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Siah3-KO 基因敲除小鼠

Siah3-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Siah3-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-09691

品系全称

C57BL/6JCya-Siah3em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-380918-Siah3-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明： Siah3-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-09691) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
KO小鼠库模型

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
siah E3 ubiquitin protein ligase family member 3
基因别称
Gm912
染色体号
Chr 14 (Mouse)
NCBI ID
转录本 ID
NCBI: NM_001128093 | Ensembl: ENSMUST00000164848
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~0.7 kb
下载方案
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成，建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献，以获取最准确的表型信息。
表型提示
更多信息
基因Siah3，也称为七缺失同源物3（Seven In Absentia Homolog 3），是人类基因组中编码E3泛素连接酶的基因。Siah3属于SIAH家族，该家族由SIAH1、SIAH2和SIAH3三个成员组成。SIAH1和SIAH2编码的E3泛素连接酶在肿瘤发生中扮演了重要角色，而Siah3的功能和调节机制在肿瘤发生中的作用尚不完全清楚。

研究表明，Siah3在多种癌症中常被表观遗传沉默，包括皮肤黑色素瘤、肺腺癌和头颈部癌症。低水平的Siah3与癌症患者的生存率下降相关。此外，Siah3的表达可以减少细胞增殖并诱导细胞死亡。功能上，Siah3通过将细胞从有氧氧化磷酸化转变为糖酵解来抑制细胞代谢。Siah3定位于线粒体，并与参与线粒体核糖体生物合成和翻译的蛋白质相互作用。Siah3还与泛素连接酶（如SIAH1或SIAH2）相互作用，并被它们降解。这些结果表明，Siah3是一种通过抑制氧化磷酸化来调节细胞代谢的表观遗传控制的肿瘤抑制因子[1]。

Siah3基因还与神经退行性疾病相关。全基因组关联研究（GWAS）发现，Siah3基因中的两个单核苷酸多态性（SNP）与无痴呆老年人脑室扩大的速度增加相关。Siah3 rs11620312-C携带者与认知能力下降和脑低代谢相关。这表明Siah3基因可能在神经退行性疾病的发病机制中发挥潜在的作用[2]。

此外，Siah3基因还与STXBP1脑病相关。STXBP1脑病是由STXBP1基因的突变引起的神经系统疾病，包括癫痫、神经发育障碍和神经退行性疾病。研究发现，STXBP1脑病患者的诱导多能干细胞（iPSC）衍生的GABA能神经元中Siah3基因表达下调。基因表达分析显示，STXBP1脑病患者的iPSC衍生的GABA能神经元中，与癫痫、神经发育和神经退行性疾病相关的基因表达失调，包括Siah3基因[3]。

在进化分析中，Siah3与SIAH1和SIAH2相比，缺乏一个功能性的RING结构域，这表明Siah3可能是一种非活性的E3连接酶。Siah3在大多数人类上皮细胞系中表达，而在有限的癌症细胞系中表达。通过系统发育分析，研究人员发现了Siah3蛋白家族中许多保守和变异的氨基酸残基，以及进化上保守的功能性基序。这为设计针对Siah3的抗癌策略提供了有价值的支持[4]。

在急性早幼粒细胞白血病（APL）中，Siah3基因的13q14.13区域与PML和RARA基因融合有关。通过CRISPR/Cas9纳米孔测序技术，研究人员发现Siah3基因与PML和RARA基因融合相关，这为理解APL的病理生理学及其对治疗的反应提供了新的见解[5]。

在婴儿散发性、孤立性、颅内、鞍区视网膜母细胞瘤中，Siah3基因与RB1基因融合。通过RNA测序和单分子实时（SMRT）测序，研究人员发现Siah3基因与RB1基因融合，导致RB1蛋白表达缺失。这表明Siah3基因可能在视网膜母细胞瘤的发病机制中发挥作用[6]。

在DNA甲基化研究中，Siah3基因与社交焦虑障碍（SAD）和早期生活逆境（ELA）相关。研究发现，Siah3基因中的两个差异甲基化区域与SAD相关，而与ELA相关的差异甲基化区域位于SIAH3基因中。这表明Siah3基因可能在SAD和ELA的发病机制中发挥作用[7]。

在转移性前列腺癌中，Siah3基因的拷贝数改变和靶向突变分析发现，Siah3基因在13q14.11区域存在杂合性缺失。这表明Siah3基因可能在转移性前列腺癌的发病机制中发挥作用[8]。

综上所述，基因Siah3在多种疾病中发挥重要作用，包括癌症、神经退行性疾病和社交焦虑障碍。Siah3通过调节细胞代谢、影响线粒体功能和参与基因表达调控等机制发挥作用。研究Siah3有助于深入理解其生物学功能和疾病发生机制，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献：
1. Deutschmeyer, Verena E, Schlaudraff, Nico A, Walesch, Sara K, Schmitz, M Lienhard, Dammann, Reinhard H. 2024. SIAH3 is frequently epigenetically silenced in cancer and regulates mitochondrial metabolism. In International journal of cancer, 156, 353-367. doi:10.1002/ijc.35202. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39344659/
2. Li, Xian, Chu, Shu-Guang, Shen, Xue-Ning, Tan, Lan, Yu, Jin-Tai. 2019. Genome-wide association study identifies SIAH3 locus influencing the rate of ventricular enlargement in non-demented elders. In Aging, 11, 9862-9874. doi:10.18632/aging.102435. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31711042/
3. Ichise, Eisuke, Chiyonobu, Tomohiro, Ishikawa, Mitsuru, Okano, Hideyuki, Hirose, Shinichi. . Impaired neuronal activity and differential gene expression in STXBP1 encephalopathy patient iPSC-derived GABAergic neurons. In Human molecular genetics, 30, 1337-1348. doi:10.1093/hmg/ddab113. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33961044/
4. Pepper, Ian J, Van Sciver, Robert E, Tang, Amy H. 2017. Phylogenetic analysis of the SINA/SIAH ubiquitin E3 ligase family in Metazoa. In BMC evolutionary biology, 17, 182. doi:10.1186/s12862-017-1024-x. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28784114/
5. Middlezong, William, Stinnett, Victoria, Phan, Michael, Baer, Maria R, Zou, Ying S. 2024. Rapid Detection of PML::RARA Fusions in Acute Promyelocytic Leukemia: CRISPR/Cas9 Nanopore Sequencing with Adaptive Sampling. In Biomolecules, 14, . doi:10.3390/biom14121595. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39766302/
6. Schieffer, Kathleen M, Feldman, Alexander Z, Kautto, Esko A, Cottrell, Catherine E, Boué, Daniel R. 2021. Molecular classification of a complex structural rearrangement of the RB1 locus in an infant with sporadic, isolated, intracranial, sellar region retinoblastoma. In Acta neuropathologica communications, 9, 61. doi:10.1186/s40478-021-01164-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33827698/
7. Wiegand, Ariane, Kreifelts, Benjamin, Munk, Matthias H J, Kobor, Michael S, Nieratschker, Vanessa. 2021. DNA methylation differences associated with social anxiety disorder and early life adversity. In Translational psychiatry, 11, 104. doi:10.1038/s41398-021-01225-w. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33542190/
8. Robbins, Christiane M, Tembe, Waibov A, Baker, Angela, Pienta, Kenneth J, Carpten, John D. 2010. Copy number and targeted mutational analysis reveals novel somatic events in metastatic prostate tumors. In Genome research, 21, 47-55. doi:10.1101/gr.107961.110. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/21147910/

资料下载

S-KO-09691_6J_380918_Siah3_Exon 2_strategy.pdf
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