Hdx-KO 基因敲除小鼠

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复苏/繁育服务
产品名称

Hdx-KO 基因敲除小鼠

产品编号

S-KO-07607

品系全称

C57BL/6JCya-Hdxem1/Cya

品系背景

C57BL/6JCya

品系编号

KOCMP-245596-Hdx-B6J-VA

品系状态

使用本品系发表的文献需注明: Hdx-KO 基因敲除小鼠 mice (Strain S-KO-07607) were purchased from Cyagen.
交付类型
周龄
性别
基因型
数量
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基本信息

基因研究概述

质控标准

基因
基因全称
highly divergent homeobox
基因别称
D030011N01Rik,Gm380
染色体号
Chr X (Mouse)
转录本 ID
NCBI: NM_001080549.2 | Ensembl: ENSMUST00000113422
修饰方式
全身性基因敲除
靶向范围
Exon 3
敲除长度
~1110 bp
品系说明
该品系是基于策略设计时的数据库信息制作而成,建议您在购买前查询最新的数据库和相关文献,以获取最准确的表型信息。
表型提示
MGI:2685226Male chimeras hemizygous for a gene trapped allele appear normal at E9.5.
HDX,也称为氢/氘交换,是一种广泛应用的生物化学技术,用于研究蛋白质的动态结构和功能。通过分析蛋白质在氢/氘交换过程中的动力学,HDX可以揭示蛋白质的结构变化和功能调节机制。在蛋白质研究中,HDX被证明是一种非常有用的工具,可以提供关于蛋白质结构、功能、相互作用和动态变化的信息。

在生物医学研究中,HDX已被应用于多种蛋白质的研究,包括信号转导蛋白、转录因子、酶和受体等。例如,在维生素D受体/视黄酸X受体-α异源二聚体(VDRRXRα)的研究中,HDX揭示了DNA序列特异性VDR共激活因子相互作用的构象动力学。研究发现,配体结合和DNA序列共同决定了VDRRXRα的转录活性,从而影响特定靶基因的表达[2]。

此外,HDX还应用于其他蛋白质的研究,例如BAK和SOST。在BAK的研究中,HDX揭示了膜结合BAK的动态重构过程,以及激活后BAK的构象变化[4]。在SOST的研究中,HDX-MS分析了SOST-LRP6 E1E2复合物的构象动力学,揭示了SOST C端尾部对LRP6构象的影响,并提出了一个新的SOST C端区域与LRP6结合的潜在界面[1]。

除了蛋白质研究,HDX还可以用于研究RNA的动态结构。例如,在RIG-I的研究中,HDX揭示了RIG-I对自身RNA的识别机制,以及RIG-I突变导致自身免疫的机制[3]。此外,HDX还可以用于研究DNA的结构和功能,例如在VDRRXRα的研究中,HDX揭示了DNA序列特异性VDR共激活因子相互作用的构象动力学[2]。

综上所述,HDX是一种非常有用的生物化学技术,可以提供关于蛋白质、RNA和DNA的动态结构和功能的信息。在生物医学研究中,HDX已被广泛应用于多种蛋白质的研究,包括信号转导蛋白、转录因子、酶和受体等。HDX的研究有助于深入理解生物分子的结构和功能,为疾病的治疗和预防提供新的思路和策略。

参考文献:
1. Jeong, Yejing, Kim, Jinuk, Choi, Hee-Jung, Chung, Ka Young. . Conformational Dynamics of Sclerostin-LRP6 Complex Analyzed by HDX-MS. In Biomolecules & therapeutics, 29, 527-535. doi:10.4062/biomolther.2020.234. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33833136/
2. Zheng, Jie, Chang, Mi Ra, Stites, Ryan E, Dodge, Jeffrey A, Griffin, Patrick R. 2017. HDX reveals the conformational dynamics of DNA sequence specific VDR co-activator interactions. In Nature communications, 8, 923. doi:10.1038/s41467-017-00978-7. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29030554/
3. Zheng, Jie, Wang, Chen, Chang, Mi Ra, Marcotrigiano, Joseph, Griffin, Patrick R. 2018. HDX-MS reveals dysregulated checkpoints that compromise discrimination against self RNA during RIG-I mediated autoimmunity. In Nature communications, 9, 5366. doi:10.1038/s41467-018-07780-z. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30560918/
4. Sandow, Jarrod J, Tan, Iris Kl, Huang, Alan S, Webb, Andrew I, Dewson, Grant. 2021. Dynamic reconfiguration of pro-apoptotic BAK on membranes. In The EMBO journal, 40, e107237. doi:10.15252/embj.2020107237. https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34523147/