Vmn1r72-KO 基因敲除小鼠

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产品名称

Vmn1r72-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-07676

品系全称

C57BL/6JCya-Vmn1r72em1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-252905-Vmn1r72-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Vmn1r72-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-07676) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量

基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
vomeronasal 1 receptor 72
基因别称
V1rg1
染色体号
Chr 7 (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_145843.1 | Ensembl: ENSMUST00000053134
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 1
敲除长度
~916 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
Vmn1r72,也称为V1r72,是小鼠和大鼠的一种基因,编码一个属于V1r亚家族的气味受体。V1r亚家族是气味受体基因家族的一部分,该家族在哺乳动物中负责检测和识别化学信号。Vmn1r72基因位于小鼠的第6号染色体上,其编码的蛋白质属于G蛋白偶联受体(GPCR)超家族,这一超家族的成员在多种生物过程中发挥着重要作用,包括信号传导、细胞增殖、发育和免疫反应。

在哺乳动物中,V1r基因家族的表达主要局限于鼻腔中的嗅觉上皮细胞。这些基因的产物参与检测和识别特定的气味分子,这些分子与动物的繁殖、社交互动和生存有关。Vmn1r72基因的功能可能涉及对特定气味分子的识别,这些分子在动物的繁殖行为、领地标记和寻找食物等方面发挥着重要作用。

研究表明,基因复制和基因丢失是动物基因组进化的频繁事件,这些动态过程之间的平衡导致了不同物种之间基因数量的显著差异。在基因复制后,两个基因副本通常以大致相同的速率积累序列变化。然而,在某些情况下,序列变化的积累是不均匀的,其中一个副本与它的同源基因相比发生了显著的分化。这种“非对称进化”在串联基因复制后比在基因组复制后更为常见,并且可以产生实质上新的基因[1]。这种非对称进化可能也适用于Vmn1r72基因,它可能起源于一个祖先基因,并通过非对称进化获得了新的功能。

乳腺癌是一种异质性疾病,其中大多数病例(约70%)被认为是散发的。家族性乳腺癌(约30%的患者)通常在乳腺癌发病率高的家族中观察到,并与多种高、中、低外显率的易感基因有关。家系连锁研究已经确定了高外显率基因,如BRCA1、BRCA2、PTEN和TP53,这些基因负责遗传综合征。此外,基于家系和人群的方法表明,参与DNA修复的基因,如CHEK2、ATM、BRIP1(FANCJ)、PALB2(FANCN)和RAD51C(FANCO),与中等乳腺癌风险有关。乳腺癌的全基因组关联研究(GWAS)揭示了许多与乳腺癌风险略有增加或减少的常见低外显率等位基因。目前,只有高外显率基因在临床实践中被广泛使用。由于下一代测序技术的发展,预计所有家族性乳腺癌基因都将被纳入遗传检测。然而,在将多基因面板检测完全纳入临床工作流程之前,需要对中度和低风险变异的临床管理进行更多研究[2]。这些发现强调了基因变异在疾病发展中的重要性,可能也适用于Vmn1r72基因,其变异可能影响其功能并导致疾病风险。

基因电路工程是后基因组研究的一个主要焦点,旨在了解基因和蛋白质的连通性如何产生细胞现象。这种连通性产生了类似于复杂电子电路的分子网络图,要系统地理解这些网络,需要开发描述电路的数学框架。从工程学的角度来看,构建和分析构成网络的底层子模块是通向这一框架的自然途径。测序和基因工程方面的最新实验进展使得设计、实施和分析适用于数学建模和定量分析的合成基因网络成为可能。这些发展标志着基因电路学科的兴起,该学科为预测和评估细胞过程的动态提供了一个框架。合成基因网络也将导致细胞控制的新逻辑形式,这可能对功能基因组学、纳米技术和基因与细胞治疗具有重要意义[3]。这些进展可能为Vmn1r72基因的研究提供新的方法,例如通过合成基因网络来研究其功能和调节。

基因敲除是一种常用的方法,用于探索基因功能。基因敲除产生完全的基因失活表型,最严重的表型后果是致死性。具有致死性敲除表型的基因被称为必需基因。基于酵母的全基因组敲除分析表明,基因组中高达约四分之一的基因可能是必需的。与其他基因型-表型关系一样,基因必需性受背景效应的影响,并且可能因基因-基因相互作用而变化。特别是,对于一些必需基因,敲除引起的致死性可以通过非基因敲除基因相互作用得到挽救。这种“必需性回避”(BOE)基因-基因相互作用是一种尚未得到充分研究的遗传抑制类型。最近的一项系统分析表明,值得注意的是,裂殖酵母Schizosaccharomyces pombe中近30%的必需基因的必需性可以通过BOE相互作用得到克服[4]。这一发现可能对Vmn1r72基因的研究具有重要意义,因为它表明即使基因敲除可能具有致命后果,也可能存在绕过其必需性的机制。

基因调控网络是细胞中基因表达和调控的核心。这些网络由各种转录因子、DNA结合蛋白、信号分子和它们的相互作用组成,共同调节基因的表达模式。了解基因调控网络对于理解细胞发育、分化、代谢和疾病发生等生物学过程至关重要。然而,基因调控网络的复杂性使得对其全面理解仍然是一个挑战[5]。Vmn1r72基因可能参与基因调控网络,其表达和功能可能受到其他基因和信号分子的调节。因此,研究Vmn1r72基因在基因调控网络中的作用可能有助于揭示其在细胞过程和疾病发生中的功能。

