Eif3d-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Eif3d-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-10658

品系全称

C57BL/6JCya-Eif3dem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-55944-Eif3d-B6J-VB

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Eif3d-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-10658) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
eukaryotic translation initiation factor 3, subunit D
基因别称
66/67kDa,Eif3s7,eIF3p66
染色体号
Chr 15 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_018749 | Ensembl: ENSMUST00000100484
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~0.4 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
eIF3d(eukaryotic initiation factor 3 subunit D)是eIF3复合物中的一个RNA结合亚基,是一个66至68 kDa的蛋白质,具有RNA结合基序和帽结合结构域。与其他eIF3亚基相比,eIF3d相对研究较少。然而,近年来对eIF3d的研究揭示了它在维持eIF3复合物完整性、全局蛋白质合成以及在生物学和病理过程中的作用。据报道,eIF3d具有非规范功能,通过结合5'-UTRs或与其他蛋白质相互作用,独立于eIF3复合物来调节特定mRNAs的翻译,以及在调节蛋白质稳定性方面的额外功能。非规范调节mRNA翻译或蛋白质稳定性可能有助于eIF3d在生物学过程如代谢应激适应中的作用,以及在疾病发生和进展中的作用,包括严重急性呼吸综合征冠状病毒2感染、肿瘤发生和获得性免疫缺陷综合症[3]。

在代谢应激下,eIF3d在人类细胞中被激活。其激活需要减少CK2介导的在其帽结合口袋附近的磷酸化。eIF3d控制一个富含对葡萄糖稳态重要的因素的基因程序,包括哺乳动物雷帕霉素靶点(mTOR)途径的成员。eIF3d指导的翻译适应对于细胞在慢性葡萄糖剥夺期间的生存至关重要。因此,这种翻译重新编程的机制调节细胞对代谢应激的响应[2]。

eIF3d在持续性应激反应中起着至关重要的作用。在持续性应激期间,eIF3d激活激酶GCN2的翻译,诱导eIF2α磷酸化并抑制一般蛋白质合成。同时,eIF3d上调m6A脱甲基酶ALKBH5,以驱动应激反应基因的5' UTR特异性脱甲基化,包括ATF4。最终,这一级联反应汇聚于ATF4的表达,通过增加mRNA与翻译机器的参与并增强核糖体绕过上游开放阅读框(uORFs)的能力。这些结果表明,eIF3d在慢性应激期间的生命或死亡决策点中起作用,并揭示了一个协同信号机制,其中翻译级联反应补充转录扩增,以控制基本的细胞过程[1]。

在结直肠癌(CRC)中,eIF3D具有致癌性,并与多药耐药性相关。研究表明,eIF3D通过上调RUVBL1水平促进CRC细胞对5-氟尿嘧啶(5-Fu)的耐药性。在CRC细胞中,除了eIF4E,eIF3D和RUVBL1的水平都受到5-Fu治疗的上调;此外,RUVBL1的水平受到eIF3D沉默的降低,而不是eIF4E。同时,eIF3D沉默降低了5-Fu的IC50值,并增强了5-Fu诱导的细胞活力下降、集落形成抑制、凋亡促进、Bcl-2下调以及γH2AX、Bax和Cleaved Caspase-3/Caspase-3的上调,但逆转了5-Fu触发的RUVBL1上调。RUVBL1过表达抵消了eIF3D沉默对5-Fu处理的CRC细胞的活力下降和凋亡促进的影响,以及在5-Fu处理的动物中的肿瘤发生抑制和凋亡促进。因此,eIF3D通过上调RUVBL1水平促进CRC细胞对5-Fu的耐药性[4]。

在先兆子痫(PE)中,eIF3D的表达上调。在先兆子痫患者的胎盘组织中,eIF3D表达上调。eIF3D上调显著抑制了HTR-8/SVneo细胞的增殖、侵袭、迁移、伤口愈合和管形成,以及其相关蛋白的表达。此外,血管紧张素(ANG)-1的浓度以及磷酸化-ERK1/2和磷酸化-MEK1/MEK1的比率也因eIF3D上调而明显降低。然而,eIF3D敲低产生了相反的效果,并且这些效果被ERK1/2抑制剂SC-221593处理明显抵消。因此,eIF3D上调可能通过调节MAPK/ERK1/2通路来抑制先兆子痫的进展[5]。

