Or12d2-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Or12d2-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-07783

品系全称

C57BL/6JCya-Or12d2em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-258218-Or12d2-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Or12d2-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-07783) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
olfactory receptor family 12 subfamily D member 2
基因别称
MOR250-4,Olfr102
染色体号
Chr 17 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001011721 | Ensembl: ENSMUST00000169373
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~1.0 kb
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
OR12D2是一种编码嗅觉受体的基因,位于人类6号染色体上的主要组织相容性复合体(MHC)区域。嗅觉受体基因是人类基因组中最大的基因家族,负责识别和传递嗅觉信息。OR12D2基因编码的蛋白质属于G蛋白偶联受体家族,其功能是通过识别特定气味分子来激活嗅觉信号通路。基因的变异和表达水平可能与个体嗅觉敏感性和疾病易感性有关。

根据Kulski等人的研究[1],位于OR12D2基因附近的Alu重复序列的多态性(存在或缺失)与HLA-A等位基因之间存在显著的连锁不平衡。这项研究调查了100个日本人、174个高加索人和100个非裔美国人的DNA样本,发现AluOR插入序列在人群中的频率存在显著差异,特别是在日本人和高加索人之间。尽管AluOR位于HLA-A基因的600 kb处,但两个位点之间存在显著的连锁不平衡,并且在高加索人中,AluOR插入与HLA-A29存在高度相关(79%),在日本人中与HLA-A31存在高度相关(69.4%)。这些发现表明,AluOR可以作为识别不同人群中的谱系和变异的祖先标记,并有助于研究MHC和OR基因区域之间的连锁和交换。

Kulski等人的另一项研究[2]表明,SNP密度交叉点与假定的祖先重组位点相关,这些位点广泛分布于MHC I类基因组的区域,从端粒的OR12D2基因到着丝粒的MICB基因。该研究使用来自NCBI公共BioProject数据库的95个MHC基因组序列,鉴定和描述了多态性HLA类I基因和假基因、MICA和MICB,以及作为单倍型谱系标记的逆转录元件插入缺失和SNP交叉位点。通过比较不同单倍型的DNA序列比对,确定了12个单倍型逆转录元件标记,并将HLA-A/B/C单倍型划分为不同的进化谱系。研究发现,SNP交叉点发生在特定的转座元件、长链非编码RNA、OR12D2、MUC21、MUC22、PSORS1A3、HLA-C、HLA-B和MICA等区域。这些研究结果表明,SNP密度交叉点与假定的祖先重组位点相关,并且MHC同合子细胞系的基因组序列对于分析单倍型块、祖先单倍型景观和标记、保守多态序列以及SNP密度交叉点非常有用。

Almandil等人的研究[3]发现,在沙特女性中,OR12D2和OR5V1基因的多个变异与自闭症谱系障碍(ASD)相关。这项研究对22名沙特女性ASD患者和51名对照者进行了全外显子组分析,确定了5个与自闭症相关的风险SNPs。通过单倍型分析,发现这些风险SNPs在OR12D2和OR5V1基因簇中高度连锁不平衡。此外,与男性ASD患者相比,沙特女性ASD患者中有39个基因是独特的生物标志物。这些发现表明,OR12D2和OR5V1基因的多个变异与沙特女性自闭症的发生发展相关。

da Silva等人的研究[4]调查了OR2W6P、OR2B8P、OR1F12和OR12D2基因的遗传多样性,并测量了这些基因与HLA-A、HLA-B和HLA-DRB1基因之间的连锁不平衡(LD)程度。研究使用了来自61个家庭三联体的样本,并对30个SNPs进行了评估。研究结果表明,OR基因和MHC基因之间的LD程度并不强,因此不足以支持针对特定HLA-OR单倍型的选择。

Lee等人的研究[5]在All of Us研究计划中对弱视进行了全基因组关联研究和罕见变异关联研究。研究比较了764名弱视患者和122,305名无弱视记录的对照者的基因型数据。研究发现,4个位点与弱视显著相关,其中包括OR12D2基因。此外,研究还确定了15个基因在弱视中具有显著的不同变异负担,包括OR12D2。这些基因的发现表明,弱视的神经发育变化不仅与异常视觉经验有关,还可能是由初级神经发育缺陷与异常经验相互作用的结果。

综上所述,OR12D2基因的研究涉及多个方面,包括与HLA基因的连锁不平衡、与自闭症谱系障碍的相关性以及与弱视的关联。这些研究结果表明,OR12D2基因的变异和表达水平可能与个体嗅觉敏感性和疾病易感性有关。进一步研究OR12D2基因的功能和调控机制,有助于深入理解嗅觉感知和神经发育的生物学过程,并为相关疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Kulski, J K, Shigenari, A, Inoko, H. 2013. Variation and linkage disequilibrium between a structurally polymorphic Alu located near the OR12D2 gene of the extended major histocompatibility complex class I region and HLA-A alleles. In International journal of immunogenetics, 41, 250-61. doi:10.1111/iji.12102. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24305111/
2. Kulski, Jerzy K, Suzuki, Shingo, Shiina, Takashi. 2021. SNP-Density Crossover Maps of Polymorphic Transposable Elements and HLA Genes Within MHC Class I Haplotype Blocks and Junction. In Frontiers in genetics, 11, 594318. doi:10.3389/fgene.2020.594318. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33537058/
3. Almandil, Noor B, Alismail, Maram Adnan, Alsuwat, Hind Saleh, AbdulAzeez, Sayed, Borgio, J Francis. 2023. Exome-wide analysis identify multiple variations in olfactory receptor genes (OR12D2 and OR5V1) associated with autism spectrum disorder in Saudi females. In Frontiers in medicine, 10, 1051039. doi:10.3389/fmed.2023.1051039. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36817779/
4. da Silva, José Samuel, Wowk, Pryscilla Fanini, Poerner, Fabiana, Santos, Pablo Sandro Carvalho, Bicalho, Maria da Graça. 2013. Absence of strong linkage disequilibrium between odorant receptor alleles and the major histocompatibility complex. In Human immunology, 74, 1619-23. doi:10.1016/j.humimm.2013.08.005. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23974053/
5. Lee, Kyoung A Viola, Aboobakar, Inas F, Jain, Ashish, Oke, Isdin, Whitman, Mary C. 2025. Genome-Wide and Rare Variant Association Studies of Amblyopia in the All of Us Research Program. In Ophthalmology, , . doi:10.1016/j.ophtha.2025.01.013. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/39842729/