Xrra1-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Xrra1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-10167

品系全称

C57BL/6JCya-Xrra1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-446101-Xrra1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Xrra1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-10167) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
X-ray radiation resistance associated 1
基因别称
-
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001164258.1 | Ensembl: ENSMUST00000036155
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4~7
敲除长度
~8186 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因XRRA1,也称为X-ray radiation resistance associated 1,是一种在人类和猕猴睾丸中高表达的基因。该基因的发现源于对肿瘤细胞对X射线辐射响应的遗传基础的调查。研究人员从未经照射的人结肠癌细胞系HCT116中分离出对X射线辐射响应不同的克隆,并利用人cDNA微阵列分析发现了XRRA1基因[1]。XRRA1基因由11个外显子组成,全长约64kb,位于染色体11q13.3上。人类和猕猴的cDNA序列共享96%的同源性,表明该基因在哺乳动物中高度保守[1]。

XRRA1蛋白在人类、猕猴、小鼠、大鼠、猪和牛中高度保守,提示其可能具有相似的功能。XRRA1蛋白在HCT116克隆和COS-7细胞中主要定位于细胞核和细胞质[1]。有趣的是,研究发现,COS-7细胞过表达XRRA1后,其细胞核中缺乏Ku86(Ku80,XRCC5),这是一种非同源末端连接(NHEJ)DNA修复分子[1]。这表明XRRA1可能参与了DNA修复过程。

进一步的研究表明,XRRA1在多种肿瘤细胞类型中表达,并且可能与癌症的发展有关[1]。此外,XRRA1可能是一个早期表达的基因。在大鼠胚胎干细胞R1中检测到小鼠Xrra1,这表明XRRA1可能在胚胎发育中发挥作用[1]。

XRRA1基因的表达与细胞周期和DNA修复相关。研究发现,阻断XRRA1的表达可以导致细胞周期G2/M期阻滞,这是通过调节细胞周期蛋白A、细胞周期蛋白E和p21蛋白来实现的[2]。此外,XRRA1的表达可以减少细胞周期阻滞并增加细胞增殖[2]。这表明XRRA1可能参与了细胞周期的调控。

在DNA修复方面,低表达XRRA1的癌细胞在暴露于药物和电离辐射时,DNA修复途径因子CHK1、CHK2和ATM的磷酸化水平增加,而γ-H2AX的表达水平降低[2]。γ-H2AX被认为参与核DNA修复[2]。这些结果表明,XRRA1可能通过调节ATM/CHK1/2途径参与DNA损伤反应,从而影响放射和化疗的抵抗性[2]。

除了在癌症中的作用,XRRA1基因还与生殖性状有关。在全基因组关联研究中,研究人员发现XRRA1基因与羊的产羔性状和乳房性状相关[3]。这表明XRRA1基因可能在动物繁殖中发挥作用。

慢性砷暴露会导致人类角质形成细胞中差异替代剪接事件的发生。研究发现,长期暴露于砷的HaCaT细胞中,至少有600个差异替代剪接事件被检测到,包括所有五种主要的替代剪接类型,并且发生在开放阅读框(ORFs)和 untranslated regions(UTRs)中[4]。这表明慢性砷暴露可能通过影响替代剪接来改变基因表达和蛋白质组学特征,进而影响致癌过程。

此外,XRRA1基因还与白细胞计数相关。研究发现,白细胞计数轨迹与染色体1p34.3和染色体11q13.4上的区域相关,其中染色体11区域包含RNF169和XRRA1基因,这两个基因都参与双链断裂DNA修复的调节[5]。

最后,柴油尾气颗粒物(DEP)暴露会改变小鼠睾丸中的基因表达。研究发现,DEP暴露后,克隆R8的表达水平增加了2.3倍,该克隆与人类XRRA1高度相似[6]。这表明DEP可能通过影响基因表达来影响睾丸功能。

综上所述,XRRA1基因在多种生物学过程中发挥作用,包括DNA修复、细胞周期调控、生殖性状、白细胞计数和睾丸功能。XRRA1基因的表达和功能可能与癌症、生殖和免疫系统的健康有关。进一步研究XRRA1基因的功能和机制将为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Mesak, Felix M, Osada, Naoki, Hashimoto, Katsuyuki, Liu, Qing Y, Ng, Cheng E. 2003. Molecular cloning, genomic characterization and over-expression of a novel gene, XRRA1, identified from human colorectal cancer cell HCT116Clone2_XRR and macaque testis. In BMC genomics, 4, 32. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12908878/
2. Wang, Wenjun, Guo, Minzhang, Xia, Xiaojun, Zeng, Yuan, Wu, Sipei. 2017. XRRA1 Targets ATM/CHK1/2-Mediated DNA Repair in Colorectal Cancer. In BioMed research international, 2017, 5718968. doi:10.1155/2017/5718968. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29082250/
3. Fang, Xingqiang, Gu, Bowen, Chen, Meixi, Zhao, Le, Zhao, Yongju. 2023. Genome-Wide Association Study of the Reproductive Traits of the Dazu Black Goat (Capra hircus) Using Whole-Genome Resequencing. In Genes, 14, . doi:10.3390/genes14101960. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37895309/
4. Ferragut Cardoso, Ana P, Banerjee, Mayukh, Al-Eryani, Laila, Park, Juw W, States, J Christopher. 2022. Temporal Modulation of Differential Alternative Splicing in HaCaT Human Keratinocyte Cell Line Chronically Exposed to Arsenic for up to 28 Wk. In Environmental health perspectives, 130, 17011. doi:10.1289/EHP9676. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35072517/
5. Hall, Taryn O, Stanaway, Ian B, Carrell, David S, Jarvik, Gail P, Crosslin, David R. 2018. Unfolding of hidden white blood cell count phenotypes for gene discovery using latent class mixed modeling. In Genes and immunity, 20, 555-565. doi:10.1038/s41435-018-0051-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30459343/
6. Mori, Tetsuya, Watanuki, Taro, Kashiwagura, Tadashi. . Diesel exhaust particles disturb gene expression in mouse testis. In Environmental toxicology, 22, 58-63. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17295261/