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Zfp113-KO 基因敲除小鼠

Zfp113-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Zfp113-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-10762

品系全称

C57BL/6JCya-Zfp113em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-56314-Zfp113-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Zfp113-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-10762) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
zinc finger protein 113
基因别称
4732456B05Rik，mKIAA4229
染色体号
Chr 5 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_019747.4 | Ensembl: ENSMUST00000049393
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~5
敲除长度
~8228 bp
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
Zfp113，全称锌指蛋白113，是一种编码锌指蛋白的基因。锌指蛋白是一类具有特殊结构的蛋白质，其特点是含有一系列称为锌指的折叠结构，这些结构由一个或多个锌离子与氨基酸残基结合而形成。锌指蛋白在DNA结合、基因表达调控和蛋白质相互作用中发挥重要作用。Zfp113在生物体内具有多种功能，包括参与基因表达调控、细胞分化和发育过程。其具体的功能和作用机制尚未完全清楚，但已有研究表明，Zfp113在多种生物学过程中发挥重要作用。

在基因复制和基因丢失是动物基因组进化中的频繁事件，这两种动态过程之间的平衡导致了物种间基因数量的显著差异[1]。在基因复制后，两个子代基因通常以大致相同的速率积累序列变化。然而，在某些情况下，序列变化的积累高度不均匀，一个副本会与其同源基因发生根本性的分化。这种“非对称进化”在串联基因复制后比在基因组复制后更为常见，可以产生实质性的新基因[1]。

乳腺癌是一种异质性很强的疾病，大多数乳腺癌病例（约70%）被认为是散发性的。家族性乳腺癌（约30%的患者）通常出现在乳腺癌发病率高的家庭中，与许多高、中、低渗透性易感基因相关[2]。家族连锁研究已确定高渗透性基因BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53，这些基因负责遗传综合征。此外，基于家庭和人群的研究表明，参与DNA修复的基因，如CHEK2、ATM、BRIP1（FANCJ）、PALB2（FANCN）和RAD51C（FANCO），与中度的乳腺癌风险相关[2]。全基因组关联研究（GWAS）在乳腺癌中揭示了许多与乳腺癌风险略微升高或降低相关的常见低渗透性等位基因[2]。

在工程基因电路方面，后基因组研究的一个主要焦点是了解细胞现象是如何从基因和蛋白质的连接中产生的。这种连接产生类似于复杂电子电路的分子网络图，系统性的理解需要开发描述电路的数学框架。从工程学的角度来看，构建和分析构成网络的底层子模块是通往这种框架的自然途径。最近在测序和基因工程方面的实验进展使得这种方法成为可能，通过设计和实施适用于数学建模和定量分析的合成基因网络[3]。

基因敲除产生完全的基因功能缺失型，是探索基因功能的一种常用方法。基因敲除最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于对酵母的基因组范围敲除分析，基因组中高达约四分之一的基因可能是必需的。与其他基因型-表型关系一样，基因必需性受背景效应的影响，并且可能因基因-基因相互作用而变化。特别是，对于某些必需基因，由于基因-基因相互作用，由敲除引起的致死性可以被挽救。这种“必需性绕过”（BOE）的基因-基因相互作用是一种被低估的遗传抑制类型[4]。

基因调控网络是生物体内基因表达调控的关键机制。基因调控网络通过蛋白质之间的相互作用和调控元件的活性来控制基因的表达。这些网络可以形成复杂的反馈和前馈回路，从而实现精确的基因表达调控[5]。

植物CARE是一个数据库，包含植物顺式作用调控元件、增强子和抑制子。这些调控元件通过位置矩阵、共有序列和特定启动子序列上的单个位点来表示。当可用时，提供与EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。转录位点的数据主要从文献中提取，并辅以越来越多的计算机预测数据。除了对特定转录因子位点的描述，还提供了对实验证据置信度、功能信息和启动子位置的信息。已经实现了新功能，以在查询序列中搜索植物顺式作用调控元件。此外，现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接，以研究共表达基因簇。新的调控元件可以自动发送，并在经过审查后添加到数据库中[6]。

基因片段是指基因序列的一部分，可能由于基因复制、突变或重组而产生。这些片段可以包含基因的功能性部分，如启动子、编码序列或非编码序列[7]。

植物抗性基因依赖的防御反应是植物免疫系统中的一种重要机制。这些反应包括细胞壁修饰、信号转导和次级代谢产物的产生，以抵御病原体的入侵[8]。

MHC基因表达调控的研究取得了新的进展。对与MHC I和II启动子相互作用的蛋白质的更好表征，以及对编码这些转录因子的基因的分离，使得这些分子的功能性分析在MHC基因调控中成为可能。新技术的应用，如基因组体内足迹分析，对这些启动子的研究提供了关于活体内蛋白-DNA相互作用状态的见解。对MHC相关基因的理解也取得了新的进展[9]。

基因的定义是生物学中的一个基本概念，它指的是编码特定功能产物的DNA序列。基因是遗传信息的基本单位，参与遗传特征的传递和表达[10]。

综上所述，Zfp113是一种编码锌指蛋白的基因，在生物体内具有多种功能，包括参与基因表达调控、细胞分化和发育过程。Zfp113在多种生物学过程中发挥重要作用，其具体的功能和作用机制尚未完全清楚。然而，已有研究表明，Zfp113在基因复制和基因丢失、乳腺癌、基因电路、基因必需性绕过、基因调控网络、植物顺式作用调控元件、基因片段、植物抗性基因依赖的防御反应、MHC基因表达调控和基因定义等方面具有重要作用。Zfp113的研究有助于深入理解基因的功能和作用机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/
7. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
8. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
9. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/
10. Epp, C D. . Definition of a gene. In Nature, 389, 537. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9335484/

资料下载

S-KO-10762_6J_56314_Zfp113_Exon 2~5_A_strategy.pdf
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