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Zcrb1-KO 基因敲除小鼠
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复苏/繁育服务
基本信息
基因研究概述
质控标准
基因
基因全称
zinc finger CCHC-type and RNA binding motif 1
基因别称
2700088M22Rik，Madp-1
染色体号
Chr 15 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_026025 | Ensembl: ENSMUST00000076070
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4~8
敲除长度
~5.5 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Zcrb1，全称为锌指CCHC型和RNA结合基序1，是一种重要的RNA结合蛋白。Zcrb1包含一个RNA结合基序和一个CCHC锌指结构域，这些结构域使其能够与RNA结合并参与RNA的加工和调控。Zcrb1在多种生物学过程中发挥作用，包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。
Zcrb1是U12型剪接体的重要组成部分，U12型剪接体负责处理0.5%的人类内含子。研究表明，Zcrb1在U12型剪接过程中发挥着核心作用，其表达水平的改变会影响U12型基因的剪接和表达。在人类细胞系中，Zcrb1表达的部分减少会导致U12型基因的剪接和表达失调，进而影响纤毛发生和WNT信号通路。此外，在斑马鱼胚胎中敲低Zcrb1的表达也会导致发育异常和WNT信号通路的激活，这与人类细胞的研究结果相一致。这些结果表明，Zcrb1在细胞和发育过程中发挥着重要的生物学作用，并在不同物种中保守存在[1]。
Zcrb1基因位于12q12染色体上，由8个外显子和7个内含子组成。Zcrb1蛋白是一种核蛋白，其在细胞核中定位，但不在核仁中。Zcrb1基因的表达受到多种因素的调控，如形态依赖性、热休克和肝癌等。在SH-SY5Y神经细胞中，Zcrb1基因的表达受到吗啡的刺激、30-36℃孵育的抑制和39℃孵育的上调。在斑马鱼中，Zcrb1基因在心脏和睾丸中的表达水平最高，在脑中的表达水平较低，在肝脏中的表达水平最低。这些结果表明，Zcrb1基因的表达具有组织特异性，并在不同生理和病理条件下发生调控[2]。
在头颈鳞状细胞癌（HNSCC）中，Zcrb1的表达水平与患者的预后风险相关。研究发现，Zcrb1的表达水平与HNSCC肿瘤的恶性程度和患者生存率相关。在HNSCC肿瘤中，Zcrb1的高表达与较高的风险评分相关，而风险评分可以作为一个独立的预后预测指标。此外，敲低Zcrb1的表达可以导致HNSCC细胞存活能力的显著降低，而Zcrb1的过表达则可以促进肿瘤细胞的增殖。这些结果表明，Zcrb1在HNSCC的发生发展中发挥着重要作用，并可能成为一个潜在的预后预测指标和治疗靶点[3]。
Zcrb1还与胶质母细胞瘤（GBM）的代谢特征有关。研究发现，Zcrb1的表达水平与GBM细胞的有氧糖酵解水平相关。Zcrb1的过表达可以抑制GBM细胞的有氧糖酵解和增殖，而敲低Zcrb1的表达则可以导致DNA损伤反应相关的剪接事件失调。此外，Zcrb1还可以通过促进circHEATR5B的形成来抑制GBM细胞的有氧糖酵解。circHEATR5B是一种circRNA，其编码的蛋白HEATR5B-881aa与JMJD5相互作用，并降低JMJD5的稳定性，进而影响GBM细胞的糖酵解和增殖。这些结果表明，Zcrb1在GBM的发生发展中发挥着重要作用，并可能成为一个潜在的预后预测指标和治疗靶点[4]。
Zcrb1的表达还受到遗传变异的影响。研究发现，Zcrb1的表达水平受到顺式eQTLs的调控，这些eQTLs与SARS-CoV-2感染易感性相关。这些结果表明，Zcrb1的表达水平可能受到遗传因素的影响，并影响个体对SARS-CoV-2的易感性和感染风险[5]。
Zcrb1还参与RNA剪接的调控。研究发现，一种名为bktRNA1的kink-turn RNA可以与Zcrb1相互作用，并影响U12型剪接体的组装和活性。bktRNA1可以引导甲基转移酶fibrillarin对U12 snRNA进行甲基化修饰，而bktRNA1的敲除会导致U12型剪接的失调。此外，bktRNA1还可以通过与其他RNA结合蛋白相互作用来调节局部内含子的剪接。这些结果表明，Zcrb1参与RNA剪接的调控，并通过与其他RNA结合蛋白的相互作用来影响基因表达[6]。
Zcrb1还与m6A RNA甲基化修饰相关。研究发现，Zcrb1的表达水平与m6A RNA甲基化修饰相关，并可能影响早期肺腺癌的预后。Zcrb1的表达水平与肺腺癌患者的预后风险相关，并可以作为一个独立的预后预测指标。此外，Zcrb1的表达水平还与其他m6A RNA甲基化修饰相关基因的表达水平相关。这些结果表明，Zcrb1在m6A RNA甲基化修饰中发挥作用，并可能影响肺腺癌的发生发展和预后[7]。
Zcrb1还与铜稳态和铜死亡相关。研究发现，Zcrb1的表达水平与肝细胞癌（HCC）的预后风险相关，并可以作为一个独立的预后预测指标。Zcrb1的表达水平与HCC患者的肿瘤微环境和治疗效果相关。此外，Zcrb1的表达水平还与其他与铜稳态和铜死亡相关的基因的表达水平相关。这些结果表明，Zcrb1在HCC的发生发展中发挥着重要作用，并可能成为一个潜在的预后预测指标和治疗靶点[8]。
Zcrb1还可以与冠状病毒RNA的5'-UTR区域结合，并促进病毒复制和转录。研究发现，Zcrb1可以与SARS-CoV的5'-UTR区域结合，并促进病毒的复制和转录。此外，Zcrb1还可以与IBV的5'-UTR区域结合，并促进IBV的复制和转录。这些结果表明，Zcrb1在冠状病毒的复制和转录中发挥着重要作用，并可能成为一个潜在的病毒感染的治疗靶点[9]。
综上所述，Zcrb1是一种重要的RNA结合蛋白，参与RNA的加工和调控，并在多种生物学过程中发挥作用。Zcrb1在细胞和发育过程中发挥着重要的生物学作用，并在不同物种中保守存在。Zcrb1的表达受到多种因素的调控，包括形态依赖性、热休克和肝癌等。Zcrb1在多种疾病中发挥重要作用，包括HNSCC、GBM、肺腺癌和HCC等。此外，Zcrb1还与m6A RNA甲基化修饰、铜稳态和铜死亡以及冠状病毒感染相关。Zcrb1的研究有助于深入理解RNA加工和调控的生物学功能和疾病发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。
参考文献：
