Snw1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Snw1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-11665

品系全称

C57BL/6JCya-Snw1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-66354-Snw1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Snw1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-11665) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型
Notch信号通路

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
SNW domain containing 1
基因别称
2310008B08Rik,NCoA-62,SKIP,Skiip
染色体号
Chr 12 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025507.2 | Ensembl: ENSMUST00000021428
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~8
敲除长度
~9871 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
SNW1,也称为SNW domain containing 1,是一种核受体共激活因子,参与剪接和转录控制,包括雄激素受体信号通路。SNW1在多种生物学过程中发挥作用,包括炎症反应、细胞增殖、分化和发育。此外,SNW1还与多种疾病的发生发展密切相关,包括癌症、糖尿病和神经母细胞瘤等。

在胶质母细胞瘤(GBM)中,炎症性小胶质细胞亚型肿瘤相关小胶质细胞(TAM)中特异性基因整合素β2(ITGB2)的表达水平升高。机制上,小胶质细胞中ITGB2的激活促进了STAT3的SH2结构域与ITGB2的细胞质结构域之间的相互作用,从而刺激JAK1/STAT3/IL-6信号反馈,促进GBM细胞的间充质转变。此外,小胶质细胞通过小胶质细胞上受体ITGB2与GBM细胞上配体ICAM-1之间的相互作用与GBM细胞进行通讯,而炎症性细胞因子白血病抑制因子(LIF)的分泌增加则诱导了ICAM-1的分泌。进一步研究表明,抑制细胞周期蛋白依赖性激酶7(CDK7)可以显著减少SNW1向LIF超级增强子的募集,从而导致LIF的转录抑制。此外,研究人员还发现了一种新型LIF抑制剂——三七皂苷R1,它与替莫唑胺联合使用时表现出协同作用。这些研究揭示了GBM细胞与TAM的表观遗传介导相互作用驱动GBM的间充质转变,并为MES GBM患者提供了新的治疗途径[1]。

SNW1在前列腺癌中过表达,与不良预后相关。免疫组化分析显示,在前列腺癌组织中,SNW1的表达水平升高,且SNW1的强表达在TMPRSS2:ERG融合阳性的前列腺癌中更为常见。SNW1的表达与Gleason分级、分期、淋巴结状态和早期生化复发显著相关。多变量模型表明,SNW1上调的预后价值独立于已建立的术前组织病理学和临床参数。这些结果表明,SNW1过表达是前列腺癌的一个独立预后标志物,具有潜在的临床应用价值[2]。

在妊娠糖尿病(GDM)中,SNW1基因表达水平升高,与胰岛素抵抗和血糖升高相关。转录组学研究表明,SNW1是GDM中最敏感和特异的生物标志物,表达水平显著上调。代谢组学研究表明,GDM患者中糖异生增加,表现为丙氨酸水平降低和丙酮酸、葡萄糖水平升高。siRNA介导的SNW1敲低导致PANC1细胞中丙氨酸氨基转移酶(ALT/GPT)和胰岛素受体底物(IRS1)的表达下调,而葡萄糖转运蛋白(GLUT2/GLUT4)和胰岛素(INS)的表达上调。这些研究结果表明,SNW1是一种新型胰岛素抵抗基因,通过提高糖异生和降低葡萄糖摄取来诱导高血糖。SNW1可能被认为是GDM治疗的一个潜在靶点,具有临床应用价值[3]。

在神经母细胞瘤(NB)中,SNW1通过与重组信号结合蛋白J(RBPJ)相互作用来调节Notch信号通路。Notch信号通路是一种高度保守的信号通路,在细胞间通讯和多细胞生物体发育中发挥重要作用。RBPJ是Notch信号通路中的转录调节因子,当不与Notch蛋白结合时,RBPJ作为转录抑制因子发挥作用;当与Notch蛋白的细胞内结构域(NOTCH ICD)结合时,RBPJ激活Notch靶基因的转录。研究发现,SNW1与RBPJ相互作用,调节Notch靶基因的表达。此外,沉默RBPJ的表达可以防止SNW1介导的Notch基因表达。公共数据集和临床NB组织表明,RBPJ和SNW1在NB中表达上调,与不良患者预后相关。这些结果表明,SNW1通过相互作用调节RBPJ和Notch信号通路,是NB的一个潜在治疗靶点[4]。

