Polr3e-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Polr3e-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-08681

品系全称

C57BL/6JCya-Polr3eem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-26939-Polr3e-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Polr3e-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-08681) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
polymerase (RNA) III (DNA directed) polypeptide E
基因别称
RPC5,Sin
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_025298.4 | Ensembl: ENSMUST00000033173
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 4~13
敲除长度
~7950 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Polr3e,也称为RNA聚合酶III亚基E,是RNA聚合酶III(Pol III)的一个亚基,Pol III主要负责转录小非编码RNA,包括5S核糖体RNA、转运RNA(tRNA)和U6小核RNA。这些RNA在RNA成熟和翻译过程中发挥着重要作用。Pol III转录是细胞功能和生物体发育的基础。近年来,研究发现Polr3e的突变与多种遗传性疾病相关,包括免疫缺陷和神经退行性疾病[3]。

Polr3e基因的表达受多种因素的调控。研究表明,一个哺乳动物间插重复序列(MIR)在Polr3e基因的第一个内含子中以反义方向嵌套,并且高度被Pol III占据。通过荧光检测、CRISPR/Cas9介导的MIR在小鼠胚胎干细胞中的删除和染色质免疫沉淀实验,研究人员发现MIR通过转录干扰影响Polr3e的表达。这一发现揭示了Pol II基因可以通过转录嵌入式反义Pol III基因在转录延伸水平上被调控的机制[1]。

此外,Polr3e在先天免疫系统中也发挥着重要作用。研究发现,POLR3E基因的一个罕见纯合突变(D40H)导致RNA聚合酶III活性受损,进而影响先天免疫系统的抗病毒反应。突变患者的成纤维细胞表现出I型干扰素(IFN)诱导受损,并且对人类巨细胞病毒(HCMV)感染更加敏感。该突变导致Pol III启动复合物的组装缺陷,从而导致RNA聚合酶III的转录活性下降。这一研究揭示了Polr3e突变与人类先天免疫缺陷状态的关联[2]。

除了与免疫缺陷相关,Polr3e的突变还与神经退行性疾病相关。研究发现,Polr3e基因的突变与遗传性疾病的发生有关,包括带状疱疹病毒引起的脑炎和肺炎。此外,Polr3e基因的突变还与其他神经退行性疾病相关,如髓鞘形成不良性脑白质营养不良。尽管Polr3e突变与疾病发生之间的关系已被广泛接受,但疾病发病的确切分子机制仍然不清楚[3]。

除了遗传性疾病,Polr3e还与生殖系统疾病相关。研究发现,Polr3e基因的表达与复发性植入失败(RIF)相关。通过转录组学数据分析和机器学习方法,研究人员发现了与RIF相关的代谢基因和特征基因。这些研究为进一步研究RIF的病理机制提供了新的思路[4]。

此外,Polr3e基因的突变还与其他疾病相关。研究发现,16p12.2微缺失的患者表现出严重的颅面异常,如小颌畸形、耳朵和鼻子的软骨畸形以及面部不对称。研究发现,16p12.1区域的基因,包括Polr3e,在神经嵴细胞中表达,并在颅面发育中发挥重要作用。这一发现为进一步研究16p12.1微缺失导致的颅面异常提供了新的线索[5]。

综上所述,Polr3e基因在RNA聚合酶III的转录过程中发挥着重要作用。Polr3e的突变与多种遗传性疾病相关,包括免疫缺陷、神经退行性疾病和生殖系统疾病。Polr3e的研究有助于深入理解Polr3e在基因表达调控和疾病发生中的作用机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Yeganeh, Meghdad, Praz, Viviane, Cousin, Pascal, Hernandez, Nouria. 2017. Transcriptional interference by RNA polymerase III affects expression of the Polr3e gene. In Genes & development, 31, 413-421. doi:10.1101/gad.293324.116. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28289142/
2. Ramanathan, Aravind, Weintraub, Michael, Orlovetskie, Natalie, Elpeleg, Orly, Jarrous, Nayef. 2020. A mutation in POLR3E impairs antiviral immune response and RNA polymerase III. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 117, 22113-22121. doi:10.1073/pnas.2009947117. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32843346/
3. Lata, Elisabeth, Choquet, Karine, Sagliocco, Francis, Bernard, Geneviève, Teichmann, Martin. 2021. RNA Polymerase III Subunit Mutations in Genetic Diseases. In Frontiers in molecular biosciences, 8, 696438. doi:10.3389/fmolb.2021.696438. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34395528/
4. Fan, Yuan, Shi, Cheng, Huang, Nannan, Tian, Li, Wang, Jianliu. 2023. Recurrent Implantation Failure: Bioinformatic Discovery of Biomarkers and Identification of Metabolic Subtypes. In International journal of molecular sciences, 24, . doi:10.3390/ijms241713488. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37686293/
5. Lasser, Micaela, Bolduc, Jessica, Murphy, Luke, Girirajan, Santhosh, Lowery, Laura Anne. 2022. 16p12.1 Deletion Orthologs are Expressed in Motile Neural Crest Cells and are Important for Regulating Craniofacial Development in Xenopus laevis. In Frontiers in genetics, 13, 833083. doi:10.3389/fgene.2022.833083. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35401697/