Tm4sf20-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Tm4sf20-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-11620

品系全称

C57BL/6JCya-Tm4sf20em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-66261-Tm4sf20-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Tm4sf20-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-11620) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
transmembrane 4 L six family member 20
基因别称
1810018L02Rik
染色体号
Chr 1 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025453.4 | Ensembl: ENSMUST00000027331
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~3825 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Tm4sf20,也称为Transmembrane 4 L6 family member 20,是一种编码跨膜蛋白的基因。跨膜蛋白是一类锚定在膜上的蛋白质,其拓扑结构对于其功能至关重要。这些特性使得某些跨膜蛋白可以通过调节的跨膜蛋白裂解(RIP)和调节的替代易位(RAT)来调节。RIP允许跨膜前体的蛋白片段在新的位置发挥作用,而RAT则通过改变跨膜蛋白在翻译过程中跨膜的易位方向来导致其拓扑结构的倒置。由site-1蛋白酶(S1P)和site-2蛋白酶(S2P)介导的RIP参与膜结合转录因子的蛋白水解激活。在静息细胞中,这些转录因子作为无活性的跨膜前体存在于内质网(ER)中。在ER内的信号刺激下,它们被转运到高尔基体。在那里,它们首先被S1P切割,然后被S2P切割,从而释放其N端结构域,使其能够进入细胞核并激活基因。这一信号通路调节脂质代谢、未折叠蛋白反应、细胞外基质蛋白的分泌和细胞增殖。值得注意的是,神经酰胺诱导的cAMP反应元件结合蛋白3样1(CREB3L1)的RIP也涉及RAT。在静息细胞中,TM4SF20通过RAT阻止了CREB3L1的RIP。神经酰胺通过RAT改变新合成的TM4SF20在膜中的方向,从而将TM4SF20从RIP的抑制剂转变为CREB3L1 RIP的激活剂[1]。

一项研究发现,在东南亚15个无亲缘关系的家庭中,2q36.3区域存在一个复杂的4kb缺失,与儿童早期语言障碍和脑白质高信号强度相关。这种缺失移除了TM4SF20基因的倒数第二个外显子3,该基因编码一个功能未知的跨膜蛋白。Minigene分析表明,缺失导致的净外显子丢失引入了一个提前的终止密码子,进而导致生成一个稳定的蛋白质,该蛋白质未能靶向质膜并积聚在细胞质中。此外,研究发现这种缺失在越南京族个体中富集,等位基因频率约为1%,嵌入在一个祖先单倍型中。这些数据表明,早期语言延迟和白质高信号强度表型是由TM4SF20截断的潜在毒性机制驱动的,并强调了了解和管理人群特异性低频致病等位基因的重要性[2]。

在巴基斯坦患有语言障碍的个体及其家族中,对TM4SF20、NFXL1、CNTNAP2和ATP2C2等候选基因进行了研究。研究发现,在这些SLI候选基因中,共有16个罕见变异体,包括8个在南非人群中MAF <0.5%的变异体。大多数鉴定的罕见变异体在受试者家族中聚集,一个罕见变异体(c.*9T>C在CNTNAP2中)在一个小家庭(PKSLI-64)中共同分离,另一个(c.2465C>T在ATP2C2中)在受试者分支(PKSLI-27)中共同分离。大多数鉴定出的罕见变异体缺乏完全共同分离,这表明尽管这些基因可能与LI的整体风险有关,但在该人群中LI可能还涉及其他基因。对具有高近亲婚配率的家族进行进一步研究有可能扩大我们对与语言习得和障碍相关的基因功能的理解[3]。

在先天性肝纤维化/常染色体隐性多囊肾病(CHF/ARPKD)的全转录组研究中,PCK大鼠肝脏样本的RNA-Seq分析显示,与年龄匹配的Sprague-Dawley(SD)大鼠相比,PCK大鼠在PND 30和90时过度表达的基因参与了细胞迁移(如Lamc2、Tgfb2和Plet1)、细胞粘附(如Spp1、Adgrg1和Cd44)和伤口愈合(如Plat、Celsr1和Tpm1)。与纤维化相关的两个基因,即结缔组织生长因子(Ctgf)和血小板衍生生长因子(Pdgfb),在PCK大鼠的所有时间点均上调。与MHC I类分子相关(如RT1-A2)或参与核糖体组装(如Pes1)的基因在PCK大鼠中显著下调。上游调节因子分析显示,组织生长相关蛋白(MTPN)、炎症相关蛋白(STAT家族成员)和染色质重塑相关蛋白(BRG1)被激活,而肝细胞分化相关蛋白(HNF4α)和抗纤维化基因表达相关蛋白(SMAD7)被抑制。在PND 30和90时,四个上调基因(Reg3b、Aoc1、Tm4sf20和Cdx2)的mRNA水平在蛋白质水平上通过免疫组化得到证实。这些研究结果表明,CHF/ARPKD的主要致病机制是炎症、细胞迁移和伤口愈合增加,以及肝功能抑制和抗纤维化基因表达减少的组合[4]。