SNW1是NF-κB信号通路的一个新型转录调节因子。NF-κB转录因子家族在协调控制炎症、免疫反应、细胞增殖和各种其他生物学过程的基因表达中发挥着核心作用。研究发现,SNW1是一个剪接因子和转录共激活因子,不调节NF-κB通路的细胞质成分,但在核中与NF-κB异源二聚体复合物结合,促进转录激活。SNW1在NF-κB激活时脱离其剪接复合物(与SNRNP200和SNRNP220形成),并与NF-κB的转录延伸伴侣p-TEFb结合。研究还表明,SNW1对于NF-κB靶基因(如IL-8和TNF基因)的转录延伸是必不可少的。这些结果表明,SNW1是一个独特的蛋白质,以前被认为参与剪接和转录,在这个案例中,其作用涉及与NF-κB-p-TEFb复合物结合,以促进某些NF-κB靶基因的转录延伸[5]。

在乳腺癌细胞中,SNW1与剪接体蛋白的相互作用促进细胞凋亡。RNA剪接是蛋白质合成的一个基本过程。研究发现,SNW1的耗竭导致乳腺癌细胞凋亡。蛋白质组学和生化分析表明,SNW1直接与剪接体成分(包括EFTUD2和SNRNP200)相关。SNW1的SKIP区域与EFTUD2的N端以及SNRNP200的C端的两个独立区域相互作用。与SNW1耗竭类似,EFTUD2的敲低增加了凋亡细胞的数量。此外,外源性表达SNW1的SKIP区域或EFTUD2的N端区域显著促进了细胞凋亡。这些结果表明,抑制SNW1或其相关蛋白可能是一种新型的癌症治疗方法[6]。

SNW1通过介导sororin和APC2前mRNA的剪接来促进姐妹染色单体凝集。尽管剪接对大多数真核基因的表达至关重要,但剪接因子的失活会导致有丝分裂的特异性缺陷。研究发现,剪接体亚基SNW1和PRPF8对人类细胞的姐妹染色单体凝集至关重要。转录组分析表明,SNW1或PRPF8的耗竭影响特定内含子剪接,包括编码姐妹染色单体凝集蛋白sororin和APC/C亚基APC2的前mRNA。SNW1的耗竭主要通过降低sororin水平导致凝集缺陷,这导致DNA上粘合素的去稳定。SNW1的耗竭还降低了APC/C活性,并通过延迟有丝分裂和导致“凝集疲劳”间接导致凝集缺陷。同时表达sororin和APC2的无内含子cDNA恢复了SNW1耗竭细胞的凝集。这些结果表明,剪接体对于有丝分裂是必要的,因为它可以表达对凝集至关重要的基因。转录组分析中发现的SNW1和PRPF8耗竭细胞中保留的内含子可能有助于理解与剪接缺陷相关的疾病(如视网膜色素变性症和癌症)的病因[7]。

SNW1是空间BMP活性、神经板边界形成和神经嵴谱系决定的临界调节因子。骨形态发生蛋白(BMP)梯度为细胞命运谱系决定提供位置信息,如将脊椎动物外胚层模式化为神经、神经嵴和表皮组织,精确的边界将这些区域隔开。然而,关于BMP活性在脊椎动物发育过程中如何时空调节以促进胚胎模式形成,特别是神经嵴形成,知之甚少。通过在非洲爪蟾中进行大规模的神经嵴谱系决定功能筛选,研究人员发现SNW1是BMP活性的一个关键调节因子。SNW1是一种核蛋白,已知可以调节基因表达。使用反义形态素在非洲爪蟾和斑马鱼胚胎中耗尽SNW1蛋白,结果表明,背侧表达的SNW1对神经嵴谱系决定至关重要,这与中胚层形成和原肠胚形成形态发生运动无关。通过利用非洲爪蟾胚胎中磷酸化Smad1的免疫染色和一种BMP依赖性报告转基因斑马鱼系,研究人员表明,SNW1在原肠胚后期调节神经板边界背侧BMP活性的特定区域。使用双重原位杂交和免疫荧光,研究人员展示了BMP活性的这一区域在神经嵴区域和SNW1表达区域的空间位置。进一步的体内和体外实验,包括细胞培养和组织提取物,使研究人员得出结论,SNW1在BMP受体上游发挥作用。最后,研究人员表明,SNW1对神经嵴谱系决定的需求是通过其调节BMP活性的能力来实现的,因为在非洲爪蟾SNW1形态素中靶向过表达BMP足以恢复神经嵴的形成。这些研究结果表明,通过其调节脊椎胚胎中BMP活性的特定区域的能力,SNW1是神经板边界形成和神经嵴谱系决定的一个关键调节因子[8]。

