Hdac1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Hdac1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-10095

品系全称

C57BL/6JCya-Hdac1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-433759-Hdac1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Hdac1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-10095) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型
Notch信号通路
TGF-β信号通路

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
histone deacetylase 1
基因别称
HD1,Hdac1-ps,MommeD5,RPD3
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_008228 | Ensembl: ENSMUST00000102597
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:108086Mice homozygous for disruptions in this gene die as embryos between E9.5 and E10.5.
HDAC1,即组蛋白去乙酰化酶1,是组蛋白去乙酰化酶家族中的成员之一。组蛋白去乙酰化酶家族是一类能够去除组蛋白赖氨酸残基上的乙酰基团的酶,从而影响染色质的结构和基因的表达。HDAC1的活性可以导致染色质结构的紧密化,使得基因的表达受到抑制。HDAC1不仅在组蛋白的去乙酰化过程中发挥作用,还可以作用于非组蛋白蛋白,进一步调控细胞的生物学过程。

在多种生物学过程中,HDAC1发挥着重要的作用。例如,HDAC1可以与SPI1/PU.1蛋白结合,通过去乙酰化作用抑制基因的表达。SPI1/PU.1是一种重要的转录因子,在造血过程中发挥关键作用。然而,在某些情况下,SPI1/PU.1也可以发挥转录抑制的功能。HDAC1通过去乙酰化作用,抑制了SPI1/PU.1结合的增强子区域,进而抑制了基因的表达[1]。

此外,HDAC1还参与了DNA损伤修复过程。在脑老化过程中,DNA损伤会积累并导致认知功能下降。研究发现,HDAC1可以调节OGG1介导的氧化DNA损伤修复。HDAC1的缺失会导致DNA损伤的积累和认知功能的下降。HDAC1可以激活OGG1,一种DNA糖基化酶,去除8-oxoG损伤,从而抑制转录。HDAC1的缺失会导致OGG1活性降低,8-oxoG积累在脑功能基因的启动子上,并导致转录抑制。在阿尔茨海默病模型小鼠中,HDAC1活性的降低和基因表达的下调也得到了证实[2]。

HDAC1还参与了细胞增殖和分化的调控。例如,HDAC1可以与Runx2蛋白结合,抑制Runx2介导的骨桥蛋白基因的表达。Runx2是一种重要的转录因子,在成骨过程中发挥关键作用。HDAC1通过与Runx2结合,抑制了Runx2诱导的骨桥蛋白基因的表达,从而影响了细胞的增殖和分化过程[3]。

HDAC1的活性状态与启动子的活性状态密切相关。研究发现,HDAC1与启动子的动态相互作用受到启动子活性的调节。在启动子未激活状态下,HDAC1的交换率较慢;而在启动子活性达到峰值时,HDAC1的交换率显著增加;在启动子活性受到抑制时,HDAC1的交换率又恢复到未激活状态。这表明HDAC1的活性状态与启动子的活性状态密切相关,并且HDAC1的动态交换对转录调控起着重要作用[4]。

HDAC1还可以与其他转录因子相互作用,调节基因的表达。例如,HDAC1可以与C/EBPß蛋白相互作用,抑制5-羟色胺转运蛋白基因的表达。5-羟色胺转运蛋白基因的表达受到HDAC1的调控,HDAC1的缺失会导致5-羟色胺转运蛋白基因的表达上调。此外,HDAC1还可以与TRIM5α蛋白相互作用,抑制HIV-1的转录。TRIM5α可以结合并增强HDAC1的招募,导致H3K9的去乙酰化,从而抑制HIV-1的转录[5,6]。

HDAC1还可以与其他蛋白质相互作用,影响基因的表达。例如,HDAC1可以与Fli1蛋白和p300蛋白相互作用,抑制人α2(I)胶原基因的表达。Fli1是一种转录因子,可以抑制人α2(I)胶原基因的表达。HDAC1可以与Fli1结合,导致Fli1的去乙酰化,从而增强Fli1的DNA结合能力。此外,HDAC1还可以与TRIM46蛋白相互作用,促进HDAC1的降解,从而影响基因的表达和肿瘤的发生[7,8]。

