Trim13-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Trim13-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-11799

品系全称

C57BL/6JCya-Trim13em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-66597-Trim13-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Trim13-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-11799) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
tripartite motif-containing 13
基因别称
3110001L12Rik,CAR,LEU5,RNF77,Rfp2
染色体号
Chr 14 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001164220 | Ensembl: ENSMUST00000165015
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~2.2 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1913847Mice homozygous for a knock-out allele exhibit decreased lethality induced by EMCV infection and altered type I IFN production.
基因Trim13,也称为Tripartite motif 13,是一种重要的E3泛素连接酶,具有多个生物学功能。TRIM13蛋白包含一个RING结构域,负责E3泛素连接酶活性,以及一个B-box结构域和一个C3HC4锌指结构域,这些结构域与蛋白质之间的相互作用和信号传导有关。TRIM13在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞生长、凋亡、转录调节和肿瘤发生等。

在乳腺癌中,TRIM13的表达水平与患者的预后密切相关。一项生物信息学分析表明,TRIM13在乳腺癌组织中的表达水平低于正常组织,且与雌激素受体和孕激素受体状态呈正相关,与Scarff-Bloom-Richardson分级、Nottingham预后指数、淋巴结状态、基底样状态和三阴性状态呈负相关。此外,TRIM13表达水平与乳腺癌患者的无远处转移生存期、无复发生存期、疾病特异性生存期和转移性无复发生存期呈正相关[1]。

TRIM13还在动脉粥样硬化的发生发展中发挥重要作用。研究发现,TRIM13通过泛素化降解肝脏X受体α/β下调其靶基因ABCA1/G1的表达,从而抑制胆固醇外流。此外,TRIM13通过泛素化降解细胞因子信号抑制因子1/3(SOCS1/3)介导信号转导子和转录激活子1(STAT1)的激活、CD36的表达和泡沫细胞形成。TRIM13基因缺失可以挽救胆固醇外流并抑制泡沫细胞形成,从而防止饮食诱导的动脉粥样硬化。在人类冠状动脉狭窄病变中,TRIM13及其下游信号分子的表达水平与病变严重程度相关[2]。

TRIM13还在慢性阻塞性肺疾病(COPD)的发生发展中发挥重要作用。研究发现,TRIM13在COPD患者和肺气肿大鼠的肺组织中的表达水平显著降低。TRIM13基因过表达可以降低内质网应激相关分子的表达水平,并降低内质网自噬水平,从而减轻COPD中肺泡上皮细胞的损伤[3]。

TRIM13还参与调节免疫反应。研究发现,TRIM13通过其跨膜结构域与内质网定位的STING相互作用,并催化STING的Lys6连接的泛素化,导致STING的降解,从而抑制炎症反应。TRIM13缺陷可以增强病原性DNA触发的炎症因子产生,抑制DNA病毒复制,并导致年龄相关的自身炎症[4]。

TRIM13还参与调节I型干扰素(IFN)的产生。研究发现,TRIM13是MDA5介导的I型IFN产生的负性调节因子。TRIM13与MDA5相互作用,负性调节MDA5介导的I型IFN产生。TRIM13基因敲除小鼠在致命性脑心肌炎病毒(EMCV)感染后产生更多的I型IFN,并且存活时间更长[5]。

TRIM13还参与调节NF-κB信号通路。研究发现,TRIM13通过与NEMO相互作用并调节其泛素化和周转,从而抑制TNF诱导的NF-κB活化。TRIM13的表达抑制TNF诱导的NF-κB活化,而TRIM13的敲低则具有相反的效果。TRIM13的E3连接酶活性和内质网定位对于NF-κB的抑制至关重要,而TRIM13介导的自噬不是必需的。TRIM13介导的NF-κB抑制对于抑制细胞的克隆形成能力至关重要。这项研究首次证明了TRIM13作为内质网驻留的RING E3连接酶在NEMO泛素化、NF-κB信号通路负性调节和肿瘤抑制因子方面的作用[6]。

