Gid4-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Gid4-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-11905

品系全称

C57BL/6JCya-Gid4em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-66771-Gid4-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Gid4-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-11905) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
GID complex subunit 4, VID24 homolog
基因别称
4933439F18Rik
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025757 | Ensembl: ENSMUST00000070681
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~5
敲除长度
~8.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因Gid4是酵母菌Saccharomyces cerevisiae中GID泛素连接酶复合物的一个亚基,负责识别含有N端脯氨酸残基的底物,从而通过26S蛋白酶体或自噬途径促进蛋白质降解。Gid4的识别功能主要依赖于N端脯氨酸残基或第2位脯氨酸的存在,并需要特定的相邻序列基序。在葡萄糖缺乏的情况下,酵母菌会通过糖异生途径进行能量代谢,此时糖异生酶(如Fbp1、Icl1、Mdh2和Pck1)的表达和活性会增加。当葡萄糖重新加入培养基中时,糖异生酶的表达会被抑制,并通过Gid4依赖的Pro/N-degron途径被降解[1,2,3,4]。

研究发现,Gid4的表达受到转录和蛋白质水平的精确调控,以确保糖异生途径的适当调整。在葡萄糖存在的情况下,Gid4迅速出现在细胞中,触发糖异生酶的泛素化[2]。此外,Gid4的突变会导致酵母菌中苹果酸产量的增加,这是因为Gid4的缺失导致糖异生酶Mdh2的积累[4,8]。这表明Gid4在酵母菌的代谢调控中发挥着关键作用。

除了Gid4,酵母菌中还存在着另一种类似的蛋白质Gid10,它在正常生长条件下不表达,但在饥饿或渗透压应激条件下被诱导表达。Gid10与Gid4具有相似的序列和结构特征,但它们的底物特异性并不完全相同[1]。Gid10能够作为Pro/N-degron途径的特异性N-recognin,参与蛋白质降解过程[1,5]。此外,Gid10与Pro/N-degron的结合结构已被解析,揭示了其底物特异性的结构基础[5]。

除了在酵母菌中的作用,Gid4还在人类肿瘤的发生和发展中发挥着重要作用。研究发现,Gid4基因的突变与某些肿瘤的发生相关。例如,在骨肿瘤中,Gid4基因的突变与更高的端粒含量相关,这表明Gid4可能参与了端粒延长和肿瘤的发生过程[6]。此外,在骨肿瘤患者中,Gid4基因的突变也与某些基因融合事件的发生相关,这提示Gid4可能参与了骨肿瘤的代谢和生物学过程[7]。

综上所述,基因Gid4在酵母菌和人类中发挥着重要的生物学功能。在酵母菌中,Gid4参与调节糖异生途径和蛋白质降解过程,对细胞代谢和应激响应具有重要作用。在人类肿瘤中,Gid4基因的突变与肿瘤的发生和发展相关,提示Gid4可能参与了肿瘤的代谢和生物学过程。深入研究Gid4的功能和调控机制,有助于我们更好地理解细胞代谢和肿瘤发生的机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Melnykov, Artem, Chen, Shun-Jia, Varshavsky, Alexander. 2019. Gid10 as an alternative N-recognin of the Pro/N-degron pathway. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 116, 15914-15923. doi:10.1073/pnas.1908304116. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31337681/
2. Menssen, Ruth, Bui, Kim, Wolf, Dieter H. 2018. Regulation of the Gid ubiquitin ligase recognition subunit Gid4. In FEBS letters, 592, 3286-3294. doi:10.1002/1873-3468.13229. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30136317/
3. Oh, Jang-Hyun, Chen, Shun-Jia, Varshavsky, Alexander. 2017. A reference-based protein degradation assay without global translation inhibitors. In The Journal of biological chemistry, 292, 21457-21465. doi:10.1074/jbc.M117.814236. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29122887/
4. Negoro, Hiroaki, Kotaka, Atsushi, Ishida, Hiroki. . Mutation in gene coding for glucose-induced degradation-deficient protein contributes to high malate production in yeast strain No. 28 and No. 77 used for industrial brewing of sake. In Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 85, 1283-1289. doi:10.1093/bbb/zbab031. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33686405/
5. Shin, Jin Seok, Park, Si Hoon, Kim, Leehyeon, Heo, Jiwon, Song, Hyun Kyu. 2021. Crystal structure of yeast Gid10 in complex with Pro/N-degron. In Biochemical and biophysical research communications, 582, 86-92. doi:10.1016/j.bbrc.2021.10.007. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34695755/
6. Sharaf, Radwa, Jin, Dexter X, Grady, John, Thomas, David M, Montesion, Meagan. 2023. A pan-sarcoma landscape of telomeric content shows that alterations in RAD51B and GID4 are associated with higher telomeric content. In NPJ genomic medicine, 8, 26. doi:10.1038/s41525-023-00369-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37709802/
7. Xie, Xianbiao, Bian, Yiying, Li, Haomiao, Wang, Liwei, Shen, Jingnan. 2022. A Comprehensive Understanding of the Genomic Bone Tumor Landscape: A Multicenter Prospective Study. In Frontiers in oncology, 12, 835004. doi:10.3389/fonc.2022.835004. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35756627/
8. Negoro, Hiroaki, Matsumura, Kengo, Matsuda, Fumio, Hata, Yoji, Ishida, Hiroki. 2020. Effects of mutations of GID protein-coding genes on malate production and enzyme expression profiles in Saccharomyces cerevisiae. In Applied microbiology and biotechnology, 104, 4971-4983. doi:10.1007/s00253-020-10573-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32248437/