Ddx39b-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Ddx39b-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-10430

品系全称

C57BL/6NCya-Ddx39bem1/Cya

品系背景

C57BL/6NCya

品系编号

KOCMP-53817-Ddx39b-B6N-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Ddx39b-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-10430) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
DEAD box helicase 39b
基因别称
0610030D10Rik,Bat-1,Bat1,Bat1a,D17H6S81E,D17H6S81E-1,D6S81Eh
染色体号
Chr 17 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_019693 | Ensembl: ENSMUST00000068056
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~6
敲除长度
~4.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:99240Mice homozygous for a null allele exhibit complete preweaning lethality while mice heterozygous for the allele exhibit increased susceptibility to gamma radiation.

发表文献

Oncogene
2020-10-20
Suppression of DDX39B sensitizes ovarian cancer cells to DNA-damaging chemotherapeutic agents via destabilizing BRCA1 mRNA
1
Ddx39b,也称为DExD/H-Box Polypeptide 39B,是一种DEAD-box RNA解旋酶。DEAD-box RNA解旋酶是重要的RNA代谢调节因子,参与RNA的转录、剪接、转运和降解等过程。Ddx39b在多种生物学过程中发挥重要作用,包括基因组稳定性、细胞增殖、迁移、侵袭、免疫调节和代谢等。

Ddx39b在结直肠癌(CRC)的进展中发挥关键作用。Ddx39b表达升高与CRC的肝转移和侵袭性表型相关,是CRC患者预后的独立预测因子。Ddx39b的过表达增强了CRC细胞的增殖、迁移和侵袭能力,而Ddx39b缺陷的CRC细胞则表现出相反的结果。机制研究表明,Ddx39b与PKM2直接相互作用,通过竞争性抑制STUB1介导的PKM2泛素化和降解来稳定PKM2。此外,Ddx39b招募importin α5促进PKM2的核转运,导致肿瘤基因和糖酵解相关基因的转录激活。因此,Ddx39b增强了葡萄糖摄取和乳酸产生,激活了CRC中的Warburg效应[1]。

Ddx39b在基因组稳定性中也发挥重要作用。Ddx39b等DEAD-box RNA解旋酶通过调节基因表达、防止DNA损伤和参与DNA损伤的修复来保护基因组。这些解旋酶调节促进基因组稳定性的因子的表达,直接参与DNA损伤的修复反应[2]。

Ddx39b在RNA剪接中也发挥重要作用。Ddx39b调节免疫转录因子的RNA剪接,例如IL7R和FOXP3。Ddx39b的敲低导致免疫调节表达丧失和免疫效应表达增加。Ddx39b水平对FOXP3内含子的剪接特别敏感,而FOXP3是CD4+/CD25+ T调节细胞中的主转录因子。因此,Ddx39b作为免疫耐受的重要守护者,通过激活FOXP3 RNA剪接来控制T调节细胞的命运[3,5,7]。

Ddx39b在卵巢癌中也有重要作用。Ddx39b通过结合并稳定BRCA1 mRNA来促进DNA损伤修复,增强DNA修复相关蛋白ssDNA的形成和RAD51在DNA双链断裂(DSB)位点的积累。Ddx39b缺陷的卵巢癌细胞对DNA损伤化疗药物如顺铂或PARPi表现出超敏感性。此外,Ddx39b缺陷的小鼠表现出与缺乏BRCA1相似的胚胎致死或发育迟缓。因此,Ddx39b的抑制可能是增强BRCA1阳性卵巢癌化疗疗效的合理方法[6]。

Ddx39b还在膀胱癌的淋巴结转移中发挥作用。Ddx39B的SUMO化可以激活circNCOR1的核输出,从而抑制TGFβ-SMAD信号通路。Ddx39b的SUMO化降低了circNCOR1在细胞核中的水平,导致TGFβ-SMAD级联激活,从而促进膀胱癌的淋巴结转移[4]。

Ddx39b还在肝细胞癌(HCC)的恶性进展中发挥作用。Ddx39B在HCC组织和旁癌组织中的表达升高,预示着更差的预后。Ddx39B的过表达促进了HCC细胞的增殖、转移和脂质生成。机制研究表明,Ddx39B直接与SREBP1相互作用,通过FBXW7介导的SREBP1泛素化和降解来稳定SREBP1蛋白。此外,Ddx39B缺陷降低了SREBP1的核转位和激活,以及SREBP1下游基因的转录,导致脂质积累减少。因此,Ddx39B通过激活SREBP1介导的从头脂质合成来促进HCC的恶性进展[8]。

