H4c12-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

H4c12-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-09119

品系全称

C57BL/6JCya-H4c12em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-319160-H4c12-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: H4c12-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-09119) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
H4 clustered histone 12
基因别称
H4c1,H4c11,H4c14,H4c16,H4c2,H4c3,H4c4,H4c6,H4c8,H4c9,H4f16,Hist1h4k
染色体号
Chr 13 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_178211.2 | Ensembl: ENSMUST00000102983
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~307 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
基因H4c12,也称为H4 histone family, member c, pseudogene 12,是一种假基因,位于人类染色体1q42.13区域。H4c12基因编码组蛋白H4,组蛋白H4是一种核心组蛋白,在染色质结构中起着重要作用。H4c12基因的假基因状态意味着它不再具有编码功能,但仍保留着一些组蛋白H4的序列特征。H4c12的假基因状态可能是由于基因复制和序列变化的结果。

组蛋白H4在染色质结构中与H2A、H2B、H3和H4四种核心组蛋白一起形成核小体,核小体是染色质的基本结构单位。组蛋白H4在核小体中的位置与DNA紧密接触,参与染色质的包装和基因表达调控。H4c12基因的假基因状态可能影响染色质的结构和基因表达调控。

组蛋白H4的甲基化修饰是染色质调控的一种重要方式,可以影响基因表达和生物学过程。H4c12基因的假基因状态可能影响组蛋白H4的甲基化修饰,进而影响基因表达和生物学过程。

基因复制和基因丢失是动物基因组进化中的常见事件,基因复制后,两个拷贝基因通常会以相似的速度积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累会高度不均匀,其中一个拷贝会与其同源基因发生显著分化。这种非对称进化在串联基因复制后比全基因组复制后更常见,可以产生新的基因。研究表明,在蛾类、软体动物和哺乳动物的复制同源基因中存在着非对称进化,这些新的同源基因被招募到新的发育角色中[1]。

乳腺癌是一种异质性疾病,大多数乳腺癌病例(约70%)被认为是散发性。家族性乳腺癌(约30%的患者)通常出现在乳腺癌发病率高的家庭中,与一些高、中、低渗透性易感基因相关。家族连锁研究已确定BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53等高渗透性基因,这些基因负责遗传综合征。此外,家族和群体研究方法表明,DNA修复相关的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)揭示了一些与乳腺癌风险略微增加或降低的常见低渗透性等位基因。目前,只有高渗透性基因在临床实践中被广泛应用。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将被纳入基因检测。然而,在将多基因面板检测完全纳入临床工作流程之前,还需要对中度和低风险变异体的临床管理进行额外研究[2]。

基因调控网络是生物信息学研究的一个重要领域。基因调控网络由基因和蛋白质之间的连接构成,这些连接生成分子网络图,类似于复杂的电路。了解基因调控网络需要发展描述电路的数学框架。近年来,测序和基因工程的实验进展使得设计、实施和数学建模合成基因网络成为可能。这些进展标志着基因电路学科的出现,该学科为预测和评估细胞过程的动力学提供了一个框架。合成基因网络也将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗具有重要意义[3]。

基因敲除技术是研究基因功能的重要方法,通过基因敲除产生完全失去功能的基因型。基因敲除的最严重表型后果是致死性。基因敲除后产生致死性表型的基因被称为必需基因。基因组范围内敲除分析表明,基因组中约四分之一的基因可能是必需的。基因必需性受背景效应和基因间相互作用的影响,类似于其他基因型-表型关系。对于某些必需基因,敲除引起的致死性可以通过非基因抑制因子得到挽救。这种“必需性的绕过”(BOE)基因间相互作用是一种研究不足的遗传抑制类型。最近的研究表明,在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中,近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用绕过。本文回顾了揭示和理解基因必需性绕过的历史和最新进展[4]。

基因片段是基因序列的一部分,可以参与基因表达调控。植物CARE数据库是一个植物顺式作用调控元件、增强子和抑制子的数据库。该数据库包含顺式作用元件的位置矩阵、共识序列和特定启动子序列上的单个位点。当可用时,提供与EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。转录位点的数据主要从文献中提取,并辅以越来越多的计算机预测数据。除了对特定转录因子位点的描述外,还提供了实验证据的置信度水平、功能信息和启动子上的位置。为了在查询序列中搜索植物顺式作用调控元件,已经实施了新的功能。此外,现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因的聚类。新的调控元件可以自动发送,并在经过审核后添加到数据库中。PlantCARE关系数据库可通过互联网在http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCARE/获得[5]。

综上所述,基因H4c12是一种重要的假基因,编码组蛋白H4,组蛋白H4在染色质结构中起着重要作用。H4c12基因的假基因状态可能影响染色质的结构和基因表达调控。基因复制和基因丢失是动物基因组进化中的常见事件,基因复制后,两个拷贝基因通常会以相似的速度积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累会高度不均匀,其中一个拷贝会与其同源基因发生显著分化。这种非对称进化在串联基因复制后比全基因组复制后更常见,可以产生新的基因。乳腺癌是一种异质性疾病,与一些高、中、低渗透性易感基因相关。基因调控网络是生物信息学研究的一个重要领域,由基因和蛋白质之间的连接构成,这些连接生成分子网络图,类似于复杂的电路。基因敲除技术是研究基因功能的重要方法,基因敲除的最严重表型后果是致死性。基因敲除后产生致死性表型的基因被称为必需基因。基因片段是基因序列的一部分,可以参与基因表达调控。植物CARE数据库是一个植物顺式作用调控元件、增强子和抑制子的数据库,提供顺式作用元件的位置矩阵、共识序列和特定启动子序列上的单个位点。这些研究表明,基因H4c12的研究对于理解染色质结构、基因表达调控和基因组进化具有重要意义。

参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/