Lsm12-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Lsm12-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-08574

品系全称

C57BL/6JCya-Lsm12em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-268490-Lsm12-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Lsm12-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-08574) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
LSM12 homolog
基因别称
1110032E16Rik,1110059P07,2600001B17Rik
染色体号
Chr 11 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_172947.3 | Ensembl: ENSMUST00000021297
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~134 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Lsm12,也称为LSM12,是一种重要的RNA结合蛋白,参与调控RNA的代谢和功能。Lsm12属于LSM家族,LSM家族是一类RNA结合蛋白,广泛参与RNA的代谢过程,包括RNA的剪接、转运、降解和稳定性维持等。Lsm12在多种生物学过程中发挥重要作用,包括细胞增殖、分化和凋亡,以及基因表达和信号传导等。

Lsm12在口腔鳞状细胞癌(OSCC)中发挥重要作用。一项研究发现,Lsm12在OSCC组织中显著上调,并且与OSCC的发生和进展密切相关。Lsm12过表达可以促进OSCC细胞的生长、克隆形成、迁移和侵袭能力,而Lsm12敲低则抑制了这些表型,并且明显抑制了体内肿瘤的形成。此外,Lsm12过表达导致了USO1外显子15的包含,而Lsm12敲低则诱导了外显子15的跳跃。与外显子15缺失的USO1相比,外显子15保留的USO1显著促进了OSCC细胞的恶性表型[1]。

Lsm12在肝细胞癌(HCC)中也发挥重要作用。一项研究发现,LSM家族成员在HCC中显著过表达,并且与不良的临床结果相关。LSM家族成员的过表达与更高的TNM分期、更晚的病理分级和更差的预后相关。基于LSM5、LSM10、LSM12和LSM14B的风险评分系统可以可靠地预测HCC患者的总生存期。功能富集分析显示,LSM家族成员的过表达均涉及细胞周期相关的生物学过程。此外,LSM12、LSM14A和LSM14B的过表达与PI3K-Akt-mTOR和T细胞受体信号通路密切相关。过表达LSM12、LSM14A和LSM14B的肿瘤表现出较低的被激活的CD8+ T细胞的浸润,以及较低的细胞毒活性和免疫评分,但增加了Th2细胞的浸润和Th2/Th1比例。LSM12、LSM14A和LSM14B的过表达还与肿瘤相关免疫检查点(如PD-L1、B7-H3和PVR)的表达增加相关,并且增加了对免疫检查点阻断(ICB)治疗的耐受性。此外,LSM12、LSM14A和LSM14B的敲低显著抑制了HCC细胞的增殖和侵袭[2]。

Lsm12在酵母中的研究也取得了重要进展。一项研究发现,Lsm12可以介导DNA聚合酶η的去泛素化,从而帮助酵母抵抗氧化应激。在氧化应激条件下,Lsm12与DNA聚合酶η的UBZ结构域发生物理相互作用,通过Ubp3促进DNA聚合酶η的去泛素化,进而促进DNA聚合酶η的招募。Lsm12的过表达可以增强酵母在氧化应激条件下的生长,而Lsm12的敲除则导致生长缺陷[3]。

Lsm12还参与了细胞内钙信号传导。一项研究发现,Lsm12和JPT2是NAADP结合蛋白,可以与两孔通道(TPCs)相互作用,从而调节细胞内钙信号传导。TPCs是一类参与细胞内钙信号传导的阳离子通道,而NAADP是一种第二信使分子,可以促进细胞内钙的动员。Lsm12和JPT2的发现为理解NAADP介导的钙信号传导提供了新的分子基础[4]。

Lsm12在果蝇的生物钟调控中也发挥重要作用。一项研究发现,Lsm12和ME31B/DDX6是ATX2相关蛋白复合物中的两个重要组分,对于维持生物钟节律至关重要。Lsm12作为分子适配器,招募TWENTY-FOUR(TYF)到ATX2,从而刺激TYF依赖的翻译,维持24小时生物钟节律。而ME31B/DDX6则参与NOT1介导的基因沉默,并与NOT1相互作用。ME31B/DDX6-NOT1复合物不影响PER的翻译,但支持ATX2相关的高振幅行为节律,表明ATX2具有PER独立的生物钟功能[5]。

Lsm12在结直肠癌(CRC)中也有研究。一项研究发现,AKT3、LSM12、MEF2C和RAB30在结直肠癌细胞外囊泡中的表达水平与肿瘤免疫浸润水平显著相关。基于神经网络模型的性能评估显示,该模型在预测免疫浸润水平和其在癌症转移和进展中的作用方面表现优于现有方法。该模型可以作为预测CRC诊断、治疗和预后的潜在工具[6]。

