Atxn7l3b-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Atxn7l3b-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-09872

品系全称

C57BL/6JCya-Atxn7l3bem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-382423-Atxn7l3b-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Atxn7l3b-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-09872) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ataxin 7-like 3B
基因别称
4921506J03Rik,6230409E21Rik
染色体号
Chr 10 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001033474.2 | Ensembl: ENSMUST00000099276
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~289 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Atxn7l3b,也称为Ataxin 7 Like 3B,是一种在生物医学研究中逐渐受到关注的基因。该基因编码的蛋白质在细胞核内发挥重要作用,尤其是在Spt-Ada-Gcn5乙酰转移酶(SAGA)去泛素化酶(DUB)模块中。SAGA复合体是染色质修饰的关键参与者,它包含两个酶模块,分别负责组蛋白乙酰转移酶(HAT)和去泛素化酶(DUB)活性。ATXN7L3B与SAGA复合体的DUB模块中的其他成分相互作用,如USP22和ENY2,这些相互作用对于H2Bub1的去泛素化过程至关重要。H2Bub1是组蛋白H2B的一种泛素化形式,它在基因转录调控中发挥作用。

ATXN7L3B在细胞质中定位,但可以与ENY2相互作用,影响H2Bub1的水平。研究表明,ATXN7L3B过表达会增加H2Bub1的水平,而ATXN7L3的过表达则会降低H2Bub1的水平。此外,ATXN7L3B可以与ATXN7L3竞争结合ENY2,在体内敲低ATXN7L3B会导致ENY2的损失。ATXN7L3B的这种调节作用表明它可能通过竞争ENY2结合来调节H2Bub1水平和SAGA DUB活性[2]。

在癌症研究中,ATXN7L3B的表达与肝细胞癌(HCC)患者的生存率显著负相关。ATXN7L3B的表达与HCC的干细胞特性有关,它促进了HCC的干细胞特性。研究发现,二甲双胍可以降低HCC细胞中ATXN7L3B的水平,并且二甲双胍处理可以减少ATXN7L3B诱导的肿瘤起始能力,这表明二甲双胍可能通过下调ATXN7L3B来抑制癌症的干细胞特性[1]。此外,ATXN7L3B的基因多态性与性别特异性结直肠癌风险相关,特别是对于男性结直肠癌患者,rs590352位点的基因型和等位基因分布存在显著差异[3]。

ATXN7L3B还与神经发育和神经退行性疾病有关。在一项研究中,一个家族由于12号染色体q21区的缺失,影响了ATXN7L3B和KCNC2两个基因,该家族成员表现出不同程度的运动和认知发育迟缓以及小脑共济失调。这表明ATXN7L3B可能在小脑功能和神经发育中发挥重要作用[4]。另外,ATXN7L3B的表达与mRNA输出因子GANP的表达有关,GANP的缺陷与神经发育疾病相关,ATXN7L3B的表达改变可能影响RNA代谢和基因表达,进而影响神经发育[5]。

综上所述,ATXN7L3B是一种在细胞核内发挥重要作用的基因,它在SAGA DUB模块中调节H2Bub1水平和SAGA DUB活性。ATXN7L3B与多种疾病相关,包括肝细胞癌、结直肠癌和神经发育疾病。ATXN7L3B的研究有助于深入理解其在基因表达调控和疾病发生中的作用,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Chen, Bi, Cha, Jong-Ho, Yan, Meisi, Yan, Xiuwen, Yang, Wen-Hao. 2021. ATXN7L3B promotes hepatocellular carcinoma stemness and is downregulated by metformin. In Biochemical and biophysical research communications, 573, 1-8. doi:10.1016/j.bbrc.2021.08.009. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34375763/
2. Li, Wenqian, Atanassov, Boyko S, Lan, Xianjiang, Workman, Jerry L, Dent, Sharon Y R. 2016. Cytoplasmic ATXN7L3B Interferes with Nuclear Functions of the SAGA Deubiquitinase Module. In Molecular and cellular biology, 36, 2855-2866. doi:10.1128/MCB.00193-16. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27601583/
3. Leberfarb, Elena Yu, Degtyareva, Arina O, Brusentsov, Ilya I, Sokolov, Andrey V, Merkulova, Tatiana I. 2019. Potential regulatory SNPs in the ATXN7L3B and KRT15 genes are associated with gender-specific colorectal cancer risk. In Personalized medicine, 17, 43-54. doi:10.2217/pme-2019-0059. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31797724/
4. Rajakulendran, Sanjeev, Roberts, Joanna, Koltzenburg, Martin, Hanna, Michael G, Stewart, Helen. 2013. Deletion of chromosome 12q21 affecting KCNC2 and ATXN7L3B in a family with neurodevelopmental delay and ataxia. In Journal of neurology, neurosurgery, and psychiatry, 84, 1255-7. doi:10.1136/jnnp-2012-304555. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23475819/
5. Woldegebriel, Rosa, Kvist, Jouni, Andersson, Noora, Ylikallio, Emil, Tyynismaa, Henna. . Distinct effects on mRNA export factor GANP underlie neurological disease phenotypes and alter gene expression depending on intron content. In Human molecular genetics, 29, 1426-1439. doi:10.1093/hmg/ddaa051. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32202298/