SNW1是一种核受体共激活因子,参与剪接和转录控制,包括雄激素受体信号通路。SNW1在多种生物学过程中发挥作用,包括炎症反应、细胞增殖、分化和发育。此外,SNW1还与多种疾病的发生发展密切相关,包括癌症、糖尿病和神经母细胞瘤等。在GBM中,SNW1通过调节LIF的表达促进GBM细胞的间充质转变。在前列腺癌中,SNW1过表达与不良预后相关。在GDM中,SNW1表达上调与胰岛素抵抗和血糖升高相关。在NB中,SNW1通过与RBPJ相互作用来调节Notch信号通路。SNW1是NF-κB信号通路的一个新型转录调节因子。在乳腺癌细胞中,SNW1与剪接体蛋白的相互作用促进细胞凋亡。SNW1通过介导sororin和APC2前mRNA的剪接来促进姐妹染色单体凝集。SNW1是空间BMP活性、神经板边界形成和神经嵴谱系决定的临界调节因子。SNW1的研究有助于深入理解其生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Xie, Han, Jiang, Yanyi, Xiang, Yufei, Tian, Dasheng, Bian, Erbao. . Super-enhancer-driven LIF promotes the mesenchymal transition in glioblastoma by activating ITGB2 signaling feedback in microglia. In Neuro-oncology, 26, 1438-1452. doi:10.1093/neuonc/noae065. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38554116/
2. Höflmayer, Doris, Willich, Carla, Hube-Magg, Claudia, Wilczak, Waldemar, Bernreuther, Christian. 2019. SNW1 is a prognostic biomarker in prostate cancer. In Diagnostic pathology, 14, 33. doi:10.1186/s13000-019-0810-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31043167/
3. Bhushan, Ravi, Trivedi, Rimjhim, Raj, Ritu, Kumar, Dinesh, Dubey, Pawan K. 2025. Integration of transcriptomics and metabolomics data revealed role of insulin resistant SNW1 gene in the pathophysiology of gestational diabetes. In Scientific reports, 15, 4159. doi:10.1038/s41598-025-88485-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39905161/
4. Hong, Mei, He, Jing, Li, Shiwang. 2019. SNW1 regulates Notch signaling in neuroblastoma through interacting with RBPJ. In Biochemical and biophysical research communications, 509, 869-876. doi:10.1016/j.bbrc.2019.01.036. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30642633/
5. Verma, Suneer, De Jesus, Paul, Chanda, Sumit K, Verma, Inder M. 2019. SNW1, a Novel Transcriptional Regulator of the NF-κB Pathway. In Molecular and cellular biology, 39, . doi:10.1128/MCB.00415-18. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30397075/
6. Sato, Naoki, Maeda, Masao, Sugiyama, Mai, Nagino, Masato, Senga, Takeshi. 2014. Inhibition of SNW1 association with spliceosomal proteins promotes apoptosis in breast cancer cells. In Cancer medicine, 4, 268-77. doi:10.1002/cam4.366. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25450007/
7. van der Lelij, Petra, Stocsits, Roman R, Ladurner, Rene, Ellenberg, Jan, Peters, Jan-Michael. 2014. SNW1 enables sister chromatid cohesion by mediating the splicing of sororin and APC2 pre-mRNAs. In The EMBO journal, 33, 2643-58. doi:10.15252/embj.201488202. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25257309/
8. Wu, Mary Y, Ramel, Marie-Christine, Howell, Michael, Hill, Caroline S. 2011. SNW1 is a critical regulator of spatial BMP activity, neural plate border formation, and neural crest specification in vertebrate embryos. In PLoS biology, 9, e1000593. doi:10.1371/journal.pbio.1000593. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21358802/