Paf1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Paf1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-10603

品系全称

C57BL/6JCya-Paf1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-54624-Paf1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Paf1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-10603) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
Paf1, RNA polymerase II complex component
基因别称
5730511K23Rik
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_019458 | Ensembl: ENSMUST00000003529
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~11
敲除长度
~1.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Paf1(Polymerase-Associated Factor 1)是一种与RNA聚合酶II(RNA polymerase II,Pol II)相关的因子,是Paf1复合物(Paf1C)的核心亚基。Paf1C是一个保守的多功能复合物,参与调控RNA Pol II转录周期的所有阶段,包括转录起始、转录延伸和转录终止。Paf1C还参与调控染色质结构,影响基因表达。Paf1C在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞分化、发育和疾病发生。

Paf1C在基因表达调控中具有重要作用。研究表明,Paf1C可以调控启动子近端暂停(promoter-proximal pausing)和转录延伸,影响基因表达。例如,在人类癌症细胞中,Paf1C可以调控与细胞周期相关的基因表达,维持肿瘤细胞的自我更新和增殖能力。此外,Paf1C还参与调控mRNA加工和稳定性,影响基因表达[1]。

Paf1C在维持干细胞多能性和发育中具有重要作用。研究表明,Paf1C可以调控核心转录因子如Oct4和Nanog的表达,维持干细胞的自我更新和 pluripotency。Paf1C还可以直接结合到目标基因的启动子或远端元件,维持干细胞的 pluripotency。此外,Paf1C还参与调控多个发育阶段的基因表达,如果蝇、斑马鱼、小鼠和人类的发育过程。因此,Paf1C是细胞分化、细胞特化和其特征的重要贡献者,可能是发育疾病的治疗靶点[2]。

Paf1C在肿瘤发生发展中具有重要作用。研究表明,Paf1C在癌症干细胞中表达上调,维持肿瘤细胞的自我更新和增殖能力。例如,在胰腺癌中,Paf1C可以调控代谢重编程,促进肿瘤细胞利用有氧糖酵解途径,维持肿瘤细胞的生长和增殖。此外,Paf1C还可以与HIF1α相互作用,调控肿瘤细胞的代谢重编程。在前列腺癌中,Paf1C可以调控肿瘤细胞的药物抗性,促进肿瘤细胞的生长和转移[3,4]。

Paf1C还参与调控血癌的发生发展。研究表明,Paf1C的一个关键亚基CTR9的基因突变可以导致血癌的遗传易感性增加。CTR9基因突变导致RNA Pol II转录延伸异常,影响基因表达和造血干细胞的自我更新。此外,Paf1C还可以与其他转录因子相互作用,调控基因表达和细胞分化[5]。

Paf1C在生殖细胞分化中也具有重要作用。研究表明,Paf1C的一个同源物tPAF(testis-specific PAF1C)在果蝇睾丸中表达,维持精细胞特异性基因的表达。tPAF可以调控基因的转录终止,维持生殖细胞特异性基因的表达。此外,tPAF还参与调控减数分裂染色体的分离和雄性生育能力[6]。

综上所述,Paf1C是一个保守的多功能复合物,参与调控RNA Pol II转录周期的所有阶段,包括转录起始、转录延伸和转录终止。Paf1C还参与调控染色质结构,影响基因表达。Paf1C在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞分化、发育和疾病发生。Paf1C的研究有助于深入理解转录调控的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Karmakar, Saswati, Dey, Parama, Vaz, Arokia P, Ponnusamy, Moorthy P, Batra, Surinder K. 2018. PD2/PAF1 at the Crossroads of the Cancer Network. In Cancer research, 78, 313-319. doi:10.1158/0008-5472.CAN-17-2175. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29311159/
2. Park, Jiyeon, Park, Shinae, Lee, Jung-Shin. 2022. Role of the Paf1 complex in the maintenance of stem cell pluripotency and development. In The FEBS journal, 290, 951-961. doi:10.1111/febs.16582. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35869661/
3. Ogunleye, Ayoola O, Gayen, Neelanjana, Rauth, Sanchita, Batra, Surinder K, Ponnusamy, Moorthy P. 2024. PAF1/HIF1α axis rewires the glycolytic metabolism to fuel aggressiveness of pancreatic cancer. In Cancer & metabolism, 12, 26. doi:10.1186/s40170-024-00354-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39242538/
4. Muniyan, Sakthivel, Vengoji, Raghupathy, Nimmakayala, Rama Krishna, Ponnusamy, Moorthy P, Batra, Surinder K. 2024. PAF1-mediated transcriptional reprogramming confers docetaxel resistance in advanced prostate cancer. In Cancer letters, 609, 217355. doi:10.1016/j.canlet.2024.217355. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39603380/
5. Zhao, Jiawei, Cato, Liam D, Arora, Uma P, Armstrong, Scott A, Sankaran, Vijay G. 2024. Inherited blood cancer predisposition through altered transcription elongation. In Cell, 187, 642-658.e19. doi:10.1016/j.cell.2023.12.016. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38218188/
6. Vilstrup, Astrid Pold, Gupta, Archica, Rasmussen, Anna Jon, Hayashi, Rippei, Andersen, Peter. 2024. A germline PAF1 paralog complex ensures cell type-specific gene expression. In Genes & development, 38, 866-886. doi:10.1101/gad.351930.124. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39332828/