HDAC1还可以与其他蛋白质相互作用,影响基因的表达。例如,HDAC1可以与Fli1蛋白和p300蛋白相互作用,抑制人α2(I)胶原基因的表达。Fli1是一种转录因子,可以抑制人α2(I)胶原基因的表达。HDAC1可以与Fli1结合,导致Fli1的去乙酰化,从而增强Fli1的DNA结合能力。此外,HDAC1还可以与TRIM46蛋白相互作用,促进HDAC1的降解,从而影响基因的表达和肿瘤的发生[7,8]。

综上所述,HDAC1是一种重要的组蛋白去乙酰化酶,参与调控染色质的结构和基因的表达。HDAC1的活性受到多种因素的影响,包括转录因子、DNA损伤修复和蛋白质相互作用等。HDAC1的活性状态与启动子的活性状态密切相关,并且HDAC1的动态交换对转录调控起着重要作用。HDAC1的研究有助于深入理解染色质调控的机制和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Gregoricchio, Sebastian, Polit, Lélia, Esposito, Michela, Boeva, Valentina, Guillouf, Christel. . HDAC1 and PRC2 mediate combinatorial control in SPI1/PU.1-dependent gene repression in murine erythroleukaemia. In Nucleic acids research, 50, 7938-7958. doi:10.1093/nar/gkac613. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35871293/
2. Pao, Ping-Chieh, Patnaik, Debasis, Watson, L Ashley, Haggarty, Stephen J, Tsai, Li-Huei. 2020. HDAC1 modulates OGG1-initiated oxidative DNA damage repair in the aging brain and Alzheimer's disease. In Nature communications, 11, 2484. doi:10.1038/s41467-020-16361-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32424276/
3. Zhang, Zhongli, Deepak, Vishwa, Meng, Lingyi, Zeng, Xianlu, Liu, Wenguang. 2011. Analysis of HDAC1-mediated regulation of Runx2-induced osteopontin gene expression in C3h10t1/2 cells. In Biotechnology letters, 34, 197-203. doi:10.1007/s10529-011-0756-8. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21972143/
4. Qiu, Yi, Stavreva, Diana A, Luo, Yi, Chang, Myron, Hager, Gordon L. 2010. Dynamic interaction of HDAC1 with a glucocorticoid receptor-regulated gene is modulated by the activity state of the promoter. In The Journal of biological chemistry, 286, 7641-7. doi:10.1074/jbc.M110.185488. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21127047/
5. Phi van, Daniel K, Mühlbauer, Eckhard, Phi-van, Loc. 2015. Histone deacetylase HDAC1 downregulates transcription of the serotonin transporter (5-HTT) gene in tumor cells. In Biochimica et biophysica acta, 1849, 909-18. doi:10.1016/j.bbagrm.2015.05.008. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26024595/
6. Ran, Xiang-Hong, Zhu, Jia-Wu, Ni, Run-Ze, Zheng, Wei-Hua, Mu, Dan. 2023. TRIM5α recruits HDAC1 to p50 and Sp1 and promotes H3K9 deacetylation at the HIV-1 LTR. In Nature communications, 14, 3343. doi:10.1038/s41467-023-39056-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37291137/
7. Asano, Yoshihide, Trojanowska, Maria. 2013. Fli1 represses transcription of the human α2(I) collagen gene by recruitment of the HDAC1/p300 complex. In PloS one, 8, e74930. doi:10.1371/journal.pone.0074930. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24058639/
8. Zhang, Zihan, Liu, Xiaoping, Li, Lei, Liang, Jing, Shang, Yongfeng. 2021. SNP rs4971059 predisposes to breast carcinogenesis and chemoresistance via TRIM46-mediated HDAC1 degradation. In The EMBO journal, 40, e107974. doi:10.15252/embj.2021107974. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34459501/