Tango6-KO 基因敲除小鼠

Tango6，也称为coat protein complex I (COPI)囊泡运输系统的一部分，是一个在多种生物学过程中发挥重要作用的基因。COPI囊泡运输系统是一种细胞内囊泡运输系统，负责内质网和高尔基体之间的蛋白质运输。Tango6在调节HSPC增殖和终末造血方面起着至关重要的作用。HSPC（造血干细胞和祖细胞）起源于主动脉-生殖腺-中肾区，并迁移到尾端造血组织（CHT），在CHT中，新生的HSPC经历严格的增殖和分化，以促进终末造血。有效扩增HSPC需要协调已建立的囊泡运输系统和适当的转录因子。然而，潜在的分子尚未被确定。通过大规模筛选斑马鱼幼虫，发现Tango6对于HSPC增殖和终末造血是必不可少的。同源tango6cq72突变体在CHT中表现出HSPC扩增缺陷和造血受损。然而，造血过表达Tango6促进了造血扩增。tango6缺陷导致RNA聚合酶II亚基B的下降和DNA损伤的积累，以一种P53依赖的方式抑制细胞扩增。ikzf1和cmyb（myb）是两个必不可少的造血转录因子，是P53的靶点，并被tango6用于造血。通过补偿tango6cq72突变体中ikzf1和cmyb的丢失，造血表型部分恢复。这项研究揭示了斑马鱼终末造血中一种囊泡运输介导的Tango6-P53-Ikzf1/Cmyb轴[1]。

在精神病患者中，Tango6与童年创伤有关。童年创伤（CT）是精神疾病的一个重要风险因素，可以通过表观遗传机制影响大脑可塑性。在602名患有严重精神疾病的患者中，使用儿童创伤问卷短表进行了基于血液的表观基因组关联研究，分别对五种创伤亚型和总创伤评分进行了DNA甲基化关联研究。将中位数创伤评分设置为预先定义的截止值，以确定创伤是否存在。此外，我们将全基因组结果与注释到与CT相关的候选基因的甲基化探针进行了比较。在患者中，83.2%的人在一种或多种创伤亚型中报告的CT高于截止值，情感忽视是最常报告的创伤亚型。我们发现了一个与TANGO6基因相关的显著不同甲基化位点，与身体忽视有关。与不同创伤类别相关的17个不同甲基化区域（DMRs）被识别。这些DMRs中的一些被注释到以前与神经精神疾病如创伤后应激障碍和认知障碍相关的基因中。我们的结果支持CT和严重精神疾病之间的生物分子关联。以前被认为在CT暴露的精神病患者中甲基化不同的基因，在我们的分析中没有显示出甲基化差异。我们讨论了这种不一致性，我们发现的关联的相关性以及我们研究的局限性[2]。

在牦牛种群中，Tango6与高海拔适应性生态阈值有关。牦牛（Bos grunniens）是青藏高原畜牧业的标志性动物。长期的驯化和自然选择导致牦牛广泛分布，形成了许多适应本地生态环境的生态种群。高海拔与氧气密度密切相关，是生物生存和畜牧业生产的重要环境生态因素。本研究旨在使用下一代测序技术对高海拔适应性生态阈值进行初步分析，以确定牦牛的候选基因。通过对29只高海拔和低海拔分布的牦牛进行全基因组测序，共获得15,762,829个SNPs。根据FST和ZHp的选择性清除分析结果，共识别出21个候选基因。14个基因（丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶TNNI3K、TEN1、DYM、ITPR1、ZC4H2、KNTC1、ADGRB3、CLYBL、TANGO6、ASCC3、KLHL3、PDE4D、DEPDC1B和AGBL4）分为32个基因本体（GO）术语，4个基因（RPS6KA6、ITPR1、GNAO1和PDE4D）注释在35个通路中，包括7个环境信息处理和1个环境适应。因此，本研究中发现的新的候选基因不仅支持关于高海拔适应的新理论，而且还进一步解释了牦牛高海拔适应阈值的分子机制[3]。

在胃癌中，Tango6与癌症依赖基因有关。癌症依赖基因（CDMs）包括一系列基于基因组规模的RNAi的失活筛选，作为科学家研究基因功能的CRISPR-Cas9工具。这些基因参与调节肿瘤细胞的存活和生长，这表明它们可能是恶性肿瘤的潜在治疗靶点。迄今为止，关于CDMs在胃癌中的作用的研究很少，并且只有一小部分CDMs已被研究。本研究从TCGA数据库中提取了差异表达基因（DEGs）数据集，并从中确定了差异表达的CDMs。使用一系列生物信息学方法评估了这些验证的CDMs的功能和预后意义。总共确定了246个差异表达的CDMs，其中147个上调，99个下调。确定了10个CDMs（ALG8、ATRIP、CCT6A、CFDP1、CINP、MED18、METTL1、ORC1、TANGO6和PWP2）与预后相关，并随后基于这些10个CDMs构建了预后模型。与TCGA训练、测试和GSE84437队列中低风险患者的总生存期（OS）相比，高风险患者的OS显著较差。随后证明，对于这种预后模型，TCGA训练和测试队列的ROC曲线下面积分别为0.771和0.697，证明了其在预测GA患者生存方面的可靠性。使用这10个确定的CDMs，我们构建了一个列线图，生成了一个临床实用的模型。随后探索了10个CDMs的调控网络和功能，结果表明，作为与GA患者生存和危险比（HR）显著相关的基因，PWP2通过EMT信号通路促进GA细胞系的体外侵袭和迁移。因此，总的来说，本研究可能有助于了解CDMs在GA中的预后意义和分子功能[4]。

综上所述，Tango6是一个在多种生物学过程中发挥重要作用的基因。它在调节HSPC增殖和终末造血、与童年创伤和精神疾病的相关性、以及高海拔适应性生态阈值方面发挥着重要作用。此外，Tango6还与癌症依赖基因有关，是胃癌中潜在的预后标志物和治疗靶点。因此，Tango6的研究有助于深入理解其在生物学过程和疾病发生中的作用，为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。