Or4f57-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Or4f57-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-07799

品系全称

C57BL/6JCya-Or4f57em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-258258-Or4f57-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Or4f57-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-07799) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
olfactory receptor family 4 subfamily F member 57
基因别称
MOR245-22,Olfr1308
染色体号
Chr 2 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_207151 | Ensembl: ENSMUST00000099605
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~1.0 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
OR4F57是一种位于人类染色体11q13.5的基因,编码一种气味受体蛋白,属于G蛋白偶联受体(GPCR)家族。气味受体蛋白在嗅觉感知中发挥关键作用,它们能够识别并结合特定气味分子,触发细胞内信号传导,进而引发嗅觉感受[9]。OR4F57基因的突变可能导致嗅觉障碍,影响个体的嗅觉功能[10]。

在进化过程中,基因复制和基因丢失是动物基因组中频繁发生的事件,这种动态过程在物种间基因数量的差异中发挥着重要作用。基因复制后,两个子基因通常会以大致相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是不均匀的,一个拷贝会从其同源基因中显著分化出来。这种“不对称进化”在串联基因复制后比在基因组复制后更为常见,并且可以产生全新的基因。在蛾类、软体动物和哺乳动物的复制同源基因中,已经描述了不对称进化的例子,每个例子都产生了新的同源基因,并被招募到新的发育角色中[1]。因此,OR4F57基因的进化可能也经历了类似的复制和分化过程,导致其在嗅觉感知中具有特定的功能。

乳腺癌是一种异质性疾病,大多数乳腺癌病例(约70%)被认为是散发的。家族性乳腺癌(约30%的患者)通常发生在乳腺癌发病率高的家庭中,与多种高、中、低渗透率的易感基因相关。家族连锁研究已确定了高渗透率基因,如BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,它们负责遗传综合征。此外,家族和群体研究方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中等的乳腺癌风险相关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)揭示了与略微增加或降低乳腺癌风险相关的常见低渗透率等位基因。目前,只有高渗透率基因在临床实践中被广泛使用。随着下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将被纳入遗传测试。然而,在将多基因面板测试完全纳入临床工作流程之前,需要对中度和低风险变异的临床管理进行更多研究。在这篇综述中,我们重点关注家族性乳腺癌风险的不同组成部分[2]。OR4F57基因是否与乳腺癌风险相关还需要进一步研究。

基因调控网络是细胞内基因和蛋白质相互作用的结果,这种相互作用产生分子网络图,类似于复杂的电路。了解这种连通性需要开发描述电路的数学框架。从工程的角度来看,通往这样一个框架的自然途径是构建和分析构成网络的底层子模块。近年来,在测序和基因工程方面的实验进展使得通过设计和实施适合数学建模和定量分析的合成基因网络来实现这种方法成为可能。这些进展标志着基因电路学科的兴起,它提供了一个预测和评估细胞过程动态的框架。合成基因网络还将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因和细胞治疗具有重要意义[3]。OR4F57基因的表达可能受到基因调控网络的影响,进一步研究可以揭示其在嗅觉感知中的调控机制。

基因敲除是一种常用的方法,用于探索基因功能。基因敲除会产生一个完全的基因功能缺失表型,最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中高达四分之一的基因可能是必需的。与基因型-表型关系一样,基因必需性也受到背景效应的影响,并且可能因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于某些必需基因,由敲除引起的致死性可以通过非等位基因抑制因子来挽救。这种“必需性回避”(BOE)基因-基因相互作用是一种未被充分研究的遗传抑制类型。最近的一项系统性分析表明,在裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中,近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用来避免。在这里,我回顾了揭示和理解必需性回避的历史和最新进展[4]。OR4F57基因是否为必需基因,以及其功能缺失是否会导致致死性,需要进一步研究。

