Lrif1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Lrif1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-09370

品系全称

C57BL/6JCya-Lrif1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-321000-Lrif1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Lrif1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-09370) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
ligand dependent nuclear receptor interacting factor 1
基因别称
2010012G17Rik,4933421E11Rik
染色体号
Chr 3 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001039488 | Ensembl: ENSMUST00000098750
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~3.0 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
LRIF1,也称为Leucine-rich repeat and FYVE domain-containing protein 1,是一种重要的染色质修饰因子。LRIF1在基因表达调控中发挥着关键作用,它能够通过与染色质上的特定区域结合,影响基因的转录和表达。LRIF1的这种调控作用是通过与其它染色质修饰因子相互作用来实现的,例如SMCHD1和DNMT3B。LRIF1的突变与多种疾病的发生发展密切相关,其中包括面肩肱型肌营养不良症(FSHD)和慢性淋巴细胞白血病(B-CLL)等。

LRIF1在FSHD的发生发展中起着重要作用。FSHD是一种常见的遗传性肌肉疾病,主要表现为面部、肩部和上肢肌肉的进行性无力。FSHD的发病机制涉及D4Z4重复序列的表观遗传调控异常,导致DUX4基因在骨骼肌中的异常表达。LRIF1的突变可以导致D4Z4染色质结构松弛,从而促进DUX4基因的表达,最终导致FSHD的发生。研究发现,LRIF1能够与D4Z4重复序列结合,并通过与SMCHD1和DNMT3B相互作用,共同维持D4Z4染色质的压缩状态,抑制DUX4基因的表达[1]。此外,LRIF1的突变还可以导致LRIF1蛋白的缺失,进一步影响DUX4基因的表达和FSHD的发生[2]。

LRIF1在B-CLL的发生发展中也可能发挥重要作用。B-CLL是一种常见的白血病,其发病机制涉及多种遗传和表观遗传因素。研究发现,LRIF1在B-CLL细胞中的表达水平较低,而LRIF1的突变可以进一步降低其表达水平。LRIF1的突变可能导致B-CLL细胞中DUX4基因的异常表达,从而影响B-CLL的发生和发展[5]。

LRIF1还与其它染色质修饰因子相互作用,共同调节基因的表达。例如,LRIF1能够与TRIM28相互作用,共同抑制DUX4基因的表达[4]。此外,LRIF1还能够与HP1相互作用,共同维持染色质的压缩状态[3]。

综上所述,LRIF1是一种重要的染色质修饰因子,在基因表达调控中发挥着关键作用。LRIF1的突变与多种疾病的发生发展密切相关,其中包括FSHD和B-CLL等。LRIF1的研究有助于深入理解染色质修饰在疾病发生发展中的作用机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Hamanaka, Kohei, Šikrová, Darina, Mitsuhashi, Satomi, Nishino, Ichizo, van der Maarel, Silvère M. 2020. Homozygous nonsense variant in LRIF1 associated with facioscapulohumeral muscular dystrophy. In Neurology, 94, e2441-e2447. doi:10.1212/WNL.0000000000009617. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32467133/
2. Šikrová, Darina, Testa, Alessandra M, Willemsen, Iris, Balog, Judit, van der Maarel, Silvère M. 2023. SMCHD1 and LRIF1 converge at the FSHD-associated D4Z4 repeat and LRIF1 promoter yet display different modes of action. In Communications biology, 6, 677. doi:10.1038/s42003-023-05053-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37380887/
3. Wang, Chenlu, Liu, Yu, Xiong, Jingfei, Dong, Biao, Li, Zhonghan. 2024. Genome-wide CRISPR screenings identified SMCHD1 as a host-restricting factor for AAV transduction. In PLoS pathogens, 20, e1012344. doi:10.1371/journal.ppat.1012344. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38976714/
4. Šikrová, Darina, González-Prieto, Román, Vertegaal, Alfred C O, Clemens-Daxinger, Lucia, van der Maarel, Silvère M. 2024. Lrif1 modulates Trim28-mediated repression of the Dux locus in mouse embryonic stem cells. In bioRxiv : the preprint server for biology, , . doi:10.1101/2024.11.18.624083. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39605603/
5. Burlet, Bénédicte, Ramla, Selim, Fournier, Cyril, Aucagne, Romain, Callanan, Mary B. 2021. Identification of novel, clonally stable, somatic mutations targeting transcription factors PAX5 and NKX2-3, the epigenetic regulator LRIF1, and BRAF in a case of atypical B-cell chronic lymphocytic leukemia harboring a t(14;18)(q32;q21). In Cold Spring Harbor molecular case studies, 7, . doi:10.1101/mcs.a005934. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33608382/