Prpf40b-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Prpf40b-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-10598

品系全称

C57BL/6JCya-Prpf40bem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-54614-Prpf40b-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Prpf40b-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-10598) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
pre-mRNA processing factor 40B
基因别称
2610317D23Rik,Hypc
染色体号
Chr 15 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_018786 | Ensembl: ENSMUST00000145482
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~15
敲除长度
~4.3 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
PRPF40B,即pre-mRNA processing factor 40 homolog B,是一种在哺乳动物中发现的剪接因子,其在剪接体组装过程中的作用是识别并调节剪接位点的识别和剪接反应。PRPF40B在剪接体中与U1 snRNP、SF1和U2AF65等因子相互作用,这些因子共同确保剪接反应的精确性[3]。此外,PRPF40B通过调节外显子包含和排除,参与多种生物学过程的调控,如细胞凋亡和细胞生存。

PRPF40B的突变与骨髓增生异常综合征(MDS)和急性髓细胞白血病(AML)的发生发展密切相关[1,2]。在MDS患者中,PRPF40B的突变导致剪接调控异常,进而影响基因表达和细胞功能。研究发现,PRPF40B的缺失导致K562细胞中数百个基因的剪接异常,包括外显子包含增加和剪接位点选择改变[1]。这些剪接异常可能导致基因表达改变,影响细胞代谢、信号传导和铁代谢等过程,进而影响细胞生长和分化。此外,PRPF40B的缺失还导致K562细胞中缺氧相关基因的表达上调,表明PRPF40B在抑制缺氧信号通路中发挥作用。PRPF40B的低表达可能在白血病的发生发展中起重要作用。

PRPF40A是PRPF40B的旁系同源物,两者在结构和功能上存在相似之处,但PRPF40A在调节剪接事件和外显子包含方面表现出独特的功能[4]。PRPF40A主要作为外显子包含的激活因子,在GC富集区域促进剪接反应,进而影响人类骨髓细胞分化和存活。PRPF40A的敲低导致HL-60细胞凋亡增加、增殖减少和分化程度降低,表明PRPF40A在维持细胞生长和分化中发挥重要作用。此外,PRPF40A的功能部分与其在细胞核中的定位有关,其与SRRM2、SON、PCBP1/2等剪接调节因子共同形成功能性网络,协同调节剪接反应。

Foxa1和Foxa2是两种先驱转录因子,在T细胞发育过程中发挥重要作用。研究发现,Foxa1和Foxa2在T细胞阳性选择过程中调节RNA剪接,并影响CD4+和CD8+ T细胞的发育。Foxa1和Foxa2的缺失导致T细胞发育受阻,并影响多个基因的剪接事件[5]。此外,Foxa1和Foxa2还调节许多剪接因子和调节因子的表达,包括Mbnl1、H1f0、Sf3b1、Hnrnpa1、Rnpc3、Prpf4b、Prpf40b和Snrpd3,表明Foxa1和Foxa2在剪接调控网络中发挥核心作用。

综上所述,PRPF40B是一种重要的剪接因子,其在剪接体组装、剪接位点的识别和剪接反应的调节中发挥关键作用。PRPF40B的突变与MDS和AML的发生发展密切相关,其缺失导致剪接异常和缺氧信号通路激活,进而影响细胞生长和分化。PRPF40A作为PRPF40B的旁系同源物,在调节剪接事件和外显子包含方面表现出独特的功能,并与Foxa1和Foxa2等先驱转录因子共同调节T细胞发育过程中的剪接反应。深入研究PRPF40B的功能和调控机制,有助于揭示MDS和AML的发生发展机制,并为疾病的治疗提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Lorenzini, Paolo Alberto, Chew, Resilind Su Ern, Tan, Cheryl Weiqi, Zheng, Jie, Roca, Xavier. 2019. Human PRPF40B regulates hundreds of alternative splicing targets and represses a hypoxia expression signature. In RNA (New York, N.Y.), 25, 905-920. doi:10.1261/rna.069534.118. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31088860/
2. Larsson, Connie A, Cote, Gilbert, Quintás-Cardama, Alfonso. 2013. The changing mutational landscape of acute myeloid leukemia and myelodysplastic syndrome. In Molecular cancer research : MCR, 11, 815-27. doi:10.1158/1541-7786.MCR-12-0695. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23645565/
3. Becerra, Soraya, Montes, Marta, Hernández-Munain, Cristina, Suñé, Carlos. 2015. Prp40 pre-mRNA processing factor 40 homolog B (PRPF40B) associates with SF1 and U2AF65 and modulates alternative pre-mRNA splicing in vivo. In RNA (New York, N.Y.), 21, 438-57. doi:10.1261/rna.047258.114. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25605964/
4. Tan, Cheryl Weiqi, Sim, Donald Yuhui, Zhen, Yashu, Koh, Jace, Roca, Xavier. . PRPF40A induces inclusion of exons in GC-rich regions important for human myeloid cell differentiation. In Nucleic acids research, 52, 8800-8814. doi:10.1093/nar/gkae557. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38943321/
5. Lau, Ching-In, Rowell, Jasmine, Yanez, Diana C, Ono, Masahiro, Crompton, Tessa. 2021. The pioneer transcription factors Foxa1 and Foxa2 regulate alternative RNA splicing during thymocyte positive selection. In Development (Cambridge, England), 148, . doi:10.1242/dev.199754. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34323272/