Eepd1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Eepd1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-12303

品系全称

C57BL/6JCya-Eepd1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-67484-Eepd1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Eepd1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-12303) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain containing 1
基因别称
2310005P05Rik
染色体号
Chr 9 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_026189.3 | Ensembl: ENSMUST00000040677
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~878 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
EEPD1,即Endonuclease/Exonuclease/Phosphatase Domain-1,是一种在生物体内发挥重要作用的基因。它编码的蛋白具有内切酶、外切酶和磷酸酶结构域,这些结构域赋予了EEPD1蛋白在DNA修复、细胞信号传导和胆固醇代谢等过程中的关键功能。

在DNA修复方面,EEPD1在维持基因组稳定性方面发挥着重要作用。研究表明,EEPD1能够促进DNA损伤修复过程中同源重组(HR)途径的启动。当复制叉受到压力而停滞时,EEPD1能够被招募到复制叉位置,并促进5'端的DNA切除,从而允许同源模板的3'单链入侵,并重新启动复制叉。此外,EEPD1还能够抑制非同源末端连接(NHEJ)和微同源末端连接(MMEJ)途径,减少基因组不稳定性[5]。在BRCA1突变的乳腺癌细胞中,EEPD1的缺失会导致合成致死性,表明EEPD1在HR修复途径中的重要性[6]。

在细胞信号传导方面,EEPD1与胆固醇代谢相关。研究发现,EEPD1是LXR(Liver X Receptors)的直接转录靶基因。LXR是一种核受体,在细胞胆固醇稳态中发挥重要作用。LXR被激活后,能够诱导胆固醇外排转运蛋白ABCA1和ABCG1的表达,从而促进细胞内胆固醇的外排。EEPD1通过控制ABCA1的水平和活性,进一步影响胆固醇的外排[4]。

在胆固醇代谢方面,EEPD1也发挥着重要作用。研究发现,EEPD1与ABCA1的表达水平呈正相关,而ABCA1是胆固醇外排的关键蛋白。EEPD1的缺失会导致ABCA1表达水平的降低,进而影响胆固醇的外排。此外,EEPD1还能够通过调节ABCA1/G1和LXRα信号通路,影响胆固醇的代谢[2]。

除了在DNA修复和胆固醇代谢方面的作用,EEPD1还与肿瘤的发生和进展相关。研究发现,EEPD1的表达水平与多种癌症的不良预后相关。在胃癌中,EEPD1的表达水平升高,与肿瘤的增殖、转移和侵袭相关[1]。此外,EEPD1还与结直肠癌的进展相关,其表达水平升高与肿瘤的增殖和转移相关[3]。EEPD1的表达水平还与肿瘤微环境中的免疫细胞浸润相关,影响免疫治疗的效果[3]。

综上所述,EEPD1是一种重要的基因,参与调控DNA修复、细胞信号传导和胆固醇代谢等过程。它在维持基因组稳定性、胆固醇代谢和肿瘤发生发展中发挥着重要作用。进一步研究EEPD1的功能和调控机制,有助于深入理解其在生物学过程中的作用,并为相关疾病的治疗提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Jin, Yong, Xia, Ying, Du, Hong, Li, Hongyu, Huang, Hai. 2023. Super-enhancer-associated EEPD1 facilitates EMT-mediated metastasis by regulating the PI3K/AKT/mTOR pathway in gastric cancer. In Biochemical and biophysical research communications, 689, 149188. doi:10.1016/j.bbrc.2023.149188. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37976838/
2. Lu, Xiaomei, Yang, Bin, Yang, Huijun, Lu, Xiangfeng, Gu, Dongfeng. 2021. MicroRNA-320b Modulates Cholesterol Efflux and Atherosclerosis. In Journal of atherosclerosis and thrombosis, 29, 200-220. doi:10.5551/jat.57125. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33536383/
3. Guo, Yang, Li, Shujin, Shi, Zhan, Tu, Shiliang, Yuan, Hang. 2024. EEPD1 is identified as a predictor of prognosis and immune microenvironment through pan-cancer analysis and related to progression of colorectal cancer. In Heliyon, 10, e29285. doi:10.1016/j.heliyon.2024.e29285. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38633650/
4. Nelson, Jessica Kristine, Koenis, Duco Steven, Scheij, Saskia, Baron, Silvere, Zelcer, Noam. 2017. EEPD1 Is a Novel LXR Target Gene in Macrophages Which Regulates ABCA1 Abundance and Cholesterol Efflux. In Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology, 37, 423-432. doi:10.1161/ATVBAHA.116.308434. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28082258/
5. Wu, Yuehan, Lee, Suk-Hee, Williamson, Elizabeth A, Nickoloff, Jac A, Hromas, Robert A. 2015. EEPD1 Rescues Stressed Replication Forks and Maintains Genome Stability by Promoting End Resection and Homologous Recombination Repair. In PLoS genetics, 11, e1005675. doi:10.1371/journal.pgen.1005675. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26684013/
6. Hromas, Robert, Kim, Hyun-Suk, Sidhu, Gurjit, Nickoloff, Jac A, Kong, Kimi Y. 2017. The endonuclease EEPD1 mediates synthetic lethality in RAD52-depleted BRCA1 mutant breast cancer cells. In Breast cancer research : BCR, 19, 122. doi:10.1186/s13058-017-0912-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29145865/