1. Powell-Rodgers, Geralle, Pirzada, Mujeeb Ur Rehman, Richee, Jahmiera, Stratman, Amber N, Djuranovic, Sergej. 2024. Role of U11/U12 minor spliceosome gene ZCRB1 in Ciliogenesis and WNT Signaling. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2024.08.09.607392. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39149385/
2. Wang, Haoran, Gao, Mary X, Li, Linda, Hori, Naohiro, Sato, Kenzo. 2006. Isolation, expression, and characterization of the human ZCRB1 gene mapped to 12q12. In Genomics, 89, 59-69. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16959469/
3. Chen, Chaoqun, Huang, Fang, Li, Xiaojie, Qi, Yangfan, Wang, Yang. 2024. Identification of splicing factors signature predicting prognosis risk and the mechanistic roles of novel oncogenes in HNSCC. In Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease, 1870, 167115. doi:10.1016/j.bbadis.2024.167115. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38458543/
4. Song, Jian, Zheng, Jian, Liu, Xiaobai, Zhang, Mengyang, Liu, Yunhui. 2022. A novel protein encoded by ZCRB1-induced circHEATR5B suppresses aerobic glycolysis of GBM through phosphorylation of JMJD5. In Journal of experimental & clinical cancer research : CR, 41, 171. doi:10.1186/s13046-022-02374-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35538499/
5. Cotroneo, Chiara E, Mangano, Nunzia, Dragani, Tommaso A, Colombo, Francesca. 2021. Lung expression of genes putatively involved in SARS-CoV-2 infection is modulated in cis by germline variants. In European journal of human genetics : EJHG, 29, 1019-1026. doi:10.1038/s41431-021-00831-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33649539/
6. Li, Bin, Liu, Shurong, Zheng, Wujian, Qu, Lianghu, Yang, Jianhua. 2023. RIP-PEN-seq identifies a class of kink-turn RNAs as splicing regulators. In Nature biotechnology, 42, 119-131. doi:10.1038/s41587-023-01749-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37037902/
7. Guo, Bingzhou, Zhang, Hongliang, Wang, Jinliang, Jia, Xiaodong, Yin, Chengliang. 2021. Identification of the Signature Associated With m6A RNA Methylation Regulators and m6A-Related Genes and Construction of the Risk Score for Prognostication in Early-Stage Lung Adenocarcinoma. In Frontiers in genetics, 12, 656114. doi:10.3389/fgene.2021.656114. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34178026/
8. Ma, Yun-Long, Yang, Ya-Fei, Wang, Han-Chao, Wang, Dong-Xu, Li, Tao. 2023. A novel prognostic scoring model based on copper homeostasis and cuproptosis which indicates changes in tumor microenvironment and affects treatment response. In Frontiers in pharmacology, 14, 1101749. doi:10.3389/fphar.2023.1101749. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36909185/
9. Tan, Yong Wah, Hong, Wanjin, Liu, Ding Xiang. 2012. Binding of the 5'-untranslated region of coronavirus RNA to zinc finger CCHC-type and RNA-binding motif 1 enhances viral replication and transcription. In Nucleic acids research, 40, 5065-77. doi:10.1093/nar/gks165. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22362731/
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