Or4f54-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Or4f54-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-07899

品系全称

C57BL/6JCya-Or4f54em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-258389-Or4f54-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Or4f54-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-07899) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
olfactory receptor family 4 subfamily F member 54
基因别称
MOR245-11,Olfr1278
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_146394 | Ensembl: ENSMUST00000090330
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~0.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Or4f54是一种基因,属于嗅觉受体家族。嗅觉受体基因是编码嗅觉受体的基因,嗅觉受体是位于鼻腔中的嗅觉上皮细胞上的受体蛋白,能够感知气味分子。Or4f54基因在嗅觉信号传导中发挥作用,对于哺乳动物识别和区分不同的气味至关重要。Or4f54基因的表达受到多种因素的调控,包括基因表达调控网络、环境因素和遗传因素等。

基因复制和基因丢失是动物基因组进化中频繁发生的事件,这两种动态过程的平衡导致了不同物种之间基因数量的主要差异。基因复制后,两个子基因通常会以大约相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是不均匀的,其中一个副本会从其同源基因中显著分化。这种“不对称进化”似乎在串联基因复制后比在基因组复制后更常见,并且可以产生实质上新颖的基因[1]。Or4f54基因可能就是通过这种不对称进化过程产生的,具有独特的生物学功能和调控机制。

乳腺癌是一种异质性疾病,其中大多数病例(约70%)被认为是散发的。家族性乳腺癌(约30%的患者)通常在乳腺癌发病率高的家族中发现,与许多高、中、低渗透性易感基因相关。家族连锁研究已经确定了高渗透性基因BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,它们负责遗传综合征。此外,基于家族和人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中等乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)揭示了与乳腺癌风险略微升高或降低的常见低渗透性等位基因。目前,只有高渗透性基因被广泛应用于临床实践。由于下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将包括在遗传测试中。然而,在将多基因面板测试完全实施到临床工作流程之前,需要对中等和低风险变体的临床管理进行额外的研究[2]。Or4f54基因在乳腺癌中的作用尚未被广泛研究,但其作为嗅觉受体基因,可能与乳腺癌的发生和发展有关。

工程基因回路是后基因组时代研究的一个重点。基因和蛋白质之间的连接性产生了类似于复杂电路的分子网络图,需要发展一个数学框架来描述这种电路。从工程的角度来看,通往这种框架的自然途径是构建和分析构成网络的底层子模块。最近在测序和基因工程方面的实验进展使这种方法成为可能,通过设计和实施易于数学建模和定量分析的合成基因网络。这些发展标志着基因回路学科的兴起,为预测和评估细胞过程的动态提供了一个框架。合成基因网络还将导致新的细胞控制逻辑形式,这可能在功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗中具有重要作用[3]。Or4f54基因的研究可以通过构建合成基因回路来深入研究其生物学功能和调控机制。

基因敲除是研究基因功能的一种常用方法,它通过完全丧失基因功能来产生一种基因型。基因敲除的最严重表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中高达约四分之一的基因可能是必需的。与其他基因型-表型关系一样,基因的必需性受背景效应的影响,并且可能因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于某些必需基因,由于基因-基因相互作用,敲除引起的致死性可以被外基因抑制因子拯救。这种“必需性的绕过”(BOE)基因-基因相互作用是一种未被充分研究的遗传抑制类型。最近的一项系统性分析表明,在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中,几乎30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用来绕过。在这里,我回顾了发现和理解必需性绕过的历史和最新进展[4]。Or4f54基因的研究可以采用基因敲除技术来探究其在细胞功能和发育中的重要作用。

基因调控网络是细胞中基因表达调控的关键机制。基因调控网络由多个基因和蛋白质组成,它们相互作用以调控基因表达和细胞功能。基因调控网络的研究对于理解细胞发育、分化和疾病发生机制具有重要意义[5]。Or4f54基因可能参与了基因调控网络,通过与其他基因和蛋白质相互作用来调控其表达和功能。

植物CARE是一个数据库,包含植物顺式作用调控元件、增强子和抑制因子。顺式作用调控元件在特定启动子序列上的位置矩阵、共有序列和单个位点表示。当可用时,提供到EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。关于转录位点的数据主要从文献中提取,并补充了越来越多的计算机预测数据。除了特定转录因子位点的描述,还提供了对实验证据的置信度、功能信息和在启动子上的位置的描述。已经实现了新的功能来在查询序列中搜索植物顺式作用调控元件。此外,现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因簇。新的调控元件可以自动发送,并在经过编辑后添加到数据库中。植物CARE关系数据库可通过万维网在http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCARE/上获得[6]。Or4f54基因的研究可以借助植物CARE数据库来研究其顺式作用调控元件和启动子序列。

综上所述,Or4f54基因是一种重要的嗅觉受体基因,参与嗅觉信号传导和气味识别。Or4f54基因可能通过不对称进化过程产生,具有独特的生物学功能和调控机制。Or4f54基因在乳腺癌中的作用尚未被广泛研究,但其作为嗅觉受体基因,可能与乳腺癌的发生和发展有关。工程基因回路和基因敲除技术可以用于深入研究Or4f54基因的生物学功能和调控机制。基因调控网络的研究对于理解Or4f54基因在细胞功能和发育中的作用具有重要意义。植物CARE数据库可以用于研究Or4f54基因的顺式作用调控元件和启动子序列。进一步研究Or4f54基因将有助于深入理解其生物学功能和调控机制,为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/