Macroh2a2-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Macroh2a2-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-10006

品系全称

C57BL/6JCya-Macroh2a2em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-404634-Macroh2a2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Macroh2a2-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-10006) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
macroH2A.2 histone
基因别称
H2afy2
染色体号
Chr 10 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_207000 | Ensembl: ENSMUST00000020283
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~0.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:3037658Mice homozygous for a knock-out allele do not exhibit any developmental or reproductive abnormalities.
MacroH2A2,也称为H2A.FY2,是宏H2A家族的一种核心组蛋白变体。宏H2A是一种独特的组蛋白变体,其结构包括一个氨基末端结构域,该结构域与全长组蛋白H2A非常相似,随后是一个大的非组蛋白区域。在人类中,MacroH2A家族由两个基因编码:MACROH2A1和MACROH2A2,分别位于染色体5和10上。MACROH2A1基因通过选择性剪接产生两种亚型:MACROH2A1.1和MACROH2A1.2。MACROH2A2是最近发现的MACROH2A家族的新成员,其氨基酸序列与MACROH2A1.2有68%的相似性。免疫荧光研究表明,MACROH2A2与MACROH2A1.2一样,在非活性X染色体上富集。然而,MACROH2A2在肝脏和肾脏中的细胞类型中的表达模式与MACROH2A1.2非常不同[4]。这些发现表明,MACROH2A亚型可能在发育过程中发挥作用。

在基因调控方面,MacroH2A2通过影响染色质结构和转录因子的结合来调节基因表达。研究表明,MACROH2A2和MACROH2A1.2通过调节增强子和启动子之间的相互作用来影响增强子活性和对炎症细胞因子的敏感性。去除MACROH2A1.2和MACROH2A2会影响启动子和远端增强子之间的接触频率,导致增强子活性改变或对肿瘤坏死因子α(TNF-α)的响应提前。MACROH2A1.2和MACROH2A2在基因表达的双向调节中发挥作用,它们整体上促进核因子κB(NF-κB)介导的响应。相比之下,MACROH2A1.2和MACROH2A2抑制对促炎细胞因子干扰素γ的响应。MACROH2A2对基因抑制的贡献比MACROH2A1.2更强[3]。

此外,研究表明,MACROH2A2通过影响染色质可及性来调节基因表达。MACROH2A2在增强子元件上塑造染色质可及性,以对抗自我更新的转录程序。MACROH2A2还通过激活病毒模拟反应使细胞对基于小分子的细胞死亡敏感。临床队列分析表明,这种组蛋白变体的高转录水平与高级别胶质瘤患者更好的预后相关[1]。

MACROH2A2的沉积机制尚不完全清楚。研究表明,MACROH2A2最初在基因组范围内广泛沉积,包括稳态域和相邻的转录区域。随后,转录区域的MACROH2A2被修剪,形成成熟的MACROH2A2域。转录的化学抑制可以抵消MACROH2A2的修剪。此外,基因激活会耗尽预先存在的MACROH2A2,而沉默会触发MACROH2A2的异常积累。进一步研究表明,FACT(facilitates chromatin transcription)复合物对于转录染色质中MACROH2A2的修剪是必需的。这些发现表明,活跃的染色质是MACROH2A域的边界,通过转录相关的“修剪”机制来建立和维持MACROH2A变体的忠实基因组定位[2]。

MACROH2A2在维持胚胎干细胞(ES)的多能性方面也发挥着重要作用。在ES细胞中,MACROH2A2在启动子区域表现出相对快速的交换动力学,尤其是在高度转录的基因上。然而,在分化为胚胎成纤维细胞后,MACROH2A2主要在基因贫乏区域的额外长且稳定相关的块中获得,而启动子区域的整体周转大大减弱。这些结果表明,MACROH2A2在多能细胞中表现出意外的动态行为,并为未来研究体内组织特异性组蛋白动态提供了一个资源[7]。

MACROH2A2还在癌症中发挥作用。研究表明,在结直肠癌细胞中,15-LOX-1的缺乏通过下调MACROH2A2的表达导致放射抗性。MACROH2A2的表达在sh15-LOX-1细胞中比shCon细胞低七倍。这些发现表明,MACROH2A2可能通过调节DNA损伤反应来抑制放射诱导的DNA损伤,并通过延迟H2AX激活来抑制放射抗性[8]。