Lsm12在皮肤黑色素瘤(SKCM)中也发挥重要作用。一项研究发现,LSM家族成员在SKCM中的表达谱和预后价值存在差异。LSM2、LSM4和LSM12在SKCM中的mRNA和蛋白质表达水平显著升高。LSM2和LSM4的过表达与SKCM患者的不良总体生存期相关,而LSM2的过表达与较差的无病生存期相关。LSM2的过表达是SKCM的独立危险因素,并且具有高预后价值。LSM2、LSM4和LSM12的过表达与免疫细胞浸润和免疫调节因子相关。此外,功能富集分析显示,LSM家族成员主要参与RNA结合蛋白的功能,涉及RNA剪接和降解[7]。

Lsm12在翻译调控中也发挥重要作用。一项研究发现,Lsm12与RNA处理蛋白PBP1和PBP4相互作用。Lsm12的敲除导致蛋白质合成速率、药物敏感性和翻译忠实度等翻译相关表型的改变[8]。

Lsm12在胰腺癌(PAAD)中也发挥重要作用。一项研究发现,Lsm12在PAAD中的表达水平显著升高,并且与不良预后相关。Lsm12与PABPC1、PRPF6、OAS1、RBM5、IPO7、FXR1和RBM6共同构建了一个与PAAD预后相关的风险模型。该模型可以预测PAAD患者的总体生存期,并且具有潜在的临床应用前景[9]。

综上所述,Lsm12是一种重要的RNA结合蛋白,参与调控RNA的代谢和功能。Lsm12在多种疾病中发挥重要作用,包括口腔鳞状细胞癌、肝细胞癌、结直肠癌、皮肤黑色素瘤和胰腺癌等。Lsm12的研究有助于深入理解RNA代谢的生物学功能和疾病发生机制,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略[1,2,3,4,5,6,7,8,9]。

参考文献:
1. Dong, Yan, Xue, Liyan, Zhang, Yan, Lv, Ning, Zhan, Qimin. 2022. Identification of RNA-splicing factor Lsm12 as a novel tumor-associated gene and a potent biomarker in Oral Squamous Cell Carcinoma (OSCC). In Journal of experimental & clinical cancer research : CR, 41, 150. doi:10.1186/s13046-022-02355-9. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35449073/
2. Zhuang, Hongkai, Chen, Bo, Tang, Chenwei, Shang, Changzhen, Chen, Yajin. 2022. Identification of LSM Family Members as Novel Unfavorable Biomarkers in Hepatocellular Carcinoma. In Frontiers in oncology, 12, 871771. doi:10.3389/fonc.2022.871771. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35646684/
3. Yao, Rui, Shi, Liujia, Wu, Chengjin, Liu, Liming, Wu, Jing. 2018. Lsm12 Mediates Deubiquitination of DNA Polymerase η To Help Saccharomyces cerevisiae Resist Oxidative Stress. In Applied and environmental microbiology, 85, . doi:10.1128/AEM.01988-18. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30366994/
4. Shah, Kunal R, Guan, Xin, Yan, Jiusheng. 2022. Diversity of two-pore channels and the accessory NAADP receptors in intracellular Ca2+ signaling. In Cell calcium, 104, 102594. doi:10.1016/j.ceca.2022.102594. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35561646/
5. Lee, Jongbo, Yoo, Eunseok, Lee, Hoyeon, Hur, Jin-Hoe, Lim, Chunghun. . LSM12 and ME31B/DDX6 Define Distinct Modes of Posttranscriptional Regulation by ATAXIN-2 Protein Complex in Drosophila Circadian Pacemaker Neurons. In Molecular cell, 66, 129-140.e7. doi:10.1016/j.molcel.2017.03.004. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/28388438/
6. Wang, Jue, Wu, Sheng, Zhang, Jiuwen, Chen, Jing. 2021. Potential Prognosis and Diagnostic Value of AKT3, LSM12, MEF2C, and RAB30 in Exosomes in Colorectal Cancer on Spark Framework. In Journal of healthcare engineering, 2021, 8218043. doi:10.1155/2021/8218043. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34950443/
7. Melo do Nascimento, Larissa, Terrao, Monica, Marucha, Kevin Kamanyi, Egler, Franziska, Clayton, Christine. 2020. The RNA-associated proteins MKT1 and MKT1L form alternative PBP1-containing complexes in Trypanosoma brucei. In The Journal of biological chemistry, 295, 10940-10955. doi:10.1074/jbc.RA120.013306. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32532821/
8. Sun, Xiaofang, Zhang, Jianping, Xiao, Can, Ge, Zili. 2022. Expression profile and prognostic values of LSM family in skin cutaneous melanoma. In BMC medical genomics, 15, 238. doi:10.1186/s12920-022-01395-6. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36371223/
9. Fleischer, Tracey C, Weaver, Connie M, McAfee, K Jill, Jennings, Jennifer L, Link, Andrew J. . Systematic identification and functional screens of uncharacterized proteins associated with eukaryotic ribosomal complexes. In Genes & development, 20, 1294-307. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16702403/