Ddx39b还在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)的预后中发挥作用。Ddx39B的高表达预示着ccRCC患者较差的总生存期(OS)。Ddx39B的表达与PD-L1和其他免疫调节剂的表达显著正相关,而与细胞毒性T淋巴细胞和HDAC10外显子3的表达负相关。Ddx39B敲低降低了PD-L1的表达并增加了HDAC10外显子3的表达。因此,Ddx39B可能通过增强HDAC10外显子3的跳跃来增加PD-L1的表达,从而促进ccRCC患者对ICI治疗的反应[9]。

综上所述,Ddx39b在多种生物学过程中发挥重要作用,包括基因组稳定性、细胞增殖、迁移、侵袭、免疫调节和代谢等。Ddx39b在多种癌症中发挥重要作用,包括结直肠癌、卵巢癌、膀胱癌、肝细胞癌和透明细胞肾细胞癌。Ddx39b的研究有助于深入理解其在肿瘤发生和发展中的作用机制,为癌症的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Zhao, Gang, Yuan, Hang, Li, Qin, Li, Kai, Lin, Ping. 2022. DDX39B drives colorectal cancer progression by promoting the stability and nuclear translocation of PKM2. In Signal transduction and targeted therapy, 7, 275. doi:10.1038/s41392-022-01096-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35973989/
2. Cargill, Michael, Venkataraman, Rasika, Lee, Stanley. 2021. DEAD-Box RNA Helicases and Genome Stability. In Genes, 12, . doi:10.3390/genes12101471. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34680866/
3. Roth, Jonathan F, Braunschweig, Ulrich, Wu, Mingkun, Gingras, Anne-Claude, Blencowe, Benjamin J. . Systematic analysis of alternative exon-dependent interactome remodeling reveals multitasking functions of gene regulatory factors. In Molecular cell, 83, 4222-4238.e10. doi:10.1016/j.molcel.2023.10.034. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38065061/
4. An, Mingjie, Zheng, Hanhao, Huang, Jian, Chen, Changhao, Lin, Tianxin. . Aberrant Nuclear Export of circNCOR1 Underlies SMAD7-Mediated Lymph Node Metastasis of Bladder Cancer. In Cancer research, 82, 2239-2253. doi:10.1158/0008-5472.CAN-21-4349. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35395674/
5. Hirano, Minato, Galarza-Muñoz, Gaddiel, Nagasawa, Chloe, Bradrick, Shelton, Garcia-Blanco, Mariano A. 2023. The RNA helicase DDX39B activates FOXP3 RNA splicing to control T regulatory cell fate. In eLife, 12, . doi:10.7554/eLife.76927. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37261960/
6. Xu, Zhanzhan, Li, Xiaoman, Li, Hanxiao, Wang, Weibin, Wang, Jiadong. 2020. Suppression of DDX39B sensitizes ovarian cancer cells to DNA-damaging chemotherapeutic agents via destabilizing BRCA1 mRNA. In Oncogene, 39, 7051-7062. doi:10.1038/s41388-020-01482-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32989256/
7. Banerjee, Shefali, Nagasawa, Chloe K, Widen, Steven G, Garcia-Blanco, Mariano A. . Parsing the roles of DExD-box proteins DDX39A and DDX39B in alternative RNA splicing. In Nucleic acids research, 52, 8534-8551. doi:10.1093/nar/gkae431. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38801080/
8. Feng, Tianyu, Li, Siqi, Zhao, Gang, Li, Kai, Lin, Ping. 2023. DDX39B facilitates the malignant progression of hepatocellular carcinoma via activation of SREBP1-mediated de novo lipid synthesis. In Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands), 46, 1235-1252. doi:10.1007/s13402-023-00807-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37052853/
9. Wei, Jinhuan, Lu, Jun, Cao, Yun, Luo, Junhang, Cao, Jiazheng. . DDX39B Predicts Poor Survival and Associated with Clinical Benefit of Anti-PD-L1 Therapy in ccRCC. In Current cancer drug targets, 21, 849-859. doi:10.2174/1568009621666210811115054. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34382524/

发表文献

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