Tmcc3-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Tmcc3-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-09203

品系全称

C57BL/6JCya-Tmcc3em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-319880-Tmcc3-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Tmcc3-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-09203) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
transmembrane and coiled coil domains 3
基因别称
A230066D03Rik,C630016B22Rik,Gm1556,Tmcc1
染色体号
Chr 10 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_172051 | Ensembl: ENSMUST00000065060
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~0.5 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
TMCC3(transmembrane and coiled-coil domain family 3)是一种在多种生物学过程中发挥重要作用的基因。TMCC3编码的蛋白含有跨膜和螺旋结构域,这些结构域使其能够在细胞膜上发挥功能。TMCC3在脂肪肝疾病、胰腺癌、乳腺癌、缺血性中风和吸烟引起的呼吸道疾病等多种疾病中发挥着重要作用。

在脂肪肝疾病中,TMCC3是过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)的一个新的靶点。PPARγ是一种核受体,在非酒精性脂肪肝疾病(NAFLD)中表达丰富。研究发现,在人类和小鼠的脂肪肝组织中,TMCC3的表达水平显著升高。在小鼠中,TMCC3存在三种不同的外显子1变体(Tmcc3-1a、-1b和-1c)。在2型糖尿病ob/ob小鼠的脂肪肝组织中,TMCC3-1B的表达水平显著升高,但通过肝特异性敲除PPARγ可以减轻这种升高。报告基因实验和电泳迁移率变动实验表明,PPARγ通过相同的PPARγ反应元件正调控Tmcc3-1b和-1c的转录[1]。

在胰腺癌中,miR-492激活邻近基因(NR2C1/NDUFA12/TMCC3),促进胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭。miR-492激活的基因在胰腺癌中显著富集了TGF-β/Smad3信号通路,促进了肿瘤发生和发展过程中的上皮-间质转化(EMT)。CRISPR-Cas9和染色质免疫沉淀(ChIP)实验进一步表明,miR-492作为增强子触发因子发挥作用,而抗miR-492则抑制了胰腺癌的发生,降低了血清TGF-β的表达水平,并通过下调NR2C1的表达抑制了EMT过程[2]。

在乳腺癌中,TMCC3调节乳腺癌干细胞(BCSCs)和AKT的激活。BCSCs在癌症转移和抗药性方面发挥着重要作用。研究发现,TMCC3在BCSCs中的表达水平高于非BCSCs,并且在乳腺癌患者异种移植瘤(PDX)的转移性淋巴结和肺组织中,TMCC3的表达水平高于原发肿瘤。TMCC3的沉默抑制了乳腺球形成、ALDH活性和细胞迁移,降低了肿瘤发生和转移能力。机制上,研究发现TMCC3通过其1-153氨基酸结构域直接与AKT相互作用,调节AKT的激活。临床研究发现,TMCC3 mRNA的表达水平与乳腺癌的不良临床结果相关,包括早期乳腺癌。多变量分析表明,TMCC3的表达是乳腺癌预后的独立风险因素[3]。

在实验性精索静脉曲张大鼠的睾丸中,沉默CAMK2D基因促进了精原细胞的增殖。精索静脉曲张被认为是导致男性不育的主要因素。研究发现,TMCC3和FLNB在精索静脉曲张大鼠睾丸组织中显著下调,而CAMK2D、OPLAH和EGR1则显著上调。体外实验表明,沉默CAMK2D促进了精原细胞的增殖,并导致CAMKII、FOXO1和β-catenin的下调[4]。

在商业和土著伊朗鸡中,RNA测序分析揭示了先天免疫基因表达的差异。研究发现,TMCC3是商业鸡中表达水平最高的基因之一,而在土著鸡中则没有显著表达。该研究揭示了商业鸡和土著鸡之间先天免疫基因表达的差异,为未来品种改良提供了候选基因[5]。

在缺血性中风和癫痫中,负调控血管生成和MAPK通路可能是共同的生物学通路。研究发现,在缺血性中风和癫痫小鼠中,TMCC3是共同上调的基因之一。进一步分析表明,共同表达差异表达基因(DEGs)参与了负调控血管生成和MAPK信号通路。通过分子对接实验发现,曲古菌素A和丙戊酸可能是潜在的药物治疗药物[6]。

在吸烟引起的呼吸道疾病中,TMCC3是受吸烟影响的基因之一。研究发现,吸烟导致人类气道上皮中TMCC3的表达水平下调。基因本体(GO)分析表明,DEGs主要富集在氧化还原过程、细胞外空间和氧化还原酶活性等方面。京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析显示,DEGs主要富集在细胞色素P450介导的外来生物代谢和化学致癌作用通路中。蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络分析揭示了15个中心基因,包括NQO1、CYP1B1、AKR1C1、CYP1A1等。聚类分析表明,这些中心基因与腺癌、鳞状细胞癌、细胞分化、炎症反应、氧化DNA损伤和氧化应激反应等过程相关。miR-627-5p可能是具有最多靶基因的miRNA,其靶基因包括ITLN1、TIMP3、PPP4R4、SLC1A2等[7]。

综上所述,TMCC3是一种重要的基因,在脂肪肝疾病、胰腺癌、乳腺癌、缺血性中风和吸烟引起的呼吸道疾病等多种疾病中发挥着重要作用。TMCC3的表达和功能调控机制可能是未来疾病治疗和预防的重要靶点。

参考文献:
1. Aibara, Daisuke, Sakaguchi, Ai, Matsusue, Kimihiko. 2024. Transmembrane and coiled-coil domain family 3 gene is a novel target of hepatic peroxisome proliferator-activated receptor γ in fatty liver disease. In Molecular and cellular endocrinology, 594, 112379. doi:10.1016/j.mce.2024.112379. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39326649/
2. Liu, Shanshan, He, Xiaomeng, Di, Yang, Yu, Wenqiang, Wang, Jin. . NamiRNA-enhancer network of miR-492 activates the NR2C1-TGF-β/Smad3 pathway to promote epithelial-mesenchymal transition of pancreatic cancer. In Carcinogenesis, 44, 153-165. doi:10.1093/carcin/bgac102. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36591938/
3. Wang, Ya-Hui, Chan, Yu-Tzu, Hung, Tsai-Hsien, Yu, John, Yu, Alice L. 2021. Transmembrane and coiled-coil domain family 3 (TMCC3) regulates breast cancer stem cell and AKT activation. In Oncogene, 40, 2858-2871. doi:10.1038/s41388-021-01729-1. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33742122/
4. Tang, Songxi, Yang, Peng, Ding, Yilang, Chen, Xi, Zhou, Huiliang. 2022. Silencing CAMK2D Promotes the Proliferation of Spermatogonia in the Testis of Experimental Varicocele Rats. In Evidence-based complementary and alternative medicine : eCAM, 2022, 7121245. doi:10.1155/2022/7121245. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35911132/
5. Sadr, Ayeh Sadat, Nassiri, Mohammadreza, Ghaderi-Zefrehei, Mostafa, Smith, Jacqueline, Muhaghegh Dolatabady, Mustafa. 2023. RNA-Seq Profiling between Commercial and Indigenous Iranian Chickens Highlights Differences in Innate Immune Gene Expression. In Genes, 14, . doi:10.3390/genes14040793. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37107551/
6. Fu, Longhui, Yu, Beibei, Lv, Boqiang, Li, Jianzhong, Gong, Shouping. 2023. Negative regulation of angiogenesis and the MAPK pathway may be a shared biological pathway between IS and epilepsy. In PloS one, 18, e0286426. doi:10.1371/journal.pone.0286426. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37792772/
7. Huang, Jizhen, Jiang, Wanli, Tong, Xiang, Zhang, Yuan, Fan, Hong. . Identification of gene and microRNA changes in response to smoking in human airway epithelium by bioinformatics analyses. In Medicine, 98, e17267. doi:10.1097/MD.0000000000017267. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31568004/