000178473
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~4
敲除长度
~6204 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1914763Homozygous null mice show seminiferous tubule and ovarian follicle degeneration, small litter sizes, and increased sensitivity to DNA crosslinkers.
FAAP20,即Fanconi anemia-associated protein 20,是一种在Fanconi anemia(FA)途径中发挥关键作用的蛋白质。FA是一种遗传性疾病,其特征是染色体不稳定性、骨髓衰竭和癌症易感性增加。FA途径是一种多步骤的DNA修复过程,主要针对DNA链间交联(ICLs)进行修复。ICLs是一种DNA损伤形式,可以阻止DNA复制和转录,导致细胞死亡或突变。FA途径中的蛋白质协同工作,以识别和修复ICLs,从而维持基因组稳定性。

FAAP20是FA核心复合物的一个组成部分,该复合物由8个FA蛋白和2个FA相关蛋白(FAAP24和FAAP100)组成。FA核心复合物具有泛素连接酶活性,负责FANCI-FANCD2(ID)复合物的单泛素化,这是激活FA途径的必要步骤。ID复合物的单泛素化引发一系列生化事件,允许加工和去除交联DNA,从而促进DNA损伤后的细胞存活。FAAP20在FA核心复合物的稳定性和功能完整性中发挥着重要作用。研究表明,缺乏FAAP20的细胞表现出FA细胞的特征,包括对DNA交联剂的敏感性增加、染色体异常和FANCD2单泛素化减少。因此,FAAP20是FA途径中一个重要的参与者,其功能丧失会导致DNA损伤修复缺陷和基因组不稳定性。

除了在FA途径中的作用,FAAP20还参与其他生物学过程。例如,研究发现,FAAP20在氧化应激条件下对DNA损伤反应的调节中发挥作用。氧化应激是一种细胞损伤形式,由活性氧(ROS)的产生引起。ROS可以导致DNA损伤,包括ICLs和氧化损伤。研究表明,ROS可以显著诱导全局mRNA N6-甲基腺苷(m6A)水平,通过调节RNA脱甲基酶ALKBH5的翻译后修饰(PTMs),导致参与各种生物学过程的数千个基因的快速和高效诱导,包括DNA损伤修复。机制上,ROS通过激活ERK/JNK信号通路促进ALKBH5的SUMO化,导致ALKBH5 m6A脱甲基酶活性抑制,从而阻止底物可及性。此外,ROS在体内小鼠的造血干细胞/祖细胞(HSPCs)中激活ERK/JNK/ALKBH5-PTMs/m6A轴,表明该分子途径在HSPCs中维持基因组稳定性方面具有生理作用。因此,FAAP20在调节ROS诱导的DNA损伤反应中发挥重要作用,有助于保护细胞基因组完整性[1]。

此外,FAAP20的缺失与南极冰鱼的基因缺失有关。南极冰鱼是一种生活在南大洋低温环境下的白血鱼,没有血红蛋白基因。为了补偿氧运输效率低下,冰鱼具有一些独特的特征,例如心脏增大、血液量增加和血细胞比容密度降低,从而增强溶解氧的量和血液流速。研究发现,冰鱼中FAAP20基因的缺失,可能与其低血细胞比容有关。虽然FAAP20基因区域在Notothenioids中是保守的,但在一些冰鱼物种中只存在FAAP20的遗迹。此外,还观察到SOAT1基因的缺失,SOAT1在胆固醇代谢中发挥重要作用,为冰鱼独特的线粒体形式提供了线索。FAAP20的缺失可能在理解南极冰鱼与氧供应相关的基因组特征方面提供线索[2]。

在人类癌症中,FAAP20的突变与DNA损伤反应/FA信号通路相关。研究发现,不同类型的人类癌症具有与DDR/FA信号通路相关的不同类型的体细胞突变基因,每种癌症类型都有独特的潜在驱动突变。例如,在泛癌样本中,ATM是分析中31个基因中最常突变的基因(5%),具有最多的潜在驱动突变(1714),其次是BRCA2(4%具有970个潜在驱动突变)。然而,这种模式并不适用于所有特定的癌症类型。例如,FANCT是乳腺癌(14%)和肝癌(4%)中最常突变的基因。此外,由于这些突变导致的DDR/FA信号通路改变在前列腺癌的一个亚型中超过70%,每种癌症亚型都表现出独特的基因改变频率。此外,这些基因改变模式对患者的生存期和疾病无进展期有显著影响。因此,FAAP20在人类癌症的DNA损伤反应/FA信号通路中发挥重要作用[3]。

综上所述,FAAP20是一种在Fanconi anemia途径中发挥关键作用的蛋白质,参与调节DNA损伤修复和基因组稳定性。FAAP20在氧化应激条件下对DNA损伤反应的调节中发挥作用,有助于保护细胞基因组完整性。此外,FAAP20的缺失与南极冰鱼的基因缺失有关,可能与其低血细胞比容有关。在人类癌症中,FAAP20的突变与DNA损伤反应/FA信号通路相关,对患者的生存期和疾病无进展期有显著影响。因此,FAAP20的研究对于深入理解DNA损伤修复和基因组稳定性的机制具有重要意义,并为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Yu, Fang, Wei, Jiangbo, Cui, Xiaolong, He, Chuan, Qian, Zhijian. . Post-translational modification of RNA m6A demethylase ALKBH5 regulates ROS-induced DNA damage response. In Nucleic acids research, 49, 5779-5797. doi:10.1093/nar/gkab415. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34048572/
2. Shin, Seung Chul, Kim, Sanghee, Kim, Han-Woo, Lee, Jun Hyuck, Kim, Jin-Hyoung. 2024. Gene loss in Antarctic icefish: evolutionary adaptations mimicking Fanconi Anemia? In BMC genomics, 25, 1102. doi:10.1186/s12864-024-11028-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39558275/
3. Rai, Sudhir Kumar, Du, Wei, Zhang, Jun, Deng, Youping, Fei, Peiwen. 2024. Somatic gene mutations involved in DNA damage response/Fanconi anemia signaling are tissue- and cell-type specific in human solid tumors. In Frontiers in medicine, 11, 1462810. doi:10.3389/fmed.2024.1462810. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39421870/