B3galt1-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

B3galt1-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-08597

品系全称

C57BL/6JCya-B3galt1em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-26877-B3galt1-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: B3galt1-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-08597) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
UDP-Gal:betaGlcNAc beta 1,3-galactosyltransferase, polypeptide 1
基因别称
beta3Gal-T1
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_020283 | Ensembl: ENSMUST00000042456
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1.0 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
B3GALT1,也称为β3-半乳糖基转移酶1,是一种重要的糖基转移酶。它参与细胞表面糖蛋白和糖脂的合成,这些糖蛋白和糖脂在细胞识别、信号传导和免疫反应中发挥重要作用。B3GALT1基因位于2号染色体上,包含31个外显子。该基因的突变可能导致多种疾病,如血型不合、帕金森病和癌症。

血型不合是一种常见的遗传性疾病,由血型抗原的异常表达引起。研究发现,B3GALT1基因的一个新的等位基因,该等位基因在个体中具有303个碱基对的插入,导致P1 k表型[1]。这表明B3GALT1基因的突变可能与血型不合的发生有关。

帕金森病是一种常见的神经退行性疾病,其病因尚不完全清楚。研究发现,B3GALT1基因是帕金森病相关基因之一。通过对2q24.3染色体上的三个基因(B3GALT1、STK39和CERS6)的测序,发现13个外显子变异,包括4个非同义和3个插入/缺失变异(indels)。这些非同义变异和rs2102808,一个GWAS标签SNP,在三个独立系列中进行了基因分型,包括1976名帕金森病患者和1596名对照。结果表明,2q24.3编码的7个变异不是独立负责GWAS关联信号的原因;然而,存在一个单倍型,包含rs2102808和STK39外显子1的6bp indel变异,与帕金森病风险显著相关(Odds Ratio [OR] = 1.35,95% CI:1.11-1.64,P = 0.003)。这个单倍型比每个独立变异与帕金森病风险的相关性更强(OR = 1.23,P = 0.005和1.10,P = 0.10,分别)。这些发现表明,风险变异可能位于非编码区域。需要对该位点进行额外的测序,包括启动子和调控区域,以确定与帕金森病风险增加相关的关联[2]。

癌症是一种复杂的疾病,涉及多种基因的突变和表达异常。研究发现,B3GALT1基因与多种癌症的发生和进展有关。在前列腺癌细胞中,B3GALT1基因的表达受到组蛋白去乙酰化酶抑制剂的影响。组蛋白去乙酰化酶抑制剂SAHA可以增强正常前列腺细胞中B3GALT1基因的表达,从而促进唾液酸Lewis a(sLe(a))的产生。然而,在前列腺癌细胞中,尽管B3GALT1基因表达水平较高,但sLe(a)的产生却受到抑制。这表明B3GALT1基因的表达受到细胞类型特异性的调控,并可能参与癌症的发生和进展[3]。

在卵巢癌中,B3GALT1基因的表达与肿瘤突变负担(TMB)和预后相关。研究发现,TMB水平较高的卵巢癌患者具有更好的总生存期(OS)和无病生存期(DFS)。基于7个TMB相关基因(B3GALT1、LIN7B、ANGPT2、D2HGDH、TAF13、PFDN4和DNAJC19)构建的OS相关预后模型可以将卵巢癌患者分为高和低风险组。而基于4个TMB相关基因(LPIN3、PXYLP1、IGSF23和B3GALT1)构建的DFS相关预后模型同样可以将患者分为高和低风险组。这些结果表明,B3GALT1基因的表达与卵巢癌的预后相关,并且可以用于预测患者的生存期[4]。

在肾肾乳头状细胞癌(KIRP)中,B3GALT1基因的表达与铁死亡相关。研究发现,B3GALT1基因的表达与铁死亡相关长非编码RNA(LNCRNAs)的表达相关。B3GALT1基因在KIRP高风险组中表达显著升高,提示其可能参与KIRP的恶性行为。这些发现表明,B3GALT1基因的表达可能与KIRP的发生和进展有关,并可能作为KIRP的潜在生物标志物[5]。

综上所述,B3GALT1基因是一种重要的糖基转移酶,参与细胞表面糖蛋白和糖脂的合成。B3GALT1基因的突变与血型不合、帕金森病和癌症的发生和进展有关。进一步研究B3GALT1基因的功能和调控机制将有助于深入理解这些疾病的发病机制,并为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Hong, Xiaozhen, Huang, Xinyu, Ma, Kairong, Xu, Xianguo, Zhu, Faming. 2023. A new allele with 303 base pairs insertion in B3GALT1 gene identified in an individual with P1 k phenotype. In Transfusion, 63, E43-E44. doi:10.1111/trf.17455. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37283178/
2. Labbé, Catherine, Ogaki, Kotaro, Lorenzo-Betancor, Oswaldo, Wszolek, Zbigniew K, Ross, Owen A. 2015. Exonic Re-Sequencing of the Chromosome 2q24.3 Parkinson's Disease Locus. In PloS one, 10, e0128586. doi:10.1371/journal.pone.0128586. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26090850/
3. Chachadi, Vishwanath B, Ali, Mohamed F, Cheng, Pi-Wan. 2013. Prostatic cell-specific regulation of the synthesis of MUC1-associated sialyl Lewis a. In PloS one, 8, e57416. doi:10.1371/journal.pone.0057416. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23451223/
4. Liu, Jinhui, Xu, Wei, Li, Siyue, Sun, Rui, Cheng, Wenjun. 2020. Multi-omics analysis of tumor mutational burden combined with prognostic assessment in epithelial ovarian cancer based on TCGA database. In International journal of medical sciences, 17, 3200-3213. doi:10.7150/ijms.50491. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33173439/
5. Wu, Zixuan, Huang, Xuyan, Cai, Minjie, Huang, Peidong. 2022. Potential biomarkers for predicting the overall survival outcome of kidney renal papillary cell carcinoma: an analysis of ferroptosis-related LNCRNAs. In BMC urology, 22, 152. doi:10.1186/s12894-022-01037-0. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36104680/