BC048507-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

BC048507-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-10023

品系全称

C57BL/6JCya-BC048507em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-408058-BC048507-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: BC048507-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-10023) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
cDNA sequence BC048507
基因别称
-
染色体号
Chr 13 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001001185.3 | Ensembl: ENSMUST00000078471
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~267 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因BC048507是一种与乳腺癌相关的基因。乳腺癌是一种异质性疾病,其中大多数病例(约70%)被认为是散发的,而家族性乳腺癌(约30%的患者)则通常与家族中乳腺癌的高发病率相关。家族性乳腺癌与一些高、中、低外显率的易感基因相关,如BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53等。此外,DNA修复相关的基因如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO)也与中度的乳腺癌风险相关[2]。

在基因进化方面,基因复制和基因丢失是动物基因组进化中频繁发生的事件。基因复制后,两个子代基因通常会以大约相等的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是高度不均匀的,一个拷贝会与其同源基因发生显著的分化。这种“不对称进化”在串联基因复制后比在全基因组复制后更为常见,并且可以产生实质性的新基因。例如,在蛾、软体动物和哺乳动物的复制同源基因中观察到不对称进化,每个案例都产生了新的同源基因,并被招募到新的发育角色中[1]。

基因调控网络在细胞现象的起源中起着中心作用。基因和蛋白质之间的连接性产生了类似于复杂电子电路的分子网络图,而系统性的理解需要开发描述电路的数学框架。从工程学的角度来看,构建和分析构成网络的底层子模块是走向此类框架的自然路径。最近在测序和基因工程方面的实验进展使得这种方法成为可能,通过设计和实施可进行数学建模和定量分析的合成基因网络。这些发展标志着基因电路学科的兴起,它提供了一个预测和评估细胞过程动力学的框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能在功能基因组学、纳米技术和基因与细胞治疗中具有重要作用[3]。

基因敲除可以产生完全丧失功能的基因型,是研究基因功能的一种常用方法。基因敲除最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中大约四分之一的基因可以是必需的。与基因型-表型关系一样,基因必需性受背景效应的影响,并且由于基因-基因相互作用而可能发生变化。对于某些必需基因,敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子来拯救。这种“必需性绕过”(BOE)的基因-基因相互作用是一种未被充分研究的遗传抑制类型。最近的系统分析表明,在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中,近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用来绕过[4]。

植物CARE是一个数据库,包含植物顺式作用调节元件、增强子和抑制因子。调节元件通过位置矩阵、一致序列和特定启动子序列上的单个位点来表示。当可用时,提供与EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。转录位点的数据主要从文献中提取,并补充了越来越多的计算机预测数据。除了特定转录因子位点的通用描述外,还提供了对实验证据置信度、功能信息和启动子位置的信息。新功能已实现,以在查询序列中搜索植物顺式作用调节元件。此外,现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因簇。新的调节元件可以自动发送,并在编辑后添加到数据库中。植物CARE关系数据库可通过世界 Wide Web在http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCARE/上获得[5]。

基因BC048507作为乳腺癌相关基因,其研究对于理解乳腺癌的发生机制和风险因素具有重要意义。BC048507可能参与了乳腺癌的遗传易感性和发病机制,并且可能与DNA修复和基因调控网络相关。进一步研究BC048507的功能和机制将有助于开发新的乳腺癌诊断和治疗方法,并提高患者的生活质量。

参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/