转化生长因子β(TGF-β)是一种已知在伤口愈合和纤维化疾病中刺激胶原产生的细胞因子。研究发现,TGF-β诱导CREB3L1在人类A549细胞中的蛋白水解激活。这种激活是由于TM4SF20的表达受到抑制,而TM4SF20通常抑制CREB3L1的RIP。CREB3L1的裂解将其NH2端结构域从膜上释放出来,使其能够进入细胞核并与Smad4结合,激活编码蛋白质组装胶原蛋白的细胞外基质的基因。这些发现提出了抑制CREB3L1 RIP可能预防某些纤维化疾病中胶原蛋白过度沉积的可能性[5]。

在肺癌腺癌(LUAD)的预后模型研究中,基于淋巴结转移相关基因的预后模型构建,发现淋巴结转移相关基因RHOV、ABCC2和CYP4B1与LUAD的预后不良相关。该模型可能通过DNA复制、细胞周期、P53和其他信号通路影响LUAD的进展。在淋巴结转移组织中,TM4SF20的表达上调,提示其在LUAD进展中的潜在作用[6]。

综上所述,Tm4sf20编码的跨膜蛋白在多种生物学过程中发挥作用,包括信号转导、细胞迁移、细胞粘附、伤口愈合和基因表达调控。Tm4sf20的变异体与儿童早期语言障碍和脑白质高信号强度相关,并可能在特定人群中富集。此外,Tm4sf20的表达改变与先天性肝纤维化和LUAD的病理机制相关。因此,深入研究Tm4sf20的功能和作用机制对于理解相关疾病的发病机制和开发新的治疗方法具有重要意义。

参考文献:
1. Ye, Jin. 2020. Transcription factors activated through RIP (regulated intramembrane proteolysis) and RAT (regulated alternative translocation). In The Journal of biological chemistry, 295, 10271-10280. doi:10.1074/jbc.REV120.012669. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32487748/
2. Wiszniewski, Wojciech, Hunter, Jill V, Hanchard, Neil A, Lupski, James R, Lalani, Seema R. 2013. TM4SF20 ancestral deletion and susceptibility to a pediatric disorder of early language delay and cerebral white matter hyperintensities. In American journal of human genetics, 93, 197-210. doi:10.1016/j.ajhg.2013.05.027. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23810381/
3. Andres, Erin M, Neely, Heather L, Hafeez, Huma, Basra, M Asim Raza, Raza, Muhammad Hashim. 2021. Study of rare genetic variants in TM4SF20, NFXL1, CNTNAP2, and ATP2C2 in Pakistani probands and families with language impairment. In Meta gene, 30, . doi:10.1016/j.mgene.2021.100966. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34540591/
4. Khare, Satyajeet, Jiang, Lu, Cabrara, Diego Paine, Apte, Udayan, Pritchard, Michele T. 2023. Global Transcriptomics of Congenital Hepatic Fibrosis in Autosomal Recessive Polycystic Kidney Disease using PCK rats. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2023.01.19.524760. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36711494/
5. Chen, Qiuyue, Lee, Ching-En, Denard, Bray, Ye, Jin. 2014. Sustained induction of collagen synthesis by TGF-β requires regulated intramembrane proteolysis of CREB3L1. In PloS one, 9, e108528. doi:10.1371/journal.pone.0108528. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25310401/
6. Li, Qiao, Liu, Xiao-Li, Jiang, Ni, Luo, Xiang-Yu, Chen, Cheng. 2023. A new prognostic model for RHOV, ABCC2, and CYP4B1 to predict the prognosis and association with immune infiltration of lung adenocarcinoma. In Journal of thoracic disease, 15, 1919-1934. doi:10.21037/jtd-23-265. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37197482/