H4c3-KO 基因敲除小鼠

下单100%中奖,最高可得千元京东卡
复苏/繁育服务
产品名称

H4c3-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-09115

品系全称

C57BL/6JCya-H4c3em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-319155-H4c3-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: H4c3-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-09115) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
H4 clustered histone 3
基因别称
H4c1,H4c11,H4c12,H4c14,H4c16,H4c2,H4c4,H4c6,H4c8,H4c9,H4f16,Hist1h4c
染色体号
Chr 13 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_178208.2 | Ensembl: ENSMUST00000102967
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~307 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
H4c3是一种人类组蛋白H4基因,它编码组蛋白H4,这是染色质结构的基本组成部分。组蛋白H4是染色质的核心组成部分,由DNA双链纤维包裹在组蛋白八聚体周围形成核小体。这种组织支持细胞过程,如DNA复制、转录和修复,在所有真核生物中都非常重要。人类组蛋白H4由十四个基因编码,它们在核苷酸水平上有所不同,但编码的是一种不变的蛋白质。H4c3基因中的错义变异与神经发育障碍有关,这表明组蛋白在神经发育中的重要作用。

在一项研究中,29名个体被发现患有六个H4基因(包括H4C3)中的新发错义变异。这些个体表现出智力障碍和运动或大发育迟缓等神经发育特征,而非神经特征则更为多样化。这些变异影响10个氨基酸,其中6个是重复出现的,并且都位于H4核心或C末端尾部。这些变异聚集在核心H4球状结构域的特定区域,这是蛋白质与其他组蛋白亚基或组蛋白伴侣发生相互作用的区域。在斑马鱼胚胎中评估了这些变异的功能后果,发现它们显示出异常的总体发育、头部器官缺陷和身体轴线长度减少,为所报告的疾病的因果关系提供了强有力的证据[1]。

另一项研究使用生物信息学分析来识别胰腺癌的潜在生物标志物。研究人员使用TCGA生物信息学数据库筛选和下载了胰腺癌患者和正常组织的基因表达谱。通过R软件,在正常组织和胰腺癌的基因表达特征之间确定了差异表达基因(DEGs)。然后,使用enrichr和ToppGene进行了GO和KEGG通路富集分析。此外,还构建了PPI网络,并使用Cytoscape软件确定了与胰腺癌相关的100个顶级DEGs中的中心基因。在PPI网络分析中,发现不同类型的组蛋白编码基因参与胰腺癌的发生[2]。

还有研究调查了严重氟斑牙患者唾液蛋白组学特征。研究分析了泰国受严重氟斑牙影响的个体唾液蛋白组,并进行了全面的生物信息学分析。结果显示,与正常组相比,氟斑牙组的尿氟水平显著升高,而两组的饮水氟水平没有显著差异。两组都检测到104种可检测的唾液蛋白,其中正常组中LENG9上调,而氟斑牙组中LDHA、UBA1、S100A9、H4C3和LCP1上调,这些蛋白都与CFTR离子通道相关。此外,正常组独特地表达了36种蛋白,GO和通路分析表明与免疫防御的各个方面有关[3]。

在另一项研究中,分析了自发流产(SA)中通过测序检测到的拷贝数变异(CNVs)。SA是影响约15-20%妊娠的最常见的早期妊娠并发症。致病的CNVs被认为是SA的潜在遗传原因。然而,在概念产品(POCs)中已经确定了CNVs的变异意义不明确(VOUS),它们与SA的相关性仍然不确定。在189例自发流产病例中,16号染色体的三体是最常见的染色体异常,其次是X染色体的单体。CNVs最常见于4号和8号染色体上。GO和信号通路分析表明,与神经系统发育、跨膜转运、细胞粘附和染色质结构成分相关的基因显著富集。此外,通过整合人类胎盘表达谱、PhyloP评分和残差方差不耐受评分(RVIS)百分位数,筛选了VOUS CNVs中的基因,以确定与SA相关的潜在候选基因。发现了14个潜在候选基因,包括LZTR1、TSHZ1和H4C3,这些基因的变异可能与胚胎致死性有关[4]。

综上所述,H4c3基因编码组蛋白H4,这是染色质结构的基本组成部分,对细胞过程至关重要。H4c3基因中的错义变异与神经发育障碍有关,这表明组蛋白在神经发育中的重要作用。此外,H4c3基因在胰腺癌、严重氟斑牙和自发流产中也有重要作用。这些研究结果为进一步研究H4c3基因在疾病发生中的作用提供了基础,并为疾病的治疗和预防提供了新的思路和策略。

参考文献:
1. Tessadori, Federico, Duran, Karen, Knapp, Karen, Bicknell, Louise S, van Haaften, Gijs. 2022. Recurrent de novo missense variants across multiple histone H4 genes underlie a neurodevelopmental syndrome. In American journal of human genetics, 109, 750-758. doi:10.1016/j.ajhg.2022.02.003. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35202563/
2. Jafari, Somayeh, Ravan, Milad, Karimi-Sani, Iman, Atapour, Amir, Sarab, Gholamreza Anani. 2023. Screening and identification of potential biomarkers for pancreatic cancer: An integrated bioinformatics analysis. In Pathology, research and practice, 249, 154726. doi:10.1016/j.prp.2023.154726. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37591067/
3. Gavila, Patcharaporn, Ajrithirong, Penpitcha, Chumnanprai, Supoj, Tagami, Junji, Porntaveetus, Thantrira. 2024. Salivary proteomic signatures in severe dental fluorosis. In Scientific reports, 14, 18372. doi:10.1038/s41598-024-69409-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39112609/
4. Liu, Anhui, Zhou, Liyuan, Huang, Yazhou, Peng, Dan. 2024. Analysis of copy number variants detected by sequencing in spontaneous abortion. In Molecular cytogenetics, 17, 13. doi:10.1186/s13039-024-00683-3. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/38764094/