Tubgcp4-KO 基因敲除小鼠

下单100%中奖,最高可得千元京东卡
复苏/繁育服务
产品名称

Tubgcp4-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-10279

品系全称

C57BL/6JCya-Tubgcp4em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-51885-Tubgcp4-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Tubgcp4-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-10279) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
tubulin, gamma complex component 4
基因别称
4932441P04Rik,76p,D2Ertd435e,GCP-4
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_153387.3 | Ensembl: ENSMUST00000039541
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~6
敲除长度
~5192 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:1196293Homozygous null mice show complete embryonic lethality by E7.5. In vitro outgrowth assays show that blastocysts fail to hatch from the zona pellucida. Heterozygous mice show photoreceptor degeneration and retinopathy due to disrupted autophagy homeostasis in the retina.
TUBGCP4,也称为tubulin, gamma complex associated protein 4,是一种编码γ-微管蛋白复合物蛋白4的基因。γ-微管蛋白复合物(γ-TuRC)是微管组织中心(MTOC)的核心结构,负责微管的核化和组织。微管是细胞骨架的重要组成部分,参与细胞分裂、细胞运输、细胞极性和细胞运动等多种细胞过程。TUBGCP4的突变或缺失与多种疾病相关,包括微头症、脉络膜视网膜病变和视网膜光感受器变性等。

在最近的研究中,Xu等人发现,Tubgcp4基因在维持视网膜光感受器稳态方面发挥着重要作用。敲除Tubgcp4基因的小鼠在胚胎早期死亡,而杂合子小鼠则因一个野生型等位基因的剂量补偿而存活。然而,TUBGCP4的半合子不足会导致γ-TuRCs的组装受损和视网膜自噬稳态的破坏,进而导致光感受器变性和视网膜电图反应降低。此外,TUBGCP4还能通过与ATG3竞争性结合ATG7来抑制自噬,从而影响LC3B的脂质化。这些发现表明TUBGCP4在胚胎发育和视网膜稳态中具有重要作用,并揭示了剂量效应在突变小鼠存活中的作用[1]。

Da Palma等人报道了一例TUBGCP4基因突变引起的微头症和脉络膜视网膜病变的患者。该患者表现为小头症、小眼球、脉络膜视网膜病变、视网膜外观呈凿孔状、面部畸形、视力下降和学习困难等症状。这些临床特征与先前报道的MCCRP3患者的症状相似。此外,患者还表现出中心性肥胖、妊娠纹、黑棘皮症、脊柱侧凸和高胆固醇血症等特征,这些特征可能与其他ciliopathy综合征有关[2]。

Martín Fernández-Mayoralas等人报道了一例5岁自闭症男孩,其TUBGCP4基因存在双等位基因变异,但没有视网膜异常。脑MRI显示双侧视神经鞘扩大扭曲,双眼轴向长度缩短。全外显子测序结果显示,TUBGCP4基因存在同义变异c.1746G>T;p.Leu582=。这一变异可能导致TUBGCP4基因第16个外显子的跳跃。这些结果扩大了该新综合征的临床谱系,并提示TUBGCP4双等位基因突变可能与复杂的神经发育障碍有关[3]。

Scheidecker等人发现,TUBGCP4基因的变异与常染色体隐性微头症和脉络膜视网膜病变有关。全外显子测序结果显示,在两个受影响的家族中,TUBGCP4基因存在复合杂合突变。进一步的研究发现,TUBGCP4编码γ-TuRCs的一个成分,负责调节微管的核化和组织。功能分析显示,TUBGCP4突变导致γ-TuRCs水平降低、微管核化和组织受损、细胞核形态异常和染色体非整倍性。此外,使用tubgcp4形态素处理的斑马鱼出现头部体积减小、眼发育异常和脉络膜视网膜发育不良。这些发现表明TUBGCP4在脑和眼发育中发挥着重要作用[4]。

Maver等人报道了一例原发性微头症患儿,其TUBGCP5基因存在罕见错义变异。原发性微头症是一种以出生时头围小于正常值2个标准差为特征的疾病,通常没有内脏畸形。TUBGCP5基因是TUBGCP4和TUBGCP6的旁系同源基因,这两个基因都与微头症相关,并且都参与中心体的形成。该患者同时存在15q11.2 BP1-BP2微缺失,这是一种与Prader-Willi/Angelman综合征相关的微缺失。该研究提示TUBGCP5变异可能是原发性微头症的一个新原因,并可能参与15q11.2微缺失患者微头症的发病机制[5]。

