Rnf32-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Rnf32-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-10969

品系全称

C57BL/6JCya-Rnf32em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-56874-Rnf32-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Rnf32-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-10969) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ring finger protein 32
基因别称
1700009J01Rik,2700025B22Rik,4930542N22Rik,Lmbr2
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001289757 | Ensembl: ENSMUST00000001247
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~8
敲除长度
~8.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
RNF32,也称为RING finger protein 32,是一种编码含两个RING-H2结构域的蛋白质的基因。RING-H2结构域是一种富含半胱氨酸的锌结合模体,参与蛋白质之间的相互作用。RNF32基因位于人类染色体7q36,由9个组成性外显子和8个选择性剪接外显子组成,其中大多数是选择性第一外显子。该基因编码两个RING-H2结构域,它们之间由一个未知功能的IQ结构域隔开。RNF32是第一个报道的具有双RING-H2结构域的基因。在人类中,RNF32与位于相反链上的处理过的转座子C7orf13重叠。RNF32特异性地在睾丸和卵巢中表达,而C7orf13仅特异性地在睾丸中表达,这表明其表达可能受RNF32启动子区域中的元件的调控。RNF32在精子发生过程中表达,最可能在精母细胞和/或精子细胞中表达,这表明它可能在精子形成中发挥重要作用[1]。

RNF32基因位于Shh基因区域内,Shh基因是一个已知的发育基因,其表达模式受到长距离增强子的调控。研究发现,Shh基因区域内的增强子活动在一个大约900 kb的基因组区域内保持,这个区域对应于Hi-C定义的拓扑相关域(TAD)。在这个TAD内,一个位于Shh基因第二个内含子中的增强子能够激活位于数百kb距离外的报告基因,这表明近端和远端增强子都具有识别Shh拓扑域内潜在启动子的能力。RNF32基因位于Shh基因区域内,但它能够逃避增强子活动,这可能是一种常见的现象,在其他位于大型调控域中的管家基因中也存在。Shh TAD的边界并不代表增强子活动的绝对表达极限,因为在这些域的边缘存在一系列的基因组位置,其表达活性逐渐丧失[2]。

研究发现,M2巨噬细胞在免疫逃逸和免疫治疗中发挥着重要作用。RNF32基因与M2巨噬细胞相关,在结肠腺癌(COAD)中具有潜在的意义。通过分析TCGA和GEO数据库中COAD的RNA测序数据,研究者发现RNF32基因在结肠癌细胞系中的表达水平高于正常细胞系。体外实验表明,RNF32可能通过抑制细胞凋亡来促进癌细胞的增殖、迁移和侵袭。此外,构建了一个包含7个M2巨噬细胞相关基因的签名,这个签名在两个独立队列中都是一个很好的预后预测因子。高风险组显示出较低的免疫浸润和较差的免疫治疗效果。因此,RNF32基因可能影响结肠癌的预后和免疫特征[3]。

RNF32基因还与一些疾病相关。例如,RNF32基因的突变与三指多指畸形综合征(TPT-PS)相关。研究发现,一个中国家族中的TPT-PS患者存在LMBR1基因内含子5中的C到T的转换。这个C到T的转换的位置靠近其他与多个前轴多指畸形(PPD)家族相关的序列变化,支持LMBR1基因内含子5中存在一个调控肢体特异性Shh的顺式作用调节因子的观点。研究者推测,通过C到T的转换破坏这个顺式调节因子会导致Shh的失调,从而导致TPT-PS的出现[5]。

RNF32基因还与其他基因相邻,如LMBR1和NOM1。LMBR1基因在肢体发育中发挥重要作用。研究发现,RNF32基因与LMBR1基因相邻,并且LMBR1基因在不同物种中的保守性较高。这表明RNF32基因可能与肢体发育和模式形成有关[4]。

综上所述,RNF32基因是一种编码含两个RING-H2结构域的蛋白质的基因,它在精子发生、Shh基因调控、结肠癌预后和免疫特征、三指多指畸形综合征以及肢体发育等方面发挥着重要作用。RNF32基因的研究有助于深入理解其生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. van Baren, Marijke J, van der Linde, Herma C, Breedveld, Guido J, Oostra, Ben A, Heutink, Peter. . A double RING-H2 domain in RNF32, a gene expressed during sperm formation. In Biochemical and biophysical research communications, 292, 58-65. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11890671/
2. Anderson, Eve, Devenney, Paul S, Hill, Robert E, Lettice, Laura A. 2014. Mapping the Shh long-range regulatory domain. In Development (Cambridge, England), 141, 3934-43. doi:10.1242/dev.108480. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25252942/
3. Xu, Xiaochen, Zhang, Xinwen, Kou, Ruilong, Jian, Zhiyuan, Wang, Zhenran. 2024. Prognosis and immunotherapy response prediction based on M2 macrophage-related genes in colon cancer. In Journal of cancer research and clinical oncology, 150, 31. doi:10.1007/s00432-023-05573-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38270646/
4. Kim, Dae-Won, Choi, Sang-Haeng, Kim, Ryong Nam, Kang, Aram, Park, Hong-Seog. . Comparative genomic analysis of the false killer whale (Pseudorca crassidens) LMBR1 locus. In Genome, 53, 658-66. doi:10.1139/g10-043. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20924415/
5. Wang, Zhi-Qiang, Tian, Shao-Hua, Shi, Yao-Zhou, Hu, Landian, Kong, Xiangyin. 2007. A single C to T transition in intron 5 of LMBR1 gene is associated with triphalangeal thumb-polysyndactyly syndrome in a Chinese family. In Biochemical and biophysical research communications, 355, 312-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17300748/