TRIM13还参与调节Toll样受体2(TLR2)介导的NF-κB活化。研究发现,TRIM13在巨噬细胞中被TLR2配体上调。TRIM13敲低可以减弱TLR2介导的细胞因子/趋化因子产生、泡沫细胞形成以及NF-κB活化。TRIM13与肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6)相互作用,并通过K29连接的泛素化链促进TRAF6的泛素化,从而增强NF-κB活性。这些结果表明,TRIM13是NF-κB活化的正性调节因子,并且K29连接的泛素化是一种特定的泛素连接模式,参与控制TLR2信号传导[7]。

TRIM13还参与调节肺癌的发生发展。研究发现,TRIM13在肺癌细胞中过表达,并抑制肺癌的进展。TRIM13与RPS27A相互作用,增加RPS27A的泛素化和降解。RPS27A过表达可以逆转TRIM13过表达对肺癌进展的抑制作用。此外,RPS27A过表达还可以逆转TRIM13过表达对NF-κB信号通路的抑制作用,从而进一步促进肺癌细胞系的增殖和转移[8]。

综上所述,基因Trim13在多种生物学过程中发挥重要作用,包括乳腺癌、动脉粥样硬化、慢性阻塞性肺疾病、免疫反应和肺癌等。TRIM13的表达水平与多种疾病的预后密切相关,并参与调节多种信号通路。TRIM13的研究有助于深入理解TRIM13在疾病发生发展中的作用机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Chen, Wei-Xian, Cheng, Lin, Xu, Ling-Yun, Qian, Qi, Zhu, Yu-Lan. 2019. Bioinformatics analysis of prognostic value of TRIM13 gene in breast cancer. In Bioscience reports, 39, . doi:10.1042/BSR20190285. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30837324/
2. Govatati, Suresh, Kumar, Raj, Boro, Monoranjan, Lusis, Aldons J, Rao, Gadiparthi N. 2024. TRIM13 reduces cholesterol efflux and increases oxidized LDL uptake leading to foam cell formation and atherosclerosis. In The Journal of biological chemistry, 300, 107224. doi:10.1016/j.jbc.2024.107224. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38537695/
3. Xiang, Yaling, Li, Chuntao, Wang, Zhiyuan, Zhou, Jinbiao, Zhang, Jianqing. 2024. TRIM13 Reduces Damage to Alveolar Epithelial Cells in COPD by Inhibiting Endoplasmic Reticulum Stress-Induced ER-Phagy. In Lung, 202, 821-830. doi:10.1007/s00408-024-00753-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39382594/
4. Li, Xuelian, Yu, Zhou, Fang, Qian, Wang, Jianli, Chen, Taoyong. 2022. The transmembrane endoplasmic reticulum-associated E3 ubiquitin ligase TRIM13 restrains the pathogenic-DNA-triggered inflammatory response. In Science advances, 8, eabh0496. doi:10.1126/sciadv.abh0496. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35080984/
5. Narayan, Kavitha, Waggoner, Lisa, Pham, Serena T, Fitzgerald, Katherine A, Kang, Joonsoo. 2014. TRIM13 is a negative regulator of MDA5-mediated type I interferon production. In Journal of virology, 88, 10748-57. doi:10.1128/JVI.02593-13. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25008915/
6. Tomar, Dhanendra, Singh, Rajesh. 2014. TRIM13 regulates ubiquitination and turnover of NEMO to suppress TNF induced NF-κB activation. In Cellular signalling, 26, 2606-13. doi:10.1016/j.cellsig.2014.08.008. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25152375/
7. Lai, Mingshuang, Liu, Meiliang, Li, Deyuan, Nan, Aruo, Zeng, Xiaoyun. 2023. circELMOD3 increases and stabilizes TRIM13 by sponging miR-6864-5p and direct binding to inhibit HCC progression. In iScience, 26, 107818. doi:10.1016/j.isci.2023.107818. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37752955/
8. Huang, Bin, Baek, Suk-Hwan. 2017. Trim13 Potentiates Toll-Like Receptor 2-Mediated Nuclear Factor κB Activation via K29-Linked Polyubiquitination of Tumor Necrosis Factor Receptor-Associated Factor 6. In Molecular pharmacology, 91, 307-316. doi:10.1124/mol.116.106716. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28087809/