Bayram-Suverza等人报道了两例墨西哥患者的微头症和脉络膜视网膜病变,并讨论了可能的鉴别诊断。两例患者均表现为视力下降、视网膜脉络膜萎缩和色素沉着。基因检测发现,两例患者均存在TUBGCP4基因的突变,从而确诊为微头症和脉络膜视网膜病变。这些病例表明,脉络膜视网膜萎缩和基因检测有助于正确诊断该病[6]。

Li等人发现,GCP4的半合子不足会导致视网膜光感受器变性。敲除Tubgcp4基因的小鼠在胚胎早期死亡,而杂合子小鼠则因一个野生型等位基因的剂量补偿而存活。然而,GCP4的半合子不足会导致γ-TuRCs的组装受损和视网膜自噬稳态的破坏,进而导致光感受器变性和视网膜电图反应降低。此外,GCP4还能通过与ATG3竞争性结合ATG7来抑制自噬,从而影响LC3B的脂质化。这些发现表明GCP4在胚胎发育和视网膜稳态中具有重要作用,并揭示了剂量效应在突变小鼠存活中的作用[7]。

Ramesh Babu等人预测了抗微管靶蛋白的微管蛋白和其相互作用蛋白。他们使用Gene Ontology工具(如Stringbase、ProteomeHD、GeneMANIA和ShinyGO)来识别抗微管靶蛋白,通过选择与微管蛋白强相互作用的蛋白质。他们使用了6种不同的人微管蛋白异构体(α-、β-和γ-微管蛋白各2种)并发现了几千个节点到节点的蛋白质相互作用(GeneMANIA中最高为4956个)。他们选择了得分最高的前10个强相互作用节点到节点的相互作用,其中包括7种微管蛋白家族蛋白质和6种非微管蛋白家族蛋白质(总共13种)。功能富集分析表明,这些13种蛋白质在微管的核化、聚合或解聚、膜锚定和对接、背根神经节发育、有丝分裂周期和细胞骨架组织等方面发挥着重要作用。他们发现γ-微管蛋白(TUBG1、TUBGCP4和TUBBGCP6)在微管相关功能中发挥着重要作用,其次是α-微管蛋白(TUBA1A)和β-微管蛋白(TUBB和TUBB3)。在蛋白质-蛋白质相互作用结果中,他们发现许多非微管蛋白与微管蛋白相互作用,其中6种(HTT、DPYSL2、SKI、UNC5C、NINL和DDX41)被发现与它们的生物学功能密切相关。该研究使用Gene Ontology工具建立了一个有前景的模型系统,通过缩小微管相关蛋白质作为癌症、阿尔茨海默病、神经退行性疾病等疾病的治疗靶点[8]。

Vadgama等人通过全外显子测序和拷贝数变异(CNV)筛选,研究了13对单卵双生子(MZ)的临床表型差异。他们发现了一个de novo变异,位于PLCB1基因中,该基因参与乳牛乳脂磷脂的水解,与乳糖不耐症相关。他们还发现了一个位于线粒体复合物I基因MT-ND5中的变异,与肌萎缩侧索硬化症(ALS)相关。他们还在另一对MZ双生子中发现多个基因的体细胞变异,包括TMEM225B、KBTBD3、TUBGCP4和TFIP11,这对双生子存在ALS的表型差异。他们还发现了一个罕见的15q11.2 BP1-BP2重叠ARHGAP11B的缺失,在一对表现为精神分裂症样人格障碍或精神分裂症的双生子中。此外,他们还发现了一个de novo变异,位于RASD2基因中,与一对8岁男性双生子中疑似自闭症谱系障碍(ASD)的表型差异相关。此外,他们还发现了一对表型不一致的双生子中存在一个de novo CNV复制,该复制与CD38基因重叠,该基因先前被认为与ASD有关[9]。

Neben等人研究了套细胞淋巴瘤(MCL)中中心体相关基因产物的表达与四倍体化的关系。他们发现,在MCL中,一个具有显著四倍体倾向的细胞变异体被识别出来。中心体异常最近被证明在许多人类恶性肿瘤中引起非整倍性,包括MCL,通过有丝分裂后期染色体的错误分离。他们最近的研究表明,与二倍体MCL相比,四倍体MCL中中心体异常的发生频率更高。为了验证中心体相关基因产物表达与MCL四倍体化之间的关联,他们对33例MCL样品的肿瘤RNA进行了杂交,使用定制的cDNA微阵列,代表4,628个独特的人类基因特异性片段,特别是富集了与癌症相关的(2,440个)和中心体相关的基因(359个)。值得注意的是,区分二倍体和近四倍体MCL的6个最显著基因中的4个(CAMKK2、PCNT2、TUBGCP3和TUBGCP4)编码中心体蛋白。定量RT-PCR分析证实,钙/钙调素依赖性蛋白激酶II(CAMKK2)、周围蛋白(PCNT2)和γ-微管蛋白复合物相关蛋白3(TUBGCP3)在近四倍体MCL样品中的表达水平显著高于二倍体MCL样品。总的来说,他们描述了一组与MCL四倍体化相关的基因表达特征。在MCL中,中心体相关基因产物的表达水平升高与中心体异常的描述相符[10]。

