Thap6-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Thap6-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-09790

品系全称

C57BL/6JCya-Thap6em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-381650-Thap6-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Thap6-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-09790) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
THAP domain containing 6
基因别称
4930534K21Rik
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NR_028429 | Ensembl: ENSMUST00000191860
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~5
敲除长度
~7.4 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Thap6,即THAP域蛋白6,是一种包含THAP结构域的转录因子,THAP结构域是一种C2H2锌指结构域,通过识别并结合特定的DNA序列来调节基因表达。THAP域蛋白在细胞分化、发育和多种生物学过程中发挥重要作用。Thap6的具体功能目前尚不完全清楚,但已有研究指出其在某些细胞类型中具有转录调控功能,参与基因表达调控。

在一项研究中,研究者使用deepCAGE转录组学技术研究了经典活化和替代活化巨噬细胞(M1和M2)的转录调控动态。deepCAGE是一种基于高通量测序的转录组分析技术,可以提供高分辨率和全转录本的转录组信息。研究发现,M1和M2活化过程中,转录因子(TF)结合基序活性分析揭示了四个常见的活性基序,包括NFKB1_REL_RELA、IRF1,2、IRF7和TBP。这些基序在M1和M2活化过程中具有不同的活性动态。研究者还观察到相应TFs表达谱的匹配变化,并发现只有一小部分TFs在活化过程中发生了表达变化。M1活化过程中,TFs的表达出现了整体剧烈而短暂的上调,而M2活化过程中,TFs的表达上调较弱且更持久。此外,研究还发现了一些新型TFs,如Thap6、Maff(M1)和Hivep1、Nfil3、Prdm1(M2)等,它们可能参与活化过程。此外,研究还首次识别出52个(M1)和67个(M2)新型差异表达基因,以及一些差异表达的lncRNA转录本标记。这些发现对于全面理解巨噬细胞活化的转录调控机制具有重要意义[1]。

综上所述,Thap6作为一种包含THAP结构域的转录因子,在M1和M2活化过程中可能发挥重要的转录调控功能。研究结果表明,Thap6可能参与调控巨噬细胞的活化过程,影响基因表达和生物学过程。进一步研究Thap6的功能和调控机制,有助于深入理解巨噬细胞活化的转录调控网络,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Roy, Sugata, Schmeier, Sebastian, Arner, Erik, Brombacher, Frank, Suzuki, Harukazu. 2015. Redefining the transcriptional regulatory dynamics of classically and alternatively activated macrophages by deepCAGE transcriptomics. In Nucleic acids research, 43, 6969-82. doi:10.1093/nar/gkv646. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26117544/