Tbc1d2-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Tbc1d2-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-09784

品系全称

C57BL/6JCya-Tbc1d2em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-381605-Tbc1d2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Tbc1d2-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-09784) were purchased from Cyagen.
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
TBC1 domain family, member 2
基因别称
A630005A06Rik,Gm1037,PARIS-1,PARIS1
染色体号
Chr 4 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_198664.3 | Ensembl: ENSMUST00000084621
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~8670 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Tbc1d2,也称为TBC domain family member 2,是一种在多种细胞过程中发挥重要作用的基因。TBC1D2编码的蛋白质包含一个TBC结构域,这是一种保守的蛋白质结构域,与GTPase活性调节有关,尤其是在Rab7小GTPase的活性调节中。Rab7在细胞内运输和内吞作用中发挥关键作用,而TBC1D2通过其GTPase活化蛋白(GAP)活性,调节Rab7的活性,从而影响细胞内囊泡运输和内吞作用[6]。

在多种疾病中,TBC1D2表达的变化与疾病的发病机制和预后相关。例如,在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中,TBC1D2是免疫浸润相关基因模型中的关键基因之一。通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)和多种统计方法,研究发现TBC1D2在HNSCC中高表达,并且与患者的预后不良相关。免疫浸润分析显示,TBC1D2的高表达与记忆B细胞、CD8+ T细胞、滤泡辅助T细胞、调节性T细胞的减少,以及活化的树突状细胞和肥大细胞的增加相关,这表明TBC1D2可能通过影响肿瘤微环境中的免疫细胞组成来影响HNSCC的预后[3]。

在颅内动脉瘤(IA)中,TBC1D2的表达也与疾病的发生发展相关。一项基因组连锁分析和全基因组测序的研究发现,TBC1D2中的罕见有害变异与家族性颅内动脉瘤相关。尽管在一般颅内动脉瘤患者队列中没有发现与IA状态相关的变异,但基因表达分析进一步支持了FMNL2和TBC1D2作为颅内动脉瘤病理生理学中潜在重要参与者的可能性[5]。此外,另一项研究通过基因集变异分析(GSVA)和加权基因共表达网络分析(WGCNA),发现TBC1D2是颅内动脉瘤中氧化应激相关基因模型中的关键诊断标志物之一。该研究发现TBC1D2的表达与氧化应激、活性氧(ROS)和葡萄糖代谢途径的异常激活相关,并推测TBC1D2可能在颅内动脉瘤的发生发展中发挥重要作用[7]。

除了在癌症和颅内动脉瘤中的作用,TBC1D2还与其他疾病相关。例如,在阿尔茨海默病(AD)中,TBC1D2被确定为13个免疫相关基因模型中的一个,用于检测AD。该模型基于基因表达数据,显示了对AD检测的高准确性和验证性能,为AD的诊断和治疗提供了新的思路[1]。在皮肤黑色素瘤(CM)中,TBC1D2是七个免疫相关预后分子之一,通过差异表达分析、竞争性内源性RNA(ceRNA)网络分析和LASSO Cox回归分析筛选出来。TBC1D2的生物学功能主要集中于磷脂代谢过程、转录调节复合物、蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性和MAPK信号通路,为皮肤黑色素瘤的预后预测和临床结果改善提供了科学基础[2]。

此外,TBC1D2还与内吞作用和细胞信号传导相关。一项研究发现,miR-17-5p通过靶向TBC1D2/Armus来调节内吞作用,揭示了TBC1D2在内吞作用中的重要作用[6]。另一项研究比较了肺泡细胞中TBC1D2的表达模式,发现TBC1D2在肺泡细胞中高表达,并与细胞信号传导、组织炎症的调节和细胞扩张和运动相关[4]。

综上所述,TBC1D2在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞内运输、内吞作用、细胞信号传导和组织炎症的调节。TBC1D2的表达变化与多种疾病的发生发展和预后相关,包括阿尔茨海默病、皮肤黑色素瘤、颅内动脉瘤和头颈鳞状细胞癌。此外,TBC1D2还与内吞作用和细胞信号传导相关,为深入理解TBC1D2在健康和疾病中的作用提供了新的视角。未来研究可以进一步探索TBC1D2在疾病发生发展中的具体机制,并开发基于TBC1D2的诊断和治疗方法。

参考文献:
1. Zhu, Min, Hou, Tingting, Jia, Longfei, Qiu, Chengxuan, Du, Yifeng. 2022. Development and validation of a 13-gene signature associated with immune function for the detection of Alzheimer's disease. In Neurobiology of aging, 125, 62-73. doi:10.1016/j.neurobiolaging.2022.12.014. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36842362/
2. Tang, Yifan, Feng, Huicong, Zhang, Lupeng, Wang, Yiren, Peng, Xiaoning. 2022. A novel prognostic model for cutaneous melanoma based on an immune-related gene signature and clinical variables. In Scientific reports, 12, 20374. doi:10.1038/s41598-022-23475-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36437242/
3. Ding, Yinghe, Chu, Ling, Cao, Qingtai, Li, Xinyu, Zhuang, Quan. 2023. A meta-validated immune infiltration-related gene model predicts prognosis and immunotherapy sensitivity in HNSCC. In BMC cancer, 23, 45. doi:10.1186/s12885-023-10532-y. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36639648/
4. Song, Dongli, Cretoiu, Dragos, Zheng, Minghuan, Popescu, Laurentiu M, Wang, Xiangdong. 2015. Comparison of Chromosome 4 gene expression profile between lung telocytes and other local cell types. In Journal of cellular and molecular medicine, 20, 71-80. doi:10.1111/jcmm.12746. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26678350/
5. Bakker, Mark K, Cobyte, Suze, Hennekam, Frederic A M, Veldink, Jan H, Ruigrok, Ynte M. 2022. Genome-wide linkage analysis combined with genome sequencing in large families with intracranial aneurysms. In European journal of human genetics : EJHG, 30, 833-840. doi:10.1038/s41431-022-01059-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35228681/
6. Serva, Andrius, Knapp, Bettina, Tsai, Yueh-Tso, Braga, Vania, Starkuviene, Vytaute. 2012. miR-17-5p regulates endocytic trafficking through targeting TBC1D2/Armus. In PloS one, 7, e52555. doi:10.1371/journal.pone.0052555. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23285084/
7. Zhang, Jiayun, Duan, Pengxin, Nie, Bo, Xu, Tiantian, Tian, Junbiao. . Identification and Verification of the Oxidative Stress-Related Signature Markers for Intracranial Aneurysm-Applied Bioinformatics. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 29, 294. doi:10.31083/j.fbl2908294. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39206894/