植物CARE数据库是一个植物顺式作用调节元件、增强子和抑制剂的数据库。调节元件由位置矩阵、一致性序列和特定启动子序列上的单个位点表示。当可用时,提供到EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。转录位点的数据主要从文献中提取,并用越来越多的计算机预测数据补充。除了对特定转录因子位点的通用描述外,还提供了实验证据的置信度水平、功能信息和在启动子上的位置。新功能已被实施,以在查询序列中搜索植物顺式作用调节元件。此外,现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因簇。新的调节元件可以自动发送,并在经过审核后添加到数据库中。植物CARE关系数据库可通过互联网在http://sphinx.rug.ac.be:8080/PlantCARE/上获得[5]。OR4F57基因的启动子区域可能包含顺式作用调节元件,影响其表达。

基因片段是基因的一部分,可能参与特定的生物学功能。基因片段的研究有助于揭示基因的调控机制和功能[6]。

植物依赖于抗性基因来启动针对病原体入侵的防御反应。抗性基因(R基因)编码的NLR蛋白是植物免疫系统的关键组成部分,它们能够识别病原体相关的分子模式(PAMPs)或效应因子,并触发免疫反应。抗性基因的表达和功能受到复杂的调控,包括转录水平的调控、翻译水平的调控和蛋白质水平的调控。转录水平的调控主要包括启动子区域顺式作用元件的识别和转录因子的结合。翻译水平的调控主要包括mRNA的稳定性和蛋白质合成的效率。蛋白质水平的调控主要包括蛋白质的折叠、修饰、定位和降解。了解抗性基因的调控机制对于提高植物的抗病性具有重要意义[7]。OR4F57基因是否与植物抗病性相关,以及其是否受到抗性基因的调控,需要进一步研究。

主要组织相容性复合体(MHC)基因的表达受到复杂的调控。MHC基因编码的蛋白质在免疫系统中发挥重要作用,它们能够呈递抗原肽给T细胞,从而引发免疫反应。MHC基因的表达受到多种因素的调控,包括转录因子的结合、染色质结构的改变和表观遗传修饰。转录因子的结合是MHC基因表达调控的主要机制之一,多种转录因子能够与MHC基因的启动子区域结合,并影响其转录活性。染色质结构的改变也能够影响MHC基因的表达,例如组蛋白修饰和染色质重塑。表观遗传修饰,如DNA甲基化和组蛋白修饰,也能够影响MHC基因的表达。了解MHC基因的调控机制对于深入研究免疫系统和疾病的发生机制具有重要意义[8]。OR4F57基因是否与MHC基因的调控相关,以及其在免疫系统中的作用,需要进一步研究。

基因的定义是一个有争议的问题,不同的研究者可能会给出不同的定义。一些研究者认为,基因是一个编码蛋白质的DNA序列,而另一些研究者认为,基因是一个编码RNA或蛋白质的DNA序列。还有一些研究者认为,基因是一个具有特定生物学功能的DNA序列。基因的定义对于基因研究和应用具有重要意义,因为它决定了基因的识别、分离和操作。随着基因研究的深入,基因的定义可能会不断发展和完善[10]。OR4F57基因的定义需要根据其结构和功能来确定。

综上所述,OR4F57基因是一种编码气味受体蛋白的基因,在嗅觉感知中发挥重要作用。OR4F57基因的进化可能经历了复制和分化过程,导致其在嗅觉感知中具有特定的功能。OR4F57基因的表达可能受到基因调控网络的影响,进一步研究可以揭示其在嗅觉感知中的调控机制。OR4F57基因是否为必需基因,以及其功能缺失是否会导致致死性,需要进一步研究。OR4F57基因的启动子区域可能包含顺式作用调节元件,影响其表达。OR4F57基因是否与植物抗病性相关,以及其是否受到抗性基因的调控,需要进一步研究。OR4F57基因是否与MHC基因的调控相关,以及其在免疫系统中的作用,需要进一步研究。OR4F57基因的定义需要根据其结构和功能来确定。OR4F57基因的研究有助于深入理解嗅觉感知的分子机制,为嗅觉障碍的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/
7. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
8. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
9. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/
10. Epp, C D. . Definition of a gene. In Nature, 389, 537. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9335484/