Or4k49-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Or4k49-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-08245

品系全称

C57BL/6JCya-Or4k49em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-258886-Or4k49-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Or4k49-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-08245) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
olfactory receptor family 4 subfamily K member 49
基因别称
MOR248-8,Olfr1299
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_146884 | Ensembl: ENSMUST00000207228
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 2
敲除长度
~1.6 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Or4k49,是嗅觉受体基因家族中的一个成员。嗅觉受体基因家族是一类编码嗅觉受体的基因,这些基因的表达产物嗅觉受体蛋白位于嗅觉神经元上,负责感知和传递嗅觉信息。Or4k49基因在哺乳动物的嗅觉系统中具有特定的功能,可能参与了某些特定气味分子的识别和感知过程。然而,关于Or4k49基因的具体功能和它在嗅觉识别中的作用机制,目前还缺乏详细的研究数据。

基因的复制和丢失是动物基因组进化的常见事件。在基因复制后,两个副本通常会以相似的速率积累序列变化。但在某些情况下,一个副本会与它的副本产生显著差异。这种现象称为“非对称进化”,在串联基因复制后比在全基因组复制后更为常见,可以产生具有全新功能的基因[1]。基因的非对称进化可能在Or4k49基因的功能分化中发挥作用,使其在嗅觉识别中承担特定的角色。

乳腺癌是一种异质性疾病,大约70%的病例被认为是散发性的,而大约30%的患者则具有家族性乳腺癌。家族性乳腺癌通常与一些具有高、中、低渗透性的易感基因相关。家庭连锁研究已经确定了BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53等高渗透性基因,这些基因与遗传性综合征有关。此外,基于家庭和人群的研究表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1 (FANCJ)、PALB2 (FANCN)和RAD51C (FANCO),与中等乳腺癌风险相关。全基因组关联研究(GWAS)揭示了与乳腺癌风险略有增加或降低的常见低渗透性等位基因。目前,只有高渗透性基因在临床实践中被广泛应用。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将纳入遗传测试。然而,在将多基因面板测试完全纳入临床工作流程之前,还需要对中低风险变异的临床管理进行额外的研究[2]。

工程基因回路是后基因组研究的一个中心焦点。这种回路类似于复杂的电路图,需要数学框架来描述。从工程学的角度来看,构建和分析构成网络的底层子模块是实现这一框架的自然途径。近年来,测序和基因工程实验的进步使得这一方法成为可能,通过设计和实施可进行数学建模和定量分析的合成基因网络。这些发展标志着基因回路学科的兴起,该学科为预测和评估细胞过程的动态提供了一个框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因和细胞疗法具有重要意义[3]。

基因敲除是一种常用的研究基因功能的方法。基因敲除产生完全失去功能的基因型,最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析,基因组中大约四分之一的基因可以是必需基因。与其他基因型-表型关系一样,基因必需性受背景效应的影响,并且可能会因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于某些必需基因,由于基因-基因相互作用,由敲除引起的致死性可以得到挽救。这种“必需性的绕过”(BOE)基因-基因相互作用是一种被低估的遗传抑制类型。最近的一项系统分析发现,令人惊讶的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用得到绕过[4]。

基因调控网络是细胞内部基因和蛋白质之间相互作用的复杂网络。这种网络的连通性产生了分子网络图,类似于复杂的电路图,需要系统理解。基因调控网络在细胞分化、发育、代谢和疾病发生等生物学过程中发挥着重要作用[5]。

植物CARE是一个数据库,包含了植物顺式作用调控元件、增强子和抑制因子。该数据库通过位置矩阵、共有序列和特定启动子序列上的单个位点来表示调控元件。当可用时,还提供了与EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。转录位点数据主要从文献中提取,并辅以越来越多的基于计算机预测的数据。除了特定转录因子位点的描述,还提供了对实验证据的置信度、功能信息和启动子位置的信息。新功能已经实现,以在查询序列中搜索植物顺式作用调控元件。此外,现在还提供了到一种新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因簇。新的调控元件可以自动发送,并在经过编辑后添加到数据库中[6]。

基因片段是基因的一部分,可能包含编码或非编码序列。它们可能在基因表达、调控和功能中发挥重要作用[7]。

植物的抗病性响应依赖于抗性基因。这些基因编码的蛋白质可以识别病原体相关分子模式(PAMPs)和效应蛋白,并触发抗病性反应。抗性基因依赖性抗病性响应是植物免疫系统中的一种重要机制[8]。

MHC基因表达受到多种转录因子的调控。这些转录因子与MHC I类和II类启动子相互作用,影响MHC基因的表达。对与MHC I类和II类启动子相互作用的蛋白质的更好特征化和编码这些转录因子的基因的分离,使这些分子在MHC基因调控中的功能分析成为可能。新技术的应用,如基因组体内足迹分析,对MHC启动子研究提供了对体内蛋白质-DNA相互作用的深入了解。对MHC相关基因的理解也有了新的进展[9]。

基因的定义是一个复杂的问题。随着基因组学的发展,基因的定义也在不断发展。基因被定义为具有编码蛋白质或RNA的潜能的DNA序列。然而,基因的功能和表达也受到表观遗传调控的影响,这为基因的定义带来了新的挑战[10]。

综上所述,Or4k49基因作为嗅觉受体基因家族的一员,可能在嗅觉识别中发挥重要作用。基因的非对称进化可能在Or4k49基因的功能分化中发挥作用,使其在嗅觉识别中承担特定的角色。Or4k49基因的研究有助于深入理解嗅觉识别的分子机制,为嗅觉疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/
7. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
8. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
9. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/
10. Epp, C D. . Definition of a gene. In Nature, 389, 537. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9335484/