Capn12-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Capn12-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-11216

品系全称

C57BL/6JCya-Capn12em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-60594-Capn12-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Capn12-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-11216) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
calpain 12
基因别称
CANP 12
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001110807.1 | Ensembl: ENSMUST00000066880
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~18
敲除长度
~9266 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Calpain 12 (CAPN12) 是一种钙依赖性半胱氨酸蛋白酶,属于大型钙蛋白酶基因家族的新成员。CAPN12 基因包含 21 个外显子,跨越 13 kb,具有典型的钙蛋白酶基因家族的外显子-内含子结构。该基因编码的蛋白质具有潜在的蛋白酶和钙结合结构域,这些结构域是经典钙蛋白酶的典型特征。在毛发生长的生长期,毛球中的皮质是 CAPN12 表达的主要部位[1]。

研究发现,CAPN12 基因的最后一个外显子与小鼠 ACTN4 基因的 3' 端重叠,但方向相反。这种两个基因之间的重叠在人类基因组中也是保守的。此外,CAPN12 基因存在三种不同的 mRNA 转录本,这是由于选择性剪接造成的。其中两种转录本编码的蛋白质缺少 C 端钙调蛋白样结构域[1]。

在 Siezary 综合征(SS)中,患者的基因组发生了重排,导致基因表达的改变和新融合转录本的出现。研究发现,SS 患者中存在 15 种基因重排,其中包括 EHD1-CAPN12 融合转录本[2]。此外,CAPN12 基因的表达在 SS 患者中也发生了改变,这表明 CAPN12 基因可能参与 SS 的发病机制[2]。

全转录组关联研究(TWAS)发现,CAPN12 基因与结直肠癌(CRC)风险相关[3]。研究发现,CAPN12 基因在 19q13.2 位点与 CRC 风险相关,并且在该位点上发现了一种新的易感基因[3]。此外,CAPN12 基因的启动子活性受到风险等位基因的影响,这表明 CAPN12 基因的表达可能受到遗传变异的调控[3]。

在肾脏透明细胞癌(ccRCC)中,CAPN12 基因的表达与预后相关。研究发现,CAPN12 基因的表达与免疫浸润细胞相关,并且与 ccRCC 患者的风险评分相关[4]。此外,CAPN12 基因的抑制可以降低 ccRCC 细胞的增殖能力,这表明 CAPN12 基因可能是 ccRCC 的治疗靶点[4]。

在一项关于先天性鱼鳞病的研究中,发现 CAPN12 基因突变与患者的表型有关。研究发现,CAPN12 基因突变导致患者皮肤中 CAPN12 蛋白的表达显著降低,这表明 CAPN12 基因在表皮发育和毛发生长中发挥重要作用[5]。

在结肠癌中,CAPN12 基因的突变和表达缺失与肿瘤的发生发展相关。研究发现,CAPN12 基因的移码突变在微卫星不稳定性高(MSI-H)的结肠癌中较为常见,并且在 MSI-H 结肠癌中,CAPN12 蛋白的表达缺失率较高[6]。这些结果表明 CAPN12 基因可能是一种肿瘤抑制基因,在结肠癌的发生发展中发挥重要作用。

全基因组关联研究(GWAS)发现,CAPN12 基因与视网膜血管扭曲相关。研究发现,CAPN12 基因的表达与视网膜血管扭曲程度相关,并且与心血管疾病和代谢综合征的风险相关[7]。这表明 CAPN12 基因可能参与血管疾病的发生发展。

综上所述,CAPN12 基因在多种生物学过程中发挥重要作用,包括毛发生长、肿瘤发生发展、表皮发育和血管疾病。CAPN12 基因的突变和表达改变与多种疾病的发生发展相关,这表明 CAPN12 基因可能是一种重要的疾病相关基因。未来的研究需要进一步探索 CAPN12 基因的功能和作用机制,以便更好地理解其在疾病发生发展中的作用,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Dear, T N, Meier, N T, Hunn, M, Boehm, T. . Gene structure, chromosomal localization, and expression pattern of Capn12, a new member of the calpain large subunit gene family. In Genomics, 68, 152-60. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/10964513/
2. Iżykowska, Katarzyna, Przybylski, Grzegorz K, Gand, Claudia, Tensen, Cornelis P, Schmidt, Christian A. . Genetic rearrangements result in altered gene expression and novel fusion transcripts in Sézary syndrome. In Oncotarget, 8, 39627-39639. doi:10.18632/oncotarget.17383. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28489605/
3. Guo, Xingyi, Lin, Weiqiang, Wen, Wanqing, Peters, Ulrike, Zheng, Wei. 2020. Identifying Novel Susceptibility Genes for Colorectal Cancer Risk From a Transcriptome-Wide Association Study of 125,478 Subjects. In Gastroenterology, 160, 1164-1178.e6. doi:10.1053/j.gastro.2020.08.062. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33058866/
4. Xia, Guang, Wu, Song, Cui, Xiaoyu. 2023. An immune infiltration-related prognostic model of kidney renal clear cell carcinoma with two valuable markers: CAPN12 and MSC. In Frontiers in oncology, 13, 1161666. doi:10.3389/fonc.2023.1161666. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37025600/
5. Bochner, Ron, Samuelov, Liat, Sarig, Ofer, Uitto, Jouni, Sprecher, Eli. 2016. Calpain 12 Function Revealed through the Study of an Atypical Case of Autosomal Recessive Congenital Ichthyosis. In The Journal of investigative dermatology, 137, 385-393. doi:10.1016/j.jid.2016.07.043. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27769845/
6. Kim, Jae Woong, Moon, Seong Won, Mo, Ha Yoon, Ann, Chang Hyeok, Lee, Sug Hyung. 2022. Concurrent inactivating mutations and expression losses of RGS2, HNF1A, and CAPN12 candidate tumor suppressor genes in colon cancers. In Pathology, research and practice, 241, 154288. doi:10.1016/j.prp.2022.154288. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36566600/
7. Tomasoni, Mattia, Beyeler, Michael Johannes, Vela, Sofia Ortin, Bergin, Ciara, Bergmann, Sven. 2023. Genome-wide Association Studies of Retinal Vessel Tortuosity Identify Numerous Novel Loci Revealing Genes and Pathways Associated With Ocular and Cardiometabolic Diseases. In Ophthalmology science, 3, 100288. doi:10.1016/j.xops.2023.100288. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37131961/