综上所述,TUBGCP4基因在维持视网膜光感受器稳态、胚胎发育和细胞骨架组织等方面发挥着重要作用。TUBGCP4的突变或缺失与多种疾病相关,包括微头症、脉络膜视网膜病变和视网膜光感受器变性等。此外,TUBGCP4还与细胞自噬和微管组织中心相关,参与调节细胞功能和疾病发生机制。深入研究TUBGCP4的功能和机制将为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Xu, Xu, Shang, Dantong, Cheng, Hanhua, Klionsky, Daniel J, Zhou, Rongjia. 2019. Gene essentiality of Tubgcp4: dosage effect and autophagy regulation in retinal photoreceptors. In Autophagy, 15, 1834-1837. doi:10.1080/15548627.2019.1647023. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31345090/
2. Da Palma, Mariana Matioli, Motta, Fabiana Louise, Takitani, Guilherme Eiichi Da Silva, Lima, Luiz Henrique, Ferraz Sallum, Juliana Maria. 2020. TUBGCP4 - associated microcephaly and chorioretinopathy. In Ophthalmic genetics, 41, 189-193. doi:10.1080/13816810.2020.1747084. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32270730/
3. Martín Fernández-Mayoralas, Daniel, Albert, Jacobo, López-Martín, Sara, Álvarez, Sara, Fernández-Jaén, Alberto. 2021. Bi-Allelic c.1746G>T; p.Leu582= Variants in TUBGCP4 in a Boy with Autism: Clinical Data and Literature Review. In Molecular syndromology, 13, 165-170. doi:10.1159/000519365. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35418825/
4. Scheidecker, Sophie, Etard, Christelle, Haren, Laurence, Moore, Anthony T, Dollfus, Hélène. 2015. Mutations in TUBGCP4 alter microtubule organization via the γ-tubulin ring complex in autosomal-recessive microcephaly with chorioretinopathy. In American journal of human genetics, 96, 666-74. doi:10.1016/j.ajhg.2015.02.011. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25817018/
5. Maver, Aleš, Čuturilo, Goran, Kovanda, Anja, Miletić, Aleksandra, Peterlin, Borut. 2018. Rare missense TUBGCP5 gene variant in a patient with primary microcephaly. In European journal of medical genetics, 62, 103598. doi:10.1016/j.ejmg.2018.12.003. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30543990/
6. Bayram-Suverza, Mauricio, Torres-Navarro, Karla Alejandra, Hernández-Vázquez, Ángeles Yahel, Ramírez-Estudillo, Juan Abel. 2023. Microcephaly and Chorioretinopathy Relevance as a Differential Diagnosis. In Diagnostics (Basel, Switzerland), 13, . doi:10.3390/diagnostics13152588. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37568951/
7. Li, Zhigang, Li, Huirong, Xu, Xu, Cheng, Hanhua, Zhou, Rongjia. 2019. Haploinsufficiency of GCP4 induces autophagy and leads to photoreceptor degeneration due to defective spindle assembly in retina. In Cell death and differentiation, 27, 556-572. doi:10.1038/s41418-019-0371-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31209365/
8. Ramesh Babu, Polani B. 2023. Prediction of anti-microtubular target proteins of tubulins and their interacting proteins using Gene Ontology tools. In Journal, genetic engineering & biotechnology, 21, 78. doi:10.1186/s43141-023-00531-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37466845/
9. Vadgama, Nirmal, Pittman, Alan, Simpson, Michael, Hardy, John, Nasir, Jamal. 2019. De novo single-nucleotide and copy number variation in discordant monozygotic twins reveals disease-related genes. In European journal of human genetics : EJHG, 27, 1121-1133. doi:10.1038/s41431-019-0376-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30886340/
10. Neben, Kai, Ott, German, Schweizer, Silja, Lichter, Peter, Krämer, Alwin. . Expression of centrosome-associated gene products is linked to tetraploidization in mantle cell lymphoma. In International journal of cancer, 120, 1669-77. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17236200/