MACROH2A2的缺失对基因表达有显著影响。在缺乏MACROH2A1和MACROH2A2的小鼠中,MACROH2A1和MACROH2A2在基因表达中的影响显示出很大的重叠。在胎儿和成年肝脏中,MACROH2A1和MACROH2A2对基因表达的影响非常具体,并且主要涉及与脂质代谢相关的基因,包括瘦素受体。MACROH2A依赖的基因调控在出生后发育中发生了显著变化,并可能受到禁食的强烈影响。这些结果表明,MACROH2A通过产生适应性的基因表达变化来调节基因表达,这些变化在肝脏中主要涉及代谢[5]。

除了在基因表达中的作用外,MACROH2A2还具有潜在的抗菌活性。研究表明,来自金色鲷(Trachinotus ovatus)的MACROH2A2和H2B组蛋白衍生的肽具有抗菌活性,可以抑制各种水生病原体的生长,包括链球菌、金黄色葡萄球菌、枯草杆菌、鲍曼不动杆菌、嗜水气单胞菌和大肠杆菌。这些肽可以破坏细胞表面结构,穿透细胞膜,导致细胞内容物泄漏,从而发挥其抗菌作用。此外,这些肽通过与细菌基因组DNA结合来参与抗菌活性,降低gDNA的迁移率[6]。

综上所述,MACROH2A2是一种独特的组蛋白变体,通过影响染色质结构和转录因子的结合来调节基因表达。MACROH2A2在多种生物学过程中发挥作用,包括细胞分化、发育、代谢和疾病发生。MACROH2A2的研究有助于深入理解染色质调控和基因表达的机制,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Nikolic, Ana, Maule, Francesca, Bobyn, Anna, De Carvalho, Daniel D, Gallo, Marco. 2023. macroH2A2 antagonizes epigenetic programs of stemness in glioblastoma. In Nature communications, 14, 3062. doi:10.1038/s41467-023-38919-2. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37244935/
2. Sun, Zhen, Filipescu, Dan, Andrade, Joshua, Ueberheide, Beatrix, Bernstein, Emily. 2018. Transcription-associated histone pruning demarcates macroH2A chromatin domains. In Nature structural & molecular biology, 25, 958-970. doi:10.1038/s41594-018-0134-5. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30291361/
3. Corujo, David, Malinverni, Roberto, Carrillo-Reixach, Juan, Armengol, Carolina, Buschbeck, Marcus. . MacroH2As regulate enhancer-promoter contacts affecting enhancer activity and sensitivity to inflammatory cytokines. In Cell reports, 39, 110988. doi:10.1016/j.celrep.2022.110988. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35732123/
4. Costanzi, C, Pehrson, J R. 2001. MACROH2A2, a new member of the MARCOH2A core histone family. In The Journal of biological chemistry, 276, 21776-84. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11262398/
5. Pehrson, John R, Changolkar, Lakshmi N, Costanzi, Carl, Leu, N Adrian. 2014. Mice without macroH2A histone variants. In Molecular and cellular biology, 34, 4523-33. doi:10.1128/MCB.00794-14. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25312643/
6. Liang, Yu, Pan, Jin-Min, Zhu, Ke-Cheng, Zhu, Teng-Fei, Zhang, Dian-Chang. 2024. Molecular characterization of histone gene in golden pompano (Trachinotus ovatus) and antimicrobial activity of its derived peptides. In Fish & shellfish immunology, 153, 109860. doi:10.1016/j.fsi.2024.109860. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39209007/
7. Yildirim, Ozlem, Hung, Jui-Hung, Cedeno, Ryan J, Lengner, Christopher J, Rando, Oliver J. 2014. A system for genome-wide histone variant dynamics in ES cells reveals dynamic MacroH2A2 replacement at promoters. In PLoS genetics, 10, e1004515. doi:10.1371/journal.pgen.1004515. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25102063/
8. Na, Yoo Jin, Kim, Bo Ram, Kim, Jung Lim, Oh, Sang Cheul, Lee, Dae-Hee. 2019. Deficiency of 15-LOX-1 Induces Radioresistance through Downregulation of MacroH2A2 in Colorectal Cancer. In Cancers, 11, . doi:10.3390/cancers11111776. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31717983/