植物CARE数据库是一个植物顺式作用调控元件、增强子和抑制子的数据库,为植物启动子序列的计算机分析提供了工具。该数据库提供了调控元件的定位矩阵、共序列和特定启动子序列上的单个位点。当可用时,还提供了与EMBL、TRANSFAC和MEDLINE数据库的链接。转录位点的数据主要从文献中提取,并辅以越来越多的计算机预测数据。除了特定转录因子位点的通用描述外,还提供了实验证据的置信度水平、功能信息和启动子上的位置。新功能已被实施,以在查询序列中搜索植物顺式作用调控元件。此外,现在还提供了到新的聚类和基序搜索方法的链接,以研究共表达基因簇。新的调控元件可以自动发送,并在经过审查后添加到数据库中[6]。这个数据库可能对研究Vmn1r72基因在植物中的功能和调控具有重要意义。

基因片段是基因序列的一部分,可能包含编码或非编码区域。这些片段可能来自基因的断裂、缺失或插入,并且可能对基因的功能和表达产生重要影响。研究基因片段对于了解基因结构和功能至关重要[7]。Vmn1r72基因的片段可能对其表达和功能产生重要影响,因此,研究这些片段的结构和功能可能有助于揭示其在细胞过程和疾病发生中的功能。

植物抗性基因介导的植物防御反应是植物对病原体和害虫攻击的关键防御机制。这些基因编码的蛋白质参与识别病原体相关分子模式(PAMPs)和效应蛋白,并触发植物免疫反应。植物抗性基因的激活导致一系列细胞反应,包括细胞壁强化、信号传导、转录激活和抗病相关基因的表达[8]。Vmn1r72基因可能在植物免疫反应中发挥作用,其表达和功能可能受到植物抗性基因的调节。因此,研究Vmn1r72基因在植物免疫反应中的作用可能有助于揭示其在植物防御机制中的功能。

MHC基因的表达调控是一个复杂的过程,涉及多种转录因子和信号分子。这些转录因子与MHC基因启动子相互作用,调节基因的表达水平。MHC基因的表达在免疫应答中发挥重要作用,因为它们编码的蛋白质参与抗原呈递和免疫识别。了解MHC基因表达的调控机制对于理解免疫应答和疾病发生至关重要[9]。Vmn1r72基因可能参与MHC基因表达的调控,其表达和功能可能受到MHC基因表达调控机制的影响。因此,研究Vmn1r72基因在MHC基因表达调控中的作用可能有助于揭示其在免疫应答和疾病发生中的功能。

基因的定义是一个有争议的问题,因为它取决于研究者的观点和所使用的定义标准。一些定义侧重于基因的功能,将其定义为编码特定蛋白质或RNA分子的DNA序列。其他定义侧重于基因的结构,将其定义为具有特定组织和排列的DNA序列。还有一些定义侧重于基因的进化历史,将其定义为在进化过程中保持一致的DNA序列[10]。Vmn1r72基因是一个具有特定结构和功能的基因,其表达和功能可能受到多种因素的影响,包括基因调控网络、信号传导和细胞环境。因此,研究Vmn1r72基因的结构和功能对于理解其在细胞过程和疾病发生中的功能至关重要。

综上所述,Vmn1r72基因是一种编码气味受体的基因,其表达和功能可能受到多种因素的影响,包括基因调控网络、信号传导、细胞环境和其他基因的相互作用。Vmn1r72基因可能在哺乳动物和植物的多种生物学过程中发挥作用,包括嗅觉识别、免疫反应和基因表达调控。研究Vmn1r72基因的结构、功能和调控机制对于理解其在细胞过程和疾病发生中的功能具有重要意义。

参考文献:
1. Holland, Peter W H, Marlétaz, Ferdinand, Maeso, Ignacio, Dunwell, Thomas L, Paps, Jordi. . New genes from old: asymmetric divergence of gene duplicates and the evolution of development. In Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences, 372, . doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27994121/
2. Filippini, Sandra E, Vega, Ana. 2013. Breast cancer genes: beyond BRCA1 and BRCA2. In Frontiers in bioscience (Landmark edition), 18, 1358-72. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23747889/
3. Hasty, Jeff, McMillen, David, Collins, J J. . Engineered gene circuits. In Nature, 420, 224-30. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/12432407/
4. Du, Li-Lin. 2020. Resurrection from lethal knockouts: Bypass of gene essentiality. In Biochemical and biophysical research communications, 528, 405-412. doi:10.1016/j.bbrc.2020.05.207. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32507598/
5. Davidson, Eric, Levin, Michael. 2005. Gene regulatory networks. In Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 102, 4935. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15809445/
6. Lescot, Magali, Déhais, Patrice, Thijs, Gert, Rouzé, Pierre, Rombauts, Stephane. . PlantCARE, a database of plant cis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysis of promoter sequences. In Nucleic acids research, 30, 325-7. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/11752327/
7. Mateles, R I. . Gene fragments. In Bio/technology (Nature Publishing Company), 10, 456. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/1368495/
8. Hammond-Kosack, K E, Jones, J D. . Resistance gene-dependent plant defense responses. In The Plant cell, 8, 1773-91. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8914325/
9. Ting, J P, Baldwin, A S. . Regulation of MHC gene expression. In Current opinion in immunology, 5, 8-16. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/8452678/
10. Epp, C D. . Definition of a gene. In Nature, 389, 537. doi:. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/9335484/