Imp4-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Imp4-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-08981

品系全称

C57BL/6JCya-Imp4em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-27993-Imp4-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Imp4-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-08981) were purchased from Cyagen.
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基因型
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein
基因别称
D1Wsu40e
染色体号
Chr 1 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_178601.3 | Ensembl: ENSMUST00000027303
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3~9
敲除长度
~1558 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
IMP4(也称为Imp4/Brix)是一种在生物体内发挥重要作用的基因。IMP4/Brix家族的蛋白主要参与核糖体RNA的加工过程,这是所有细胞的基本功能之一。IMP4/Brix蛋白在维持细胞生长、分化和代谢中发挥着关键作用。IMP4基因在不同物种中具有高度的保守性,这表明它在生命活动中具有重要作用。IMP4蛋白通常与核糖体RNA的加工、转运和成熟过程相关,同时也参与细胞周期的调控和细胞应激反应。

IMP4基因在多种生物学过程中发挥着重要作用。在核糖体RNA加工过程中,IMP4蛋白与U3小核RNA(snoRNA)和其他蛋白质共同组成一个大型核糖核蛋白复合物,称为SSU processome。这个复合物对18S rRNA的合成和加工至关重要,而18S rRNA是核糖体的一个组成部分,参与蛋白质合成。此外,IMP4蛋白还参与RNA的代谢和DNA修复过程,对维持基因组的稳定性和细胞功能具有重要作用。

IMP4基因的表达和功能在多种疾病中发生变化。例如,在动脉夹层和代谢综合征中,IMP4基因的表达与疾病的诊断和预后相关。研究表明,IMP4基因的表达水平与动脉夹层的严重程度和代谢综合征的发生发展相关。此外,IMP4基因的表达还与细菌耐药性相关。一些研究表明,IMP4基因的表达与细菌对碳青霉烯类抗生素的耐药性相关。例如,IMP-4金属β-内酰胺酶(MBL)的产生与细菌对碳青霉烯类抗生素的耐药性相关。IMP4基因的表达和功能变化可能参与疾病的发生和发展,为疾病的诊断和治疗提供新的思路和策略。

在基因Imp4的研究中,Furtado等人使用功能互补策略,从曼氏血吸虫中分离出一种cDNA,该cDNA能够互补大肠杆菌突变株的DNA碱基切除修复途径缺陷。进一步的研究表明,这种cDNA与酵母ScIMP4基因具有序列同源性,并能够部分互补酵母ScIMP4缺陷突变株对甲基甲烷磺酸盐(MMS)的敏感性。这表明IMP4基因在曼氏血吸虫和酵母中均参与了DNA修复和RNA代谢过程[1]。

Zhang等人利用多种机器学习算法,对主动脉夹层和代谢综合征的诊断效果基因进行了研究。他们发现,IMP4基因在主动脉夹层和代谢综合征中具有共同的诊断效果。此外,免疫细胞浸润和代谢相关途径分析表明,IMP4基因与转录因子结合和炎症反应相关。这些研究结果表明,IMP4基因在主动脉夹层和代谢综合征的发生发展中具有重要作用[2]。

Ng等人报道了第一个Imp4/Brix超家族蛋白——Methanothermobacter thermautotrophicus Imp4-like(Mil)蛋白的结构。Mil蛋白的氨基和羧基末端显示出显著的内部重复和结构相似性,提示其可能通过祖先复制而来。Mil蛋白的折叠结构与IIa类氨酰-tRNA合成酶的反密码子结合结构域相似,这表明Imp4/Brix超家族蛋白可能通过其N端与RNA结合。这项研究揭示了Imp4/Brix超家族蛋白的结构特点和RNA结合机制[3]。

Gallagher和Baserga利用反向双杂交系统,筛选出与Mpp10p相互作用的Imp4蛋白突变体。他们发现,这些突变体在条件性生长实验中表现正常,但导致前rRNA加工缺陷。这表明,Mpp10p与Imp4p的相互作用对SSU processome的功能和核糖体RNA的加工至关重要[4]。

Xu和Yamamoto研究了抗感染药物硝噻唑啉对酵母转录组的影响。他们发现,硝噻唑啉暴露导致与核糖体生物合成相关的基因转录发生变化,包括IMP4基因。此外,硝噻唑啉处理导致M28编码的毒性蛋白K28的表达下调,提示硝噻唑啉可能通过影响IMP4基因的表达来抑制酵母细胞的生长和病毒样元件的复制[5]。

综上所述,基因Imp4在核糖体RNA加工、DNA修复和RNA代谢中发挥着重要作用。IMP4基因的表达和功能变化与多种疾病的发生和发展相关,包括动脉夹层、代谢综合征和细菌耐药性。IMP4基因的研究有助于深入理解核糖体RNA加工和DNA修复的分子机制,为疾病的诊断和治疗提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Furtado, Carolina, Regis-da-Silva, Carlos Gustavo, Passos-Silva, Danielle Gomes, Pena, Sérgio Danilo Junho, Machado, Carlos Renato. 2006. Schistosoma mansoni: the IMP4 gene is involved in DNA repair/tolerance after treatment with alkylating agent methyl methane sulfonate. In Experimental parasitology, 116, 25-34. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/17189633/
2. Zhang, Yang, Li, Jinwei, Chen, Lihua, Liu, Quan, Wang, Zhiyi. 2023. Identification of co-diagnostic effect genes for aortic dissection and metabolic syndrome by multiple machine learning algorithms. In Scientific reports, 13, 14794. doi:10.1038/s41598-023-41017-4. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37684281/
3. Ng, Chyan Leong, Waterman, David, Koonin, Eugene V, Antson, Alfred A, Ortiz-Lombardía, Miguel. . Crystal structure of Mil (Mth680): internal duplication and similarity between the Imp4/Brix domain and the anticodon-binding domain of class IIa aminoacyl-tRNA synthetases. In EMBO reports, 6, 140-6. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15654320/
4. Gallagher, Jennifer E G, Baserga, Susan J. 2004. Two-hybrid Mpp10p interaction-defective Imp4 proteins are not interaction defective in vivo but do confer specific pre-rRNA processing defects in Saccharomyces cerevisiae. In Nucleic acids research, 32, 1404-13. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/14990745/
5. Xu, Siyu, Yamamoto, Naomichi. 2020. Anti-infective nitazoxanide disrupts transcription of ribosome biogenesis-related genes in yeast. In Genes & genomics, 42, 915-926. doi:10.1007/s13258-020-00958-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32524281/