Xkr5-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Xkr5-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-09162

品系全称

C57BL/6JCya-Xkr5em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-319581-Xkr5-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Xkr5-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-09162) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
X-linked Kx blood group related 5
基因别称
5430438H03Rik,XRG5
染色体号
Chr 8 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001113350.2 | Ensembl: ENSMUST00000095438
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2~5
敲除长度
~9675 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Xkr5,也称为X Kell blood group related 5,是一种与X染色体上Kell血型相关的基因。Kell血型系统是第二个最常见的红细胞抗原系统,仅次于ABO系统。Xkr5基因编码的蛋白质在红细胞表面表达,参与Kell抗原的形成。Kell抗原在输血医学中具有重要意义,因为它们可能与输血反应有关。Xkr5基因的突变可能导致Kell血型系统的异常,从而影响血型抗原的表达。此外,Xkr5基因的变异可能与某些遗传性疾病相关,例如Kell血型相关的溶血性贫血。

Cruz Díaz等人研究了人类β-防御素1(DEFB1)基因的调控单核苷酸多态性(rSNP)对基因表达的影响。他们使用SNPClinic和PredictSNP工具对DEFB1基因的近端启动子进行了rSNP预测,并在三个来自1000个基因组项目(1kGP)的人类细胞系(A549、HL-60和TH 1)中进行了预测。他们发现了一个rSNP rs5743417,它降低了DEFB1基因的表达,并且在高加索和非洲裔美国人中具有较高频率。rs5743417的次要等位基因(G→A)在A549细胞中显著降低了基因表达,与G主要等位基因相比,DEFB1转录减少了33%。此外,rs5743417还影响了三个转录因子结合位点(TFBSs),包括SREBP2、CREB1和JUND,这些TFBSs与多种生物学途径相关。此外,rs5743417还与lncRNA基因GS1-24F4.2重叠,该基因与Xkr5 mRNA互补。这些发现表明,rs5743417可能通过影响DEFB1基因的表达和TFBSs的功能,在非洲和非洲裔美国人群中的某些疾病中发挥作用[1]。

综上所述,Xkr5基因在红细胞表面抗原的形成中发挥作用,并与Kell血型系统相关。Xkr5基因的变异可能导致Kell血型系统的异常和某些遗传性疾病。此外,rs5743417是一个与DEFB1基因表达相关的rSNP,它在非洲和非洲裔美国人群中的频率较高,并可能通过影响TFBSs的功能在DEFB1相关疾病中发挥作用。这些发现为深入研究Xkr5基因和rs5743417在人类疾病中的作用提供了重要的线索。

参考文献:
1. Cruz Díaz, Luis Antonio, Gutiérrez Ortega, Abel, Chávez Álvarez, Rocío Del Carmen, Velarde Félix, Jesús Salvador, Prado Montes de Oca, Ernesto. 2020. Regulatory SNP rs5743417 impairs constitutive expression of human β-defensin 1 and has high frequency in Africans and Afro-Americans. In International journal of immunogenetics, 47, 332-341. doi:10.1111/iji.12475. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/31994826/