在HIV感染中,eIF3d的表达减少。在早期HIV感染(EHI)中,与慢性进展者(CPs)相比,在感染大约100天后,只有eIF3d的表达在快速进展者(RPs)中明显降低。eIF3d的表达与EHI中的疾病进展显著相关。基于体外分析,eIF3d表达降低导致CD8+ T细胞增殖和IFN-γ分泌减少以及凋亡增加。eIF3d表达的抑制导致SOCS-7表达增加,并且通过siRNA抑制SOCS-7表达挽救了eIF3d抑制引起的CD8+ T细胞功能的衰减。最后,当在Jurkat细胞、外周血单核细胞(PBMCs)和CD4+ T细胞中抑制eIF3d时,pNL4-3-VSV-G病毒复制增强。这些数据强调了eIF3d在HIV感染中的重要性,它通过抑制CD8+ T细胞功能并促进病毒复制来加速HIV疾病进展。这项研究为改进免疫干预提供了潜在靶点[6]。

人巨细胞病毒(HCMV)感染的细胞中,蛋白质合成逐渐依赖于eIF3d。靶向eIF3d的选择性抑制HCMV复制,减少多核糖体丰度,并干扰病毒基因和宿主基因表达特征的表达,这些特征表明慢性内质网(ER)应激促进了HCMV繁殖。这揭示了一种策略,即细胞eIF3d依赖性蛋白质生产被劫持以利用病毒诱导的ER应激。此外,它还确定了如何在感染细胞中切换eIF4E和eIF3d反应的帽依赖性翻译,以差异调节病毒和宿主基因表达[7]。

综上所述,eIF3d在多种生物学过程中发挥着重要作用,包括维持eIF3复合物完整性、全局蛋白质合成、代谢应激适应以及在多种疾病中的功能,如结直肠癌、先兆子痫、HIV感染和HCMV感染。eIF3d的研究有助于深入理解翻译调控和细胞应激反应的机制,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Mukhopadhyay, Shaoni, Amodeo, Maria E, Lee, Amy S Y. 2023. eIF3d controls the persistent integrated stress response. In Molecular cell, 83, 3303-3313.e6. doi:10.1016/j.molcel.2023.08.008. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37683648/
2. Lamper, Adam M, Fleming, Rebecca H, Ladd, Kayla M, Lee, Amy S Y. . A phosphorylation-regulated eIF3d translation switch mediates cellular adaptation to metabolic stress. In Science (New York, N.Y.), 370, 853-856. doi:10.1126/science.abb0993. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33184215/
3. Ma, Shijie, Liu, Jing-Yuan, Zhang, Jian-Ting. 2023. eIF3d: A driver of noncanonical cap-dependent translation of specific mRNAs and a trigger of biological/pathological processes. In The Journal of biological chemistry, 299, 104658. doi:10.1016/j.jbc.2023.104658. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36997088/
4. Li, Chaobin, Lu, Kemei, Yang, Chenggang, Du, Wenfeng, Liang, Zhengkai. 2023. EIF3D promotes resistance to 5-fluorouracil in colorectal cancer through upregulating RUVBL1. In Journal of clinical laboratory analysis, 37, e24825. doi:10.1002/jcla.24825. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36592991/
5. Li, Xia, Wang, Zhu, Liu, Guo, Guo, Jingjing. 2021. EIF3D promotes the progression of preeclampsia by inhibiting of MAPK/ERK1/2 pathway. In Reproductive toxicology (Elmsford, N.Y.), 105, 166-174. doi:10.1016/j.reprotox.2021.09.006. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34520790/
6. Pan, Ying, Zhang, Zi-Ning, Yin, Lin-Bo, Jiang, Yong-Jun, Shang, Hong. 2019. Reduced eIF3d accelerates HIV disease progression by attenuating CD8+ T cell function. In Journal of translational medicine, 17, 167. doi:10.1186/s12967-019-1925-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31118081/
7. Thompson, Letitia, Depledge, Daniel P, Burgess, Hannah M, Mohr, Ian. . An eIF3d-dependent switch regulates HCMV replication by remodeling the infected cell translation landscape to mimic chronic ER stress. In Cell reports, 39, 110767. doi:10.1016/j.celrep.2022.110767. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35508137/