Or2l13b-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Or2l13b-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-07871

品系全称

C57BL/6JCya-Or2l13bem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-258354-Or2l13b-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Or2l13b-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-07871) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
olfactory receptor family 2 subfamily L member 13B
基因别称
MOR271-1,Olfr168
染色体号
Chr 16 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_146357 | Ensembl: ENSMUST00000078554
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~0.9 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:3030002Homozygous null mice exhibit platelets with increased granule content and increased reactivity to thrombin and accelerated aortic aneurysm growth and rupture in an abdominal aortic aneurysm model.
Or2l13b是一种嗅觉受体基因,属于G蛋白偶联受体家族,负责识别和转导气味分子信号。嗅觉受体基因在嗅觉通路中起着关键作用,它们能够识别各种气味分子,并通过G蛋白信号通路将信息传递到大脑,从而产生嗅觉感知。

Or2l13b基因位于小鼠的第6号染色体上,由一个外显子和一个内含子组成。该基因编码一个由313个氨基酸组成的蛋白质,其结构包括七个跨膜结构域和一个细胞外N端结构域。Or2l13b基因的表达主要在嗅觉上皮组织中,特别是嗅觉受体神经元中。这些神经元位于鼻腔内,负责感受气味分子并将其转化为电信号。

在进化过程中,基因复制和基因丢失是动物基因组中频繁发生的事件。基因复制后,两个拷贝通常会以相似的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是不均匀的,其中一个拷贝会与另一个拷贝发生显著的分化。这种“非对称进化”在串联基因复制后比在整个基因组复制后更为常见,并且可以产生具有新功能的基因。例如,在蛾类、软体动物和哺乳动物的复制同源框基因中,非对称进化产生了新的同源框基因,并被招募到新的发育角色中[1]。

乳腺癌是一种异质性疾病,大多数乳腺癌病例(约70%)被认为是散发性的。家族性乳腺癌(约30%的患者)通常在乳腺癌发病率高的家族中观察到,与许多高、中、低渗透性易感基因相关。家系连锁研究已经确定了高渗透性基因,如BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,这些基因负责遗传综合征。此外,基于家系和人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中度乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)揭示了许多与乳腺癌风险略有增加或减少的常见低渗透性等位基因。目前,只有高渗透性基因在临床实践中得到广泛应用。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将纳入基因检测。然而,在多基因面板检测完全实施到临床工作流程之前,需要进一步研究临床管理中中度风险和低风险变异[2]。

基因调控网络是生物信息学领域的一个重要研究方向,旨在理解基因和蛋白质之间的连接如何产生细胞现象。这种连接产生了类似于复杂电路的分子网络图,需要开发一个数学框架来描述电路。从工程角度来看,构建和分析构成网络的底层子模块是构建此类框架的自然途径。最近在测序和基因工程方面的实验进展使得通过设计和实施可进行数学建模和定量分析的合成基因网络来实现这一方法成为可能。这些发展标志着基因电路学科的兴起,它提供了一个预测和评估细胞过程动力学的框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能在功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗方面具有重要作用[3]。

理解基因型-表型关系是生物学中的一个核心目标。基因敲除产生完全的基因失活表型,是探索基因功能的一种常用方法。基因敲除最严重的表型后果是致死性。具有致死性基因敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中高达约四分之一的基因可能是必需的。与其他基因型-表型关系一样,基因必需性受背景效应的影响,并且可能因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于一些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过非基因抑制因子得到挽救。这种“必需性旁路”(BOE)基因-基因相互作用是一种被忽视的遗传抑制类型。最近的一项系统分析表明,在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中,近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用得到旁路[4]。

植物CARE是一个植物顺式作用调控元件数据库,包括增强子和抑制因子。调控元件由位置矩阵、一致性序列和特定启动子序列上的单个位点表示。当可用时,提供到EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。转录位点的数据主要从文献中提取,并补充了越来越多的计算机预测数据。除了特定转录因子位点的通用描述外,还提供了实验证据的置信度、功能信息和启动子上的位置。已经实施了新的功能来搜索查询序列中的植物顺式作用调控元件。此外,现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因簇。新的调控元件可以自动发送,并在经过编辑后添加到数据库中。植物CARE关系数据库可通过万维网获得[5]。

基因片段是基因的一部分,可能包含一个或多个外显子。这些片段在基因表达和调控中起着重要作用。基因片段可以通过基因重组、基因复制和基因丢失等过程产生。基因片段的研究有助于理解基因结构和功能,以及它们在生物体中的进化[6]。

植物抗性基因依赖的防御反应是植物免疫系统的重要组成部分。这些反应依赖于抗性基因的激活,这些基因编码的蛋白质能够识别病原体并触发免疫反应。抗性基因依赖的防御反应包括细胞壁强化、活性氧产生、抗微生物物质分泌和系统获得性抗性等。这些反应有助于植物抵抗病原体的侵害,并保护植物免受疾病的影响[7]。

MHC基因的表达调控是一个复杂的过程,涉及多种转录因子和信号通路。MHC基因编码的蛋白质在免疫系统中的抗原呈递和免疫应答中起着关键作用。近年来,对MHC基因调控的研究取得了重要进展,包括对与MHC基因启动子相互作用的蛋白质的更好表征,以及编码这些转录因子的基因的分离。新的技术,如基因组体内足迹分析,已被应用于研究这些启动子,以深入了解蛋白质-DNA相互作用的状态。此外,对MHC相关基因的理解也取得了新的进展[8]。

综上所述,Or2l13b是一种重要的嗅觉受体基因,参与嗅觉感知过程。基因复制和基因丢失是动物基因组中频繁发生的事件,非对称进化可以产生具有新功能的基因。乳腺癌的家族性风险与多种基因相关,包括BRCA1、BRCA2等。基因调控网络是生物信息学领域的一个重要研究方向,基因电路学科的发展为预测和评估细胞过程动力学提供了框架。基因必需性的旁路(BOE)相互作用是一种被忽视的遗传抑制类型。植物CARE数据库为植物顺式作用调控元件的研究提供了重要的资源。基因片段在基因表达和调控中起着重要作用。植物抗性基因依赖的防御反应是植物免疫系统的重要组成部分。MHC基因的表达调控是一个复杂的过程,涉及多种转录因子和信号通路。

参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
7. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
8. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/