Or5d16-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Or5d16-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-08066

品系全称

C57BL/6JCya-Or5d16em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-258636-Or5d16-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Or5d16-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-08066) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
olfactory receptor family 5 subfamily D member 16
基因别称
MOR174-10,Olfr1155
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_146643 | Ensembl: ENSMUST00000099843
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~0.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Or5d16是一种嗅觉受体基因,它编码的蛋白质属于G蛋白偶联受体超家族,这一家族成员在嗅觉信号传导中扮演着重要角色。嗅觉受体基因在哺乳动物中高度多样化,这使得个体能够感知和区分广泛的气味分子。Or5d16基因的产物,即Or5d16蛋白质,能够与特定的气味分子结合,激活细胞内的信号通路,从而引发嗅觉感受。

基因的进化通常伴随着基因复制和基因丢失。在基因复制后,两个副本通常会以大致相同的速率积累序列变化。然而,有时这种序列变化的积累是不均匀的,一个副本会与其副本发生显著差异。这种现象称为“非对称进化”,在串联基因复制后比在全基因组复制后更为常见,并且可以产生实质上新颖的基因。例如,在蛾类、软体动物和哺乳动物的复制同源框基因中观察到非对称进化,每个案例都产生了新的同源框基因,这些基因被招募到新的发育角色中[1]。

乳腺癌是一种异质性疾病,其发生与多种基因相关。除了BRCA1和BRCA2等高外显率基因外,还有许多其他基因也与乳腺癌风险相关。家族性乳腺癌(约占患者的30%)通常与BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53等高外显率基因相关,这些基因负责遗传性综合征。此外,家族性研究和人群研究还表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中等乳腺癌风险相关。全基因组关联研究(GWAS)在乳腺癌中发现了一些与乳腺癌风险略有升高或降低相关的常见低外显率等位基因[2]。

基因调控网络在基因表达调控中起着至关重要的作用。基因调控网络是指基因和蛋白质之间的相互连接,它们构成了复杂的分子网络,类似于复杂的电子电路。为了系统地理解这些网络,需要开发描述电路的数学框架。从工程学的角度来看,构建和分析构成网络的底层子模块是通往这一框架的自然途径。最近的实验进展,包括测序和基因工程,使得设计、实施和数学建模合成基因网络成为可能。这些发展标志着基因电路学科的兴起,该学科为预测和评估细胞过程的动态提供了一个框架。合成基因网络还将导致新的细胞控制逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因与细胞治疗具有重要意义[3]。

基因敲除是一种常用的方法,用于探索基因的功能。基因敲除产生完全的基因功能丧失表型,最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基因组范围敲除分析表明,在基因组中,大约四分之一的基因可以是必需的。与其他基因型-表型关系一样,基因必需性受背景效应的影响,并且可能由于基因-基因相互作用而变化。特别是,对于某些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过外显子抑制因子得到拯救。这种“必需性旁路”(BOE)基因-基因相互作用是一种研究不足的遗传抑制类型。最近的一项系统性分析发现,在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中,几乎30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用得到旁路[4]。

植物CARE是一个数据库,包含植物的顺式作用调控元件、增强子和抑制剂。调控元件由位置矩阵、保守序列和在特定启动子序列上的单个位点表示。当可用时,提供到EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。关于转录位点的数据主要从文献中提取,并辅以越来越多的计算机预测数据。除了对特定转录因子位点的描述外,还提供了实验证据的置信度、功能信息以及在启动子上的位置。新功能已被实施,用于在查询序列中搜索植物顺式作用调控元件。此外,现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因簇。新的调控元件可以自动发送,并在经过审查后添加到数据库中。植物CARE关系数据库可通过万维网获得[5]。

基因片段是指基因的一部分,它们可能由于基因复制、基因丢失或基因重组而产生。基因片段在基因组中可能具有多种功能,包括基因表达调控、基因沉默和基因变异[6]。

植物防御反应受抗性基因的控制。抗性基因编码的蛋白质可以识别病原体相关分子模式(PAMPs)或效应蛋白,并激活植物免疫反应。抗性基因的激活可以导致细胞死亡,形成局部坏死区域,从而阻止病原体扩散[7]。

MHC基因表达受到多种转录因子的调控。这些转录因子包括H-2RIIBP/RXRβ、NKκB、IκB、hXBP-1和NF-Y。新技术的应用,如基因组原位足迹分析,为研究这些启动子上的蛋白-DNA相互作用提供了见解。此外,对MHC相关基因的理解也有了新的进展[8]。

基因的定义是指具有遗传功能的DNA序列,它能够编码蛋白质或RNA分子。基因的产物在细胞活动中发挥重要作用,包括基因表达、蛋白质合成和信号传导[9]。

综上所述,Or5d16是一种嗅觉受体基因,它编码的蛋白质在嗅觉信号传导中发挥重要作用。Or5d16基因的进化可能涉及到非对称进化,这种现象在串联基因复制后比在全基因组复制后更为常见,并且可以产生实质上新颖的基因。乳腺癌的发生与多种基因相关,包括高外显率基因和低外显率基因。基因调控网络在基因表达调控中起着至关重要的作用,而基因敲除是一种常用的方法,用于探索基因的功能。基因片段在基因组中可能具有多种功能,包括基因表达调控、基因沉默和基因变异。植物防御反应受抗性基因的控制,而MHC基因表达受到多种转录因子的调控。基因的定义是指具有遗传功能的DNA序列,它能够编码蛋白质或RNA分子。Or5d16的研究有助于深入理解嗅觉受体的生物学功能和进化机制,为嗅觉疾病的诊断和治疗提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/
7. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
8. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
9. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/