D6Ertd527e-KO 基因敲除小鼠

下单100%中奖,最高可得千元京东卡
复苏/繁育服务
产品名称

D6Ertd527e-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-10311

品系全称

C57BL/6JCya-D6Ertd527eem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-52372-D6Ertd527e-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: D6Ertd527e-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-10311) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因全称
DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527, expressed
基因别称
-
染色体号
Chr 6 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001167937.1 | Ensembl: ENSMUST00000204927
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1~2
敲除长度
~7423 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1261919Female mice homozygous for a null allele produce slightly smaller litters than wild-type mice.
基因D6Ertd527e,也称为D6Ertd527e,是一个在哺乳动物中发现的基因,其名称中的“D6”表示它位于第六染色体上,而“Ertd527e”则是一个基因标识符。D6Ertd527e是一个有趣的基因,因为它在进化过程中经历了显著的变异和功能改变。在早期,D6Ertd527e很可能是一个长链非编码RNA(lncRNA)基因,在啮齿动物中表达。然而,随着时间的推移,这个基因发生了许多重要的变化,包括获得编码蛋白质的能力。

D6Ertd527e基因的进化历程是研究基因如何从非编码序列转化为编码序列的典型例子。最初,D6Ertd527e可能是由非编码序列通过新的基因形成过程产生的。在这个过程中,一个长末端重复(LTR)逆转录转座子的插入提供了启动子和基因的第一个外显子,使得这个基因能够在卵母细胞中特异性地表达。在啮齿动物中,D6Ertd527e基因在某些物种中继续作为lncRNA表达,而在其他物种中则丢失了基因或其表达。在Mus musculus的祖先谱系中,D6Ertd527e基因获得了编码蛋白质的能力。编码序列的形成主要是由CAG(AGC)三核苷酸重复扩张和复制事件引起的。这些变化导致了一个富含丝氨酸的细胞质母源蛋白质的产生。在实验室小鼠中敲除D6Ertd527e基因会导致生育能力和母源转录组的小幅但可检测到的变化。尽管这个基因在实验室小鼠中没有显示出明确的功能,但它在大约4000万年的时间里在Muroidea超科中的进化历史提供了一个教科书式的例子,说明几个常见的突变事件如何支持新基因的形成、蛋白质编码能力的进化以及基因的消失[1]。

LTR逆转录转座子是“复制-粘贴”插入突变剂,它们在哺乳动物基因组内容中起着重要作用。LTR通常携带LTRs,用于逆转录病毒样的逆转录和整合到基因组中。研究表明,一组来自哺乳动物内源性逆转录病毒相关ERVL逆转录转座子类的LTRs对基因表达有非凡的影响。在鼠中,研究人员识别了来自ORR1、MT、MT2和MLT家族的800多个LTRs,它们类似于可移动的基因重排平台,为启动子和第一个外显子提供。LTR介导的基因重排也扩展到仓鼠、人类和牛的卵母细胞。LTRs在卵母细胞到胚胎的转变过程中以阶段特异性方式发挥作用,通过激活转录、改变蛋白质编码序列、产生非编码RNA,甚至支持新蛋白质编码基因的进化。这些功能导致例如将加工过的假基因回收成具有调节作用的mRNA或lncRNA。研究还表明,休眠的LTR启动子活性可以挽救上游启动子的丢失。此外,还报道了一种新的蛋白质编码基因进化-D6Ertd527e,其中MT LTR提供了一个启动子和一个具有功能起始密码子的5'外显子,而蛋白质编码序列的大部分是通过CAG重复扩张进化的。总的来说,ERVL LTRs为随机扫描、重排和回收遗传信息提供了分子机制,规模之大令人惊叹。因此,ERVL LTRs为全面调查基因组的表达潜力提供了手段,与基因表达和进化紧密相连[2]。

综上所述,D6Ertd527e基因的进化历史为我们提供了一个了解基因如何从非编码序列进化到编码序列的窗口。LTR逆转录转座子在基因表达和进化中发挥着重要作用,它们为基因重排和功能创新提供了可能。D6Ertd527e基因的研究不仅有助于我们理解基因进化的复杂过程,而且还揭示了LTR逆转录转座子在哺乳动物基因组中的潜在功能。这些发现对于理解基因表达调控、进化生物学以及疾病发生机制具有重要意义。

参考文献:
1. Petrzilek, Jan, Pasulka, Josef, Malik, Radek, Fulka, Helena, Svoboda, Petr. 2022. De novo emergence, existence, and demise of a protein-coding gene in murids. In BMC biology, 20, 272. doi:10.1186/s12915-022-01470-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36482406/
2. Franke, Vedran, Ganesh, Sravya, Karlic, Rosa, Vlahovicek, Kristian, Svoboda, Petr. 2017. Long terminal repeats power evolution of genes and gene expression programs in mammalian oocytes and zygotes. In Genome research, 27, 1384-1394. doi:10.1101/gr.216150.116. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28522611/