C130050O18Rik-KO 基因敲除小鼠

下单100%中奖,最高可得千元京东卡
复苏/繁育服务
产品名称

C130050O18Rik-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-09193

品系全称

C57BL/6JCya-C130050O18Rikem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-319772-C130050O18Rik-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: C130050O18Rik-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-09193) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因全称
RIKEN cDNA C130050O18 gene
基因别称
-
染色体号
Chr 5 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001384195.1 | Ensembl: ENSMUST00000163940
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~3
敲除长度
~8768 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因C130050O18Rik是小鼠基因组中的一种非编码RNA基因,属于Rik基因家族。Rik基因家族是一类功能未知的基因,它们在基因组中广泛存在,但大部分的功能和生物学作用尚未得到阐明。C130050O18Rik基因位于小鼠基因组中的C130050O18染色体上,其具体的功能和生物学作用尚不明确。

基因复制和基因丢失是动物基因组进化中的常见事件,这两个动态过程的平衡对物种间基因数量的差异有着重要影响。在基因复制后,两个副本基因通常会以大致相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是不均匀的,其中一个副本会与它的同源基因发生显著分化。这种"不对称进化"在串联基因复制后比全基因组复制后更为常见,并可以产生新的基因。在对蛾、软体动物和哺乳动物中复制后的同源基因进行的研究中发现,这种不对称进化产生了新的同源基因,并被招募到新的发育角色中[1]。

乳腺癌是一种异质性很强的疾病,其中大多数病例(约70%)被认为是散发性。家族性乳腺癌(约30%的患者),通常在乳腺癌发病率高的家族中观察到,与许多高、中、低渗透性的易感基因有关。家系连锁研究已经确定了高渗透性基因,如BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,它们是遗传性综合征的原因。此外,结合家系和人群方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度的乳腺癌风险相关。在乳腺癌中的全基因组关联研究(GWAS)发现了一些常见的低渗透性等位基因,与乳腺癌风险略有增加或降低相关。目前,只有高渗透性基因被广泛应用于临床实践。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将被纳入遗传测试。然而,在多基因面板测试完全实施到临床工作流程之前,还需要对中度和低风险变异的临床管理进行更多的研究[2]。

基因工程网络是后基因组研究的一个重点,旨在理解细胞现象是如何从基因和蛋白质的连接中产生的。这种连接产生了类似于复杂电子电路的分子网络图,系统的理解需要开发描述电路的数学框架。从工程的角度来看,通往这种框架的自然途径是构建和分析构成网络的底层模块。在测序和基因工程方面的最新实验进展使得这种方法成为可能,通过设计和实施适用于数学建模和定量分析的合成基因网络。这些发展标志着基因电路学科的兴起,为预测和评估细胞过程的动力学提供了一个框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因和细胞疗法具有重要意义[3]。

基因敲除产生完全的失功能基因型,是探索基因功能的一种常用方法。基因敲除的最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中高达约四分之一的基因可能是必需的。与其他基因型-表型关系一样,基因必需性也受到背景效应的影响,并且可能因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于某些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过外基因抑制因子得到挽救。这种"必需性的绕过"(BOE)基因-基因相互作用是一种未被充分研究的遗传抑制类型。最近的一项系统分析表明,令人惊讶的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用得到绕过[4]。

基因调控网络是基因表达调控的核心机制,它们由相互作用的转录因子、DNA序列和蛋白质组成,共同调控基因的表达。基因调控网络的失调与许多疾病的发生和发展有关,包括癌症、糖尿病和神经退行性疾病。对基因调控网络的研究有助于深入了解基因表达的调控机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[5]。

PlantCARE是一个植物顺式作用调节元件数据库,提供了植物顺式作用调节元件、增强子和抑制子的数据。这些调节元件通过位置矩阵、共序序列和特定启动子序列上的单个位点来表示。当可用时,还提供了到EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。转录位点的数据主要从文献中提取,并补充了越来越多的计算机预测数据。除了对特定转录因子位点的通用描述外,还提供了实验证据的置信度、功能信息以及在启动子上的位置。已经实现了新功能,以搜索查询序列中的植物顺式作用调节元件。此外,现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因的簇。新的调节元件可以自动发送,并在经过审查后添加到数据库中[6]。

基因片段是基因的一部分,它们可能包含编码序列、非编码序列或调控序列。基因片段在基因表达和调控中发挥着重要作用,它们可以通过转录、剪接和翻译过程产生不同的蛋白质。基因片段的研究有助于深入了解基因的功能和调控机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[7]。

植物依赖抗病基因的防御反应是一种重要的植物免疫机制,它可以帮助植物抵抗病原体的入侵。抗病基因编码的蛋白质可以识别病原体相关分子模式(PAMPs)和效应蛋白,从而激活植物的防御反应。抗病基因的激活可以导致植物产生抗病化合物、细胞壁加固和细胞死亡等防御反应,从而有效地抵抗病原体的入侵[8]。

MHC基因表达调控是一个复杂的过程,涉及多种转录因子和DNA序列的相互作用。MHC基因的激活和抑制对于维持免疫系统的稳定性和功能至关重要。MHC基因的表达调控研究有助于深入了解免疫系统的功能和疾病的发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[9]。

基因的定义是一个有争议的问题,不同的学科和领域对基因的定义有不同的理解和解释。一些定义强调基因是编码蛋白质的DNA序列,而其他定义则认为基因是控制生物体遗传特征的功能单位。基因的定义对于理解和研究基因的功能和调控机制具有重要意义[10]。

综上所述,基因C130050O18Rik是一种非编码RNA基因,属于Rik基因家族。目前对C130050O18Rik基因的功能和生物学作用尚不明确,需要进一步的研究来阐明。通过对C130050O18Rik基因的研究,可以深入了解基因的功能和调控机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/
7. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
8. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
9. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/
10. Epp, C D. . Definition of a gene. In Nature, 389, 537. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9335484/