Snrnp40-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Snrnp40-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-11791

品系全称

C57BL/6JCya-Snrnp40em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-66585-Snrnp40-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Snrnp40-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-11791) were purchased from Cyagen.
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
small nuclear ribonucleoprotein 40 (U5)
基因别称
0610009C03Rik,Prp8bp,Wdr57
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025645.2 | Ensembl: ENSMUST00000105994
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~2541 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1913835Mice homozygous for a knock-out allele show embryonic growth retardation, a small egg cylinder, disorganized extraembryonic tissue, failure to initiate gastrulation, and complete embryonic lethality by E9.5. Mice homozygous for a hypomorphic allelel exhibit reduced body weight, belly spotting, and immunodeficiency.
Snrnp40是一种编码剪接体U5小核核糖核蛋白(snRNP)复合物亚基的基因,这个亚基对于前体信使RNA(pre-mRNA)的剪接过程至关重要。剪接体是一种复杂的分子机器,负责将pre-mRNA中的内含子移除,并将外显子连接起来,形成成熟的mRNA分子。这个过程对于基因的正确表达至关重要,因为错误或异常的剪接会导致蛋白质功能的丧失或异常,从而引发各种疾病。

在多种疾病中,Snrnp40的功能和表达水平被发现与疾病的病理过程密切相关。例如,在一项研究中,研究者发现Snrnp40的杂合子突变导致小鼠出现免疫缺陷综合征,这些小鼠对小鼠巨细胞病毒的感染高度敏感,并表现出淋巴器官发育、稳定性和功能的多重缺陷。这些缺陷包括造血干细胞分化障碍,以及T细胞和EL4细胞系中数百种信使RNA剪接错误的增加,主要是内含子保留。此外,Snrnp40突变细胞中与免疫细胞功能相关的蛋白质表达也发生了改变[1]。这些发现表明,Snrnp40的缺陷可能通过影响多种mRNA分子的加工和关键免疫蛋白的表达水平,导致免疫系统的综合缺陷。

在癌症研究中,Snrnp40的表达水平也与肿瘤的侵袭性和转移能力有关。研究发现,乳腺癌中存在高度变异的亚群,这些亚群具有增强的转录组变异性和转移能力。通过单细胞RNA测序,研究者发现这些高度变异的亚群在剪接体基因集方面表现出高变异,而Snrnp40的表达水平与这些亚群的转移能力密切相关[2]。这些发现揭示了转录组变异性的产生是癌症亚群如何通过改变基因表达状态来适应不断变化的环境压力,从而提高其生存和转移能力的机制。

在遗传疾病和癌症中,U5 snRNP的成分也扮演着重要角色。例如,U5 snRNP中的PRPF6、PRPF8和SNRP200基因的突变与视网膜色素变性(RP)相关,而EFTUD2和TXNL4A的突变则与颅面畸形相关。此外,U5 snRNP蛋白的体细胞突变或表达水平的变化也与多种癌症相关[3]。这些发现表明,U5 snRNP的变异可能导致组织特异性疾病,但其背后的机制尚不清楚。

除了在免疫缺陷和癌症中的研究,Snrnp40还与其他疾病相关。例如,研究发现Snrnp40的基因变异与孕妇产前胎膜早破(PROM)有关。在一项研究中,研究者发现Snrnp40的变异与PROM的发生风险相关,这可能为PROM的预测和预防提供新的思路[4]。此外,Snrnp40的基因变异还与胰腺星状细胞(PSCs)的遗传改变有关,这些改变可能对肿瘤的侵袭性有影响[5]。

在多发性硬化症(MS)的研究中,Snrnp40的表达水平也被发现与疾病的发展有关。研究发现,MS患者外周血单核细胞中Snrnp40的表达水平显著上调,并且免疫调节治疗可以显著降低其表达水平[6]。这表明Snrnp40可能在MS的免疫病理过程中发挥重要作用。

在急性白血病的研究中,Snrnp40也被发现与疾病的预后相关。研究发现,Snrnp40的表达水平与急性髓细胞白血病(AML)的预后相关,并且是AML干细胞特性相关基因簇中的一员[7]。这表明Snrnp40可能是AML治疗的潜在靶点。

此外,Snrnp40还与其他基因相互作用,共同调控细胞增殖和肿瘤生长。例如,研究发现CINP是KLF5的协同因子,而KLF5可以促进细胞增殖、生存和肿瘤生长。Snrnp40是KLF5的潜在结合蛋白之一,其表达水平与KLF5的肿瘤促进功能密切相关[8]。

在东方沼虾(Macrobrachium nipponense)的性别分化研究中,Snrnp40的表达水平也受到了环境因素的影响。研究发现,Snrnp40的表达水平在受到不同温度和光照时间影响的睾丸中发生了变化,这表明Snrnp40可能参与了性别分化的过程[9]。

综上所述,Snrnp40是一种重要的剪接体U5 snRNP复合物亚基,参与调控pre-mRNA的剪接过程。Snrnp40的功能和表达水平与多种疾病的发生和发展密切相关,包括免疫缺陷、癌症、遗传疾病等。Snrnp40的研究有助于深入理解剪接体的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Zhang, Duanwu, Yue, Tao, Choi, Jin Huk, Moresco, Eva Marie Y, Beutler, Bruce. 2019. Syndromic immune disorder caused by a viable hypomorphic allele of spliceosome component Snrnp40. In Nature immunology, 20, 1322-1334. doi:10.1038/s41590-019-0464-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31427773/
2. Nguyen, Alexander, Yoshida, Mitsukuni, Goodarzi, Hani, Tavazoie, Sohail F. 2016. Highly variable cancer subpopulations that exhibit enhanced transcriptome variability and metastatic fitness. In Nature communications, 7, 11246. doi:10.1038/ncomms11246. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27138336/
3. Wood, Katherine A, Eadsforth, Megan A, Newman, William G, O'Keefe, Raymond T. 2021. The Role of the U5 snRNP in Genetic Disorders and Cancer. In Frontiers in genetics, 12, 636620. doi:10.3389/fgene.2021.636620. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33584830/
4. Kan, Hui, Liu, Haiyan, Mu, Yutong, Hu, Anqun, Zheng, Yingjie. 2023. Novel genetic variants linked to prelabor rupture of membranes among Chinese pregnant women. In Placenta, 137, 14-22. doi:10.1016/j.placenta.2023.04.007. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37054626/
5. Böker, Viktoria, Häußler, Johanna, Baumann, Jenny, Krohn, Knut, Kleeff, Jörg. 2022. Analysis of genomic alterations in cancer associated human pancreatic stellate cells. In Scientific reports, 12, 13532. doi:10.1038/s41598-022-17748-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35941161/
6. Derakhshani, Afshin, Safarpour, Hossein, Abdoli Shadbad, Mahdi, Baradaran, Behzad, Racanelli, Vito. 2021. The Role of Hemoglobin Subunit Delta in the Immunopathy of Multiple Sclerosis: Mitochondria Matters. In Frontiers in immunology, 12, 709173. doi:10.3389/fimmu.2021.709173. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34504491/
7. Zhang, Yitong, Liu, Dongzhe, Li, Fenglan, Zhang, Yutong, Li, Hui. 2021. Identification of biomarkers for acute leukemia via machine learning-based stemness index. In Gene, 804, 145903. doi:10.1016/j.gene.2021.145903. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34411647/
8. Wu, Qiao, Fu, Changying, Li, Menglin, Zhang, Baotong, Dong, Jin-Tang. 2018. CINP is a novel cofactor of KLF5 required for its role in the promotion of cell proliferation, survival and tumor growth. In International journal of cancer, 144, 582-594. doi:10.1002/ijc.31908. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30289973/
9. Jin, Shubo, Hu, Yuning, Fu, Hongtuo, Gong, Yongsheng, Wu, Yan. 2020. Analysis of testis metabolome and transcriptome from the oriental river prawn (Macrobrachium nipponense) in response to different temperatures and illumination times. In Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics, 34, 100662. doi:10.1016/j.cbd